ssr荧光标记毛细管电泳检测法在水稻dna指纹鉴定中的应用

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1、SSR荧光标记毛细管电泳检测法在水稻DNA指纹鉴定中的应用672 中国水稻科学(ChinJRiceSci),2011,25(6):672—676 http://www.rlcesc1.cn DOI:10.3969/j.issn.10017216.2011.06.016 SSR荧光标记毛细管电泳检测法在水稻DNA指纹鉴定中的应用 程本义夏俊辉龚俊义杨仕华 (中国水稻研究所,浙江杭州310006;通讯联系人,Email:yangshihua6308@163.corn) ApplicationofCa

2、pillaryE1ectrophoresisDetectionwithFluorescentSSRMarkersinRice DNAFingerprintIdentification CHENGBen—yi,XIAJun-hui,GONGJun-yi,YANGShi—hua (ChinaNationalRiceResearchInstitute,Hangzhou310006,China;Correspondingauthor,E-mail:ng”308@163.corn) CHENGBenyi,

3、XIAJunhui,G0NGJunyi,eta1.Applicationofcapillarye1ectrophoresisdetectionwithfluorescentSSR markersinriceDNAfingerprintidentification.ChinJRiceSci,2011,25(6):672—676. Abstract:With16hybridricemalesterilelines,restorerlinesandcombinationsasmaterials,aca

4、pillaryelectroph0resisdetec— tionmethodwithfluorescentSSRmarkersinricewasprimarilydeveloped.TheaccuratesizeofDNAfragmentcouldbedetec— tedbythecapillaryelectr0phoresisdetectionmethodwithfluorescentSSRmarkers.Thecapillaryelectr0phoresisdetectionhas the

5、advantagesofdataaccuracyandefficiencycomparedwithpolyacrylamidegelelectroDhoresisdetection.Itprovidesafeasi— bleandreliablemethodforriceDNAfingerprintidentification. Keywords:rice;fluorescentSSRmarker;capillarye1ectrophoresis;DNAfingerprintidentifica

6、tion 程本义,夏俊辉,龚俊义,等.SSR荧光标记毛细管电泳检测法在水稻品种DNA指纹鉴定中的应用.中国水稻科学, 2011,25(6):672—676. 摘要:以16个杂交水稻不育系,恢复系及组合为材料,初步建立了水稻品种SSR荧光标记毛细管电泳检测方法.与常规 凝胶电泳检测方法相比,荧光标记毛细管电泳检测方法可以读出目标DNA片段的准确大小,检测数据更为精确,检测效率更 高.常规凝胶电泳检测方法验证表明,利用SSR荧光标记毛细管电泳检测方法进行水稻品种DNA指纹鉴定,方法可行,结 果可靠.

7、 关键词:水稻;SSR荧光标记;毛细管电泳;DNA指纹鉴定 中图分类号:Q75文献标识码:A文章编号:1001—7216(2O11)06—0672—05 近年来,以SSR标记为基础的DNA指纹鉴定技术已趋 成熟,并广泛应用于水稻等农作物品种的特异性,一致性,真 实性及纯度鉴定].DNA提取,PCR扩增和产物分离是 DNA指纹鉴定中的三个关键环节,其中技术难度最大,最复 杂的环节是PCR扩增产物的分离.目前,在水稻中常用的 分离方法是聚丙烯酰胺凝胶电泳检测法,该方法不能读出目 标DNA片段的准确大

8、小,检测效率偏低,难以对大规模不同 批次品种DNA指纹鉴定数据进行有效整合和准确比较.因 此,要开展大规模的水稻品种DNA指纹鉴定,如全国水稻品 种DNA指纹数据库的构建,需要建立准确,高效且能直接读 出DNA片段大小的SSR标记检测新方法. 对于SSR荧光标记毛细管电泳检测方法,前人在小麦, 玉米等作物上进行了一些探索,研究结果表明,基于 DNA测序仪的SSR荧光标记毛细管电泳检测方法可以得到 定量的DNA片段分析数据,与常规的聚丙烯酰胺凝胶电泳 检测方法相比,毛细管电泳检测结果更为精确,灵敏

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