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时间:2018-10-06
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1、v第七章细菌的分类与命名第七章细菌的分类与命名动植物林奈分类体系细菌细胞不同于动植物细胞前言第七章细菌的分类与命名第一节细菌分类地位一、分类地位细菌过去归属植物界,自1974年以来,划为原核生物。细菌作为另一个系统进行类别的原核生物,包括对动物和人具有致病作用的衣原体、立克次体、霉形体、螺旋体、放线菌等,此外还涉及蓝细菌、紫色光合细菌等。第七章细菌的分类与命名第一节细菌分类地位二、分类单元属种菌株具有共性的若干种的组合,应与其他属有明显的差异。不同属之间的16SrRnA序列有较大的差异,但尚未提出差异的量化
2、标准。是微生物学分类的最基本单元,种可认为是一群性质相似的菌株,它与其他菌株群体有明显差异。凡是16SrRNA序列同源性大于97%的两株细菌即可确定为同一种。是不同来源的某一种细菌的纯培养物。同一种细菌可以有许多菌株,其主要性状应完全相同,其次要性状可稍有差异。第七章细菌的分类与命名第二节细菌的命名一、俗名法二、学名法约定俗成的名字细菌的命名依据“国际细菌命名法规”的规定,学名用拉丁文,遵循“双名法”。所谓“双名法”就是每一种细菌的拉丁文名称由属名和种名两部分构成,属名第一个字母必须大写,其余均应小写,即使
3、科名是以人名或地名命名的,种名头一个字母也用小写。整个属名及种名在出版物中应排成斜体。第七章细菌的分类与命名第三节细菌分类鉴定的标准一、表型特征鉴定二、种系发生关系鉴定测定DNA中G+Cmol%核酸杂交法16sRNA寡聚核苷酸序列长期以来,细菌分类鉴定的主要依据是其表型特征,即形态、染色、培养、细胞壁结构、生理生化及抗原性的特征。第七章细菌的分类与命名第四节细菌分类的方法一、条目分类法长期以来,细菌分类采用传统的双歧检索条目分类法。此法首选要在细菌的各种性状中,选择一项或数项被认为是最主要的基本性质,作为分
4、类指征,在最高一级的分类等阶上将细菌分成若干类别;然后在这些类别中选择数项次要性状为指征,将细菌作次一等阶分类,依此类推,一直划分到种。第七章细菌的分类与命名第四节细菌分类的方法二、数值分类法原理是根据数值分析,借助电子计算机,将拟分类的细菌按其性状相似程度归类定位。第七章细菌的分类与命名第五节细菌的分类体系一、伯吉氏系统学手册二、原核生物三、国际系统与进化微生物学杂志四、国际著名的菌种保藏机构第七章细菌的分类与命名第六节细菌的鉴定一、分类培养一般只有纯培养的细菌才能进行鉴定。第七章细菌的分类与命名第六节细
5、菌的鉴定二、鉴定方法除按表型特征、DNA同源性或rRNA序列比较等方法鉴定细菌外,还有用其他方法,如测定细菌的脂肪酸组成,用气相-液相-质谱分析细菌的脂肪酸谱,每一种细菌的脂肪酸谱是恒定的,可重复性好,因此此法可用于细菌的鉴定或分类,往往结合常规方法参照应用。在有条件 的单位可用PCR技术检测鉴定细菌。第七章细菌的分类与命名第六节细菌的鉴定三、鉴定程序革兰氏阳性细菌球菌杆菌丝状及树枝状产生芽孢革兰氏阳性大杆菌无芽孢抗酸染色阳性抗酸染色阴性革兰氏阴性细菌球菌/球杆菌杆菌MZN染色阳性MZN染色阴性弧状杆菌丝状
6、菌中等大小杆菌螺旋状菌第六章细菌的分类与命名1、细菌的分类地位过去分类:植物界1974年后:原核生物原核生物:古细菌(Archaea):是一个独特的系统进化类别,产甲烷、极端耐盐、高度嗜热、细胞壁组成与细菌不同。细菌(Bacteria):衣原体、立克次氏体、霉形体、螺旋体、放线菌、蓝细菌、光合细菌等分类系统:纲、目、科、属、种属(Genus,genera):具有若干共性的种的组合,与其他属有明显的差异。种(Species):微生物分类的基本单元,是一群性质相似的菌株,与其他菌株群体有明显差异。菌株(Stra
7、in):是不同来源的某一种细菌的纯培养物。同一种细菌有许多菌株,其主要性状应完全相同。2、细菌的命名国际细菌命名法规(TheInternationalCodeofNomenclatureofBacteria)双名法:每一种细菌的拉丁名称由属名和种名二部分组成,属名第一个字母必须大写,其余均小写。如大肠杆菌的学名:Escherichiacoli,Ecoli。在现代细菌分类中,在属名和种名之后,还加上首次定名人(加括号)、现定名人和现名定名年份,用正体字。如大肠杆菌的学名:Escherichiacoli(Mig
8、ula)CastellanietChalmers1919,指Migula于1895年命名此菌为Bacilluscoli,Castellani及Chalmers于1919年改为现名。3、细菌的分类依据过去的细菌分类鉴定依据:形态、染色、培养、细胞壁结构、生理生化特点、抗原特性。现在研究细菌种系发生关系主要采用三种方法:测定DNA碱基(G+C)mol%核酸分子杂交(DNA-DNAhybridization)16SrR
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