全外显子组捕获测序技术在单基因遗传病研究和诊断中的意义

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1、------------------------------------------------------------------------------------------------全外显子组捕获测序技术在单基因遗传病研究和诊断中的意义中国优生与遗传杂志2012年第20卷第6期·1·全外显子组捕获测序技术在单基因遗传病研究和诊断中的意义1，222柯海萍，杜振方，张咸宁（1.宁波天一职业技术学院，宁波315100；2.浙江大学医学部生化与遗传学系，杭州310058）要：外显子组（exome）即一个个

2、体的基因组DNA上所有蛋白质编码序列（外显子）的总和。人类外显子组序列仅占人类整个基因组序列的1%，约为30Mb，包括18万个左右的外显子，估计85%的人类致病突变都位于这1%的蛋白摘质编码序列上。在单基因病的致病基因定位和克隆研究中，通常采用的家系连锁分析法及定位克隆技术是最有效、最准确的方法之一。但是，如果患病亲属的人数有限，或不外显、外显不全，或基因突变是自发产生的，则连锁分析多半失效。。然而，对各种遗传病患者的外显子组进行测序分析，所针对这是单基因疾病分子遗传学研究中常常难以克服的“瓶颈”的是与疾病

3、最相关的“蛋白质编码序列”区域，捕捉的是疾病的——————————————————————————————————————------------------------------------------------------------------------------------------------大部分致病突变信息，具有所需样本数量少、低费用、高通量的优势和特点，故可以大大加快鉴定人类疾病基因的进程。另外，对于外显子数目庞大的致病基因（如DMD、FBN1、PKD1等），用全外显子组测序技术进

4、行基因诊断，则比传统的PCR+Sanger测序法更为经济。关键词：外显子组；全外显子组测序；单基因病；基因诊断中图分类号：R394.3文献标识码：A文章编号：1006－9534（2012）06－0001－042Wholeexomesequencingintheresearchesanddiagnosisofmonogenicdisorders．KEHai－ping1，，DUZhen－fang2，ZHANGXian－ning2．（1．NingboCollegeofHealthSciencesNingbo315

5、100，2．DepartmentofBiochemistryandGenetics，ZhejiangU-niversitySchoolofMedicine，Hangzhou310058）Abstract：Exomeisthecollectionofallexons，i．e．theprotein－codingsequencing，withinthegenomicDNAofanindividual．Exomeconstitutesaround1%oftheentirehumangenomeor30megabas

6、es（Mb），splitacrossapproximately180000exons．Itesti-matedthatabout85%variantslocatedontheseprotein－codingregions．Traditionally，thefamilylinkageanalysisandpositionalclo-ningmethodsareusedtoidentifythedisease－causinggeneforMendeliandisorders．However，—————————

7、—————————————————————————————------------------------------------------------------------------------------------------------becauseofthedifficultyincollectionofanadequatenumberofaffectedindividualsandfamiliesforastatisticallypowerfulstudy，orincomplete/non

8、－penetranceofthedis-ease，ordenovomutationsforsporadiccases，theseapproachesarenotapplicable．Thus，thewholeexome－capturesequencing（WES）representsacost－effective，reproducibleandrobuststrategyforthesensitiveandspe