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1、SSR荧光标记毛细管电泳检测法在水稻DNA指纹鉴定中的应用672
中国水稻科学(ChinJRiceSci),2011,25(6):672—676
http://www.rlcesc1.cn
DOI:10.3969/j.issn.10017216.2011.06.016
SSR荧光标记毛细管电泳检测法在水稻DNA指纹鉴定中的应用
程本义夏俊辉龚俊义杨仕华
(中国水稻研究所,浙江杭州310006;通讯联系人,Email:yangshihua6308@163.corn)
ApplicationofCa
2、pillaryE1ectrophoresisDetectionwithFluorescentSSRMarkersinRice
DNAFingerprintIdentification
CHENGBen—yi,XIAJun-hui,GONGJun-yi,YANGShi—hua
(ChinaNationalRiceResearchInstitute,Hangzhou310006,China;Correspondingauthor,E-mail:ng”308@163.corn)
CHENGBenyi,
3、XIAJunhui,G0NGJunyi,eta1.Applicationofcapillarye1ectrophoresisdetectionwithfluorescentSSR
markersinriceDNAfingerprintidentification.ChinJRiceSci,2011,25(6):672—676.
Abstract:With16hybridricemalesterilelines,restorerlinesandcombinationsasmaterials,aca
4、pillaryelectroph0resisdetec—
tionmethodwithfluorescentSSRmarkersinricewasprimarilydeveloped.TheaccuratesizeofDNAfragmentcouldbedetec—
tedbythecapillaryelectr0phoresisdetectionmethodwithfluorescentSSRmarkers.Thecapillaryelectr0phoresisdetectionhas
the
5、advantagesofdataaccuracyandefficiencycomparedwithpolyacrylamidegelelectroDhoresisdetection.Itprovidesafeasi—
bleandreliablemethodforriceDNAfingerprintidentification.
Keywords:rice;fluorescentSSRmarker;capillarye1ectrophoresis;DNAfingerprintidentifica
6、tion
程本义,夏俊辉,龚俊义,等.SSR荧光标记毛细管电泳检测法在水稻品种DNA指纹鉴定中的应用.中国水稻科学,
2011,25(6):672—676.
摘要:以16个杂交水稻不育系,恢复系及组合为材料,初步建立了水稻品种SSR荧光标记毛细管电泳检测方法.与常规
凝胶电泳检测方法相比,荧光标记毛细管电泳检测方法可以读出目标DNA片段的准确大小,检测数据更为精确,检测效率更
高.常规凝胶电泳检测方法验证表明,利用SSR荧光标记毛细管电泳检测方法进行水稻品种DNA指纹鉴定,方法可行,结
果可靠.
7、
关键词:水稻;SSR荧光标记;毛细管电泳;DNA指纹鉴定
中图分类号:Q75文献标识码:A文章编号:1001—7216(2O11)06—0672—05
近年来,以SSR标记为基础的DNA指纹鉴定技术已趋
成熟,并广泛应用于水稻等农作物品种的特异性,一致性,真
实性及纯度鉴定].DNA提取,PCR扩增和产物分离是
DNA指纹鉴定中的三个关键环节,其中技术难度最大,最复
杂的环节是PCR扩增产物的分离.目前,在水稻中常用的
分离方法是聚丙烯酰胺凝胶电泳检测法,该方法不能读出目
标DNA片段的准确大
8、小,检测效率偏低,难以对大规模不同
批次品种DNA指纹鉴定数据进行有效整合和准确比较.因
此,要开展大规模的水稻品种DNA指纹鉴定,如全国水稻品
种DNA指纹数据库的构建,需要建立准确,高效且能直接读
出DNA片段大小的SSR标记检测新方法.
对于SSR荧光标记毛细管电泳检测方法,前人在小麦,
玉米等作物上进行了一些探索,研究结果表明,基于
DNA测序仪的SSR荧光标记毛细管电泳检测方法可以得到
定量的DNA片段分析数据,与常规的聚丙烯酰胺凝胶电泳
检测方法相比,毛细管电泳检测结果更为精确,灵敏
