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时间:2018-10-22
《人参中苯甲酸胁迫响应基因wrky7的克隆与表达分析》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在学术论文-天天文库。
1、人参中苯甲酸胁迫响应基因WRKY7的克隆与表达分析 [摘要]WRKY转录因子是高等植物中最重要的转录因子基因家族之一,其在植物形态建成、生长发育以及应对生物(病菌、害虫等)、非生物(干旱、盐、冷、热等)胁迫过程中发挥重要作用。该研究根据人参化感自毒物质苯甲酸诱导的人参转录组数据,设计全长扩增引物,利用RTPCR方法获得1条编码WRKY转录因子的基因,暂命名为WRKY7,并对其进行TA克隆、测序和序列分析。该基因cDNA全长1216bp,其开放阅读框(openreadingframe,ORF)为1014bp,编码337个氨基酸。序列分析及系统进化
2、分析表明,该蛋白属于WRKY家族第Ⅲ类成员,与西洋参种的WRKY6转录因子亲缘关系最近,同源性为87%。实时荧光定量PCR分析发现,苯甲酸胁迫后WRKY7的表达量显著升高,推测该基因可能参与了人参响应苯甲酸胁迫的过程,为进一步研究人参自毒胁迫响应的分子机制奠定了基础。 [关键词]人参;WRKY转录因子;化感自毒作用;克隆;序列分析 [Abstract]WRKYtranscriptionfactorisoneofthemostimportanttranscriptionfactorfamilieswidelyexistinginhigherpl
3、ants,whichplayingcriticalroleinplantmorphogenesis,development,biotic(includingphytopathogens,pestsetc.)andabiotic(drought,salt,chilling,hightemperature,etc.)stress.Inthepresentwork,primersusedtoamplifyfulllengthgeneencodingWRKYtranscriptionfactorweredesignedbasedonthetranscri
4、ptomedataofP.ginsengthatinducedbybenzoicacid,oneofthemostimportantautotoxinsidentifiedfromrootexudatesandrhizospheresoilofP.ginseng.Then,aWRKYgene,temporarilynamedasWRKY7,wasconfirmedbyRTRCR.Furthermore,sequencingandsequenceanalysisofWRKY7wasconducted.Resultsindicatedthat,the
5、fulllengthcDNAofWRKY7was1216bp,theopenreadingframe(ORF)ofwhichwas1014bp,encodes337aminoacids.Homologousanalysisandphylogenetictreeshowedthat,WRKY7belongedtotheⅢcategoryofWRKYfamilies,whichshowing87%similaritytoWRKY6inP.quinquefolius.RealtimePCRresultsshowedthattheexpressionof
6、WRKY7inP.ginsenginducedbybenzoicacidwasupregulatedmarkedlythanthecontrol,sowespeculatedthatWRKY7wasinvolvedintheresponsetobenzoicacidstress,whichwillbehelpfulforfurtherresearchonthemolecularmechanismofginsengplantresponsetobenzoicacidstress. [Keywords]Panaxginseng;WRKYtransc
7、riptionfactors;autotoxicity;cloning;bioinformaticanalysis ?D录因子是一类含有DNA结合域的蛋白质,能识别基因上游特异的核苷酸序列,形成转录复合体从而激活或抑制靶基因的表达,WRKY是植物十大转录因子家族之一。这类转录因子最早发现于甘薯[1],后相继从20余种植物中分离出WRKY转录因子[2]。WRKY蛋白的共同特点是含有60个氨基酸组成的WRKY结构域,在N端有一段高度保守的WRKYGQK多肽序列,其是WRKY结构域的核心,如果上述氨基酸发生变异,将直接影响WRKY转录因子的DNA结合
8、活性[3]。根据WRKY转录因子结构域的数量和锌指结构,可将WRKY转录因子分为3类[4]:第Ⅰ类含有2个WRKY结构域,其锌指结构为C
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