人肌红蛋白基因外显子一的生物信息学分析

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1、人肌红蛋白基因外显子一的生物信息学分析一．Introduction：Myoglobin,thearticleiscomposedofapeptidechainsandabindingproteinofhemeprostheticgroup,iswithinthemuscleoxygenstorageprotein,itsoxygensaturationoftheellipticcurve.Myoglobinisthemainproteinofskeletalmuscleandcardiacmuscle,whenmuscledamage,leakagetothecirculatin

2、ginthebloodinmuscletissue,increasetheserumconcentrationofmyoglobin,theindexisusedtodeterminewhethermuscledamage.二．Purpose：对人肌红蛋白基因外显子一基因序列使用“Bioedit和DNAMAN、anthe5.0”及相关网站进行GC含量统计、电子酶切、引物设计、基因在人类基因组中的定位、电子克隆及蛋白在细胞内的定位、氨基酸组成统计、分子量、等电点、亲疏水性、信号肽分析（跨膜区域）、二级结构（含保守结构域）及三维结构分析，miR分析，启动子分析等。其中抗原表位分析、多

3、序列比对和进化分析等。三．Thenatureandfunctionofmyoglobin：Nature:myoglobin=apolypeptidechain+aprostheticgrouppolypeptidechain,composedof153aminoacidresiduesProstheticgroup:hemeprostheticgroupMolecularweight:16,700Function:transportofoxygenandoxygenstoragefunctioninmuscletertiarystructureofmyoglobin一．Keywo

4、rd:肌红蛋白（myoglobin）五．Implementsandmethods：采用Bioedit和DNAMAN分析软件工具和在线有关蛋白质和核酸方面的分析软件，分别进行核酸和蛋白质两个方面的分析。核酸分析首先从pubmed核酸数据库中搜索到人的Myoglobin核酸序列，分别进行序列的基本性质分析，限制性酶谱分析及其基因在染色体上的定位分析。具体操作方法将根据上述各个软件上“Help”文件进行，基因在染色体上的定位分析根据网页上的操作说明进行。从pubmed蛋白质数据库中搜索到人的Myoglobin和整个前体Myoglobin蛋白质序列，分别进行蛋白序列的基本性质分析（氨基酸

5、组成、分子量、等电点），亲疏水性分析，蛋白酶切位点分析，信号肽序列分析，二级结构和三维结构分析，同源序列和进化分析。二级结构分析包括结构功能域、Motif、保守位点等，具体操作方法将根据上述各个软件上“Help”文件和网页上的操作说明进行。Resluts:1.从NCBI中可以得到一下有关Myoglobi蛋白分子的信息：Human myoglobin gene,exon1GenBank:M10090.1LOCUSHUMMGI12552bpDNAlinearPRI07-JAN-1995DEFINITIONHumanmyoglobingene,exon1.ACCESSIONM10090

6、VERSIONM10090.1GI:187580KEYWORDSFokfamilyrepetitivesequence;directrepeat;myoglobin;repeatregion;tandemrepeat.SEGMENT1of3SOURCEHomosapiens(human)ORGANISMHomosapiensEukaryota;Metazoa;Chordata;Craniata;Vertebrata;Euteleostomi;Mammalia;Eutheria;Euarchontoglires;Primates;Haplorrhini;Catarrhini;Hom

7、inidae;Homo.REFERENCE1(bases1to2552)AUTHORSAkaboshi,E.TITLECloningofthehumanmyoglobingeneJOURNALGene33(3),241-249(1985)PUBMED2989088COMMENTOriginalsourcetext:Human:fetalliverDNA(libraryofLawnetal.),clonelambda-HMB151;delta-thalassemialeukocyt