结直肠癌单核苷酸多态性研究进展

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1、【摘要】结直肠癌作为一类比较常见的消化系统疾病越来越受到医生重视，本文总结结直肠癌单核苷酸多态性的研究进展，为以后的工作明确研究方向，但是鉴于人体基因的复杂性，其研究技术也日新月异，目前得到广泛认可应用的是高通量基因分型技术，但是还需要针对每种技术的局限性进行深入研究。【关键词】结直肠癌；单核苷酸多态性中图分类号R574.6文献标识码A文章编号1674-6805(2015)13-0158-03doi：10.14033/j.cnki.cfmr.2015.13.079结直肠癌(colorectalcancer，CRC)作为一类消化系统疾病，严重危害人类的健康状况。有一项2008年的研宄表明，

2、结直肠癌新发病例达120万以上，其中死亡病例约占49%［1］。与2002年全球统计数字比较，结直肠癌发病例数攀升，在男性中已超越胃癌位列第3位，女性中超越宫颈癌位列第2位。由于采取了有效的结直肠癌的筛?耍?美国、加拿大、澳大利亚等发达国家的发病率呈下降或稳定趋势［2］。随着人类基因组计划(HumanGenomeProject,HGP)和基因组单倍体图谱计划(InternationalHumanHapMapProject)的完成和实施，以及高通量基因分型技术的快速发展，关于疾病遗传基因方面的研究日益完善［3］。1996年Lander正式指出单核苷酸多态性(singlenucleotidep

3、olymorphism,SNP)开启了新的分子标记时代［4］。SNP数量多、分布广，利于快速、大范围筛查。对其进行全面深入的研宄将有助于揭示复杂疾病的遗传机制、疾病病因、基因与药物代谢和敏感性的关系、基因与环境的相互作用等，锁定高发人群，做好预防工作，早期诊断和治疗。本文主要目的就是系统总结SNP的研究进展，为以后的工作明确研宄方向。1SNP的研宄进展1.1SNP概述SNP主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性，属于人类可遗传变异中最常见的一种，占90%以上。通常引起SNP的原因有两个：一是单个基因的转换，一个嘧啶被另一个嘧啶，或者一个嘌呤被另一个嘌呤所替代；另

4、一个是颠换，嘌呤和嘧啶之间的变换。转换与颠换之比约为2:1:且以C->T最为多见。SNP大量存在于人类基因组，可出现在基因序列的不同部位，虽然编码区的变异率很低，但对疾病的研宄最有意义［5］。编码区的SNP(codingSNP,cSNP)分为两类，包括同义cSNP(synonymouscSNP)以及非同义cSNP(non-synonymouscSNP),目前对cSNP的研宄备受关注。1.2SNP研宄方法SNP的研宄方法日益完善，目前最受关注的是大规模全基因组关联分析(Genome-wideAssociationStudy,GWAS)。GWAS指的是对个体中能发现的SNP应用高通量基因芯片

5、技术进行分析，找到与疾病有关的位点，重点研究分析验证，其特点为大样本的人群、全基因组［6］。从2005年起，研宄者陆续报道了视网膜黄斑、冠心病、风湿性关节炎、克罗恩病、糖尿病、乳腺癌、结直肠癌、前列腺癌、自闭症等几十种疾病的关联分析结果，均取得重大进步R-10］。其中，SNP检测分析方法，传统方法有单链构象多态性、限制性酶切片段长度多态性、等位基因特异性杂交等等.这些传统方法虽广泛应用过，但不可避免的存在局限性，过分依赖于凝胶电泳技术，准确率不高，操作繁琐，对象比较局限等［11-12］。要想在SNP的研究上取得更大进展，这些缺点均需要克服。另外，高通量SNP检测技术有基因芯片、多元焦磷酸

6、测序进行SNP的鉴别［13］。Taqman探针技术有同时应用杂交和荧光检测技术，在PCR技术中对同一目的SNP位点设计两端分别标记有报告荧光集团和淬灭荧光集团的两对探针，若探针完整，则报告焚光集团所发出的焚光信息会被淬灭荧光集团吸收，最后应用荧光检测技术检测荧光信息来进行基因分型。该技术虽然操作灵活，但是针对的对象目的SNP位点相对局限，无法发现未知的SNP位点。而且随着操作对象的复杂性增加，相对的准确率却下降［14］。质谱法(Massspectrometry)。在应用PCR技术扩增后的目标DNA上进行延伸，该处所需的引物在5’端加入了生物素，其目的为纯化延伸的DNA产物。把产物和芯片基

7、质相结合，并通过质谱仪作用，产生有不同飞行时间的单电荷离子，通过复杂分析后确定SNP分型［15］。该技术无需杂交，操作简单，准确度高，速度快，但其难点在于加强分离纯化操作技术。2结直肠癌SNP研宄进展2.1DNA修复基因多态性与结直肠癌关联在很多不利的危险因素作用下，人体容易发生基因突变等改变。此时需要做的就是修复突变的基因，预防基因异常改变。一些重要的DNA修复通路有：错配修复(mismatchrepair，MMR)、直接修复(d