E2A-PBX1融合基因阳性的儿童急性淋巴细胞白血病携带变异型融合转录本.doc

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1、E2A-PBX1融合基因阳性的儿童急性淋巴细胞白血病携带变异型融合转录本作者：李志刚，赵玮，吴敏媛，胡亚美【摘要】为了研究儿童急性淋巴细胞白血病（ALL）中E2A-PBX1融合基因的表达，采用位于E2A基因不同位置的上游引物与下游PBX1引物，检测了410例儿童ALL，包括362例B细胞ALL和48例T细胞ALL。结果发现：17例患儿携带E2A-PBX1融合基因，检出率4.1%，且全部为B细胞ALL，而且所有阳性病例均表达一种变异型融合转录本，后者是由E2A基因的第13外显子（159bp）被差异剪切形成的。经BLASTn比对分析，这种转录本

2、保持了原来的开放阅读框，但导致53个氨基酸残基的丢失。这53个氨基酸残基位于活化区2，会导致融合蛋白中部分环-螺旋结构以及全部七聚体亮氨酸重复序列的丢失。结论：携带E2A-PBX1融合基因的儿童ALL表达典型和变异型2种融合转录本，后者是由E2A基因第13外显子被差异剪切而形成的，它将导致融合蛋白中53个氨基酸残基及其所构成的部分环-螺旋结构以及全部七聚体亮氨酸重复序列的丢失。【关键词】急性淋巴细胞白血病　　VariantFusionTranscriptinALLChildrenwithE2A-PBX1FusionGenePositive　

3、　AbstractThestudywasaimedtoinvestigatetheexpressionofE2A-PBX1fusiongeneinchildrenwithacutelymphoblasticleukemia(ALL).TheprimerslocatedatdifferentsitesofE2AandPBX1genewereusedtoscreenforthefusiongenein410childrenwithALL，including362casesofBcellALLand48casesofTcellALL.Theres

4、ultsshowedthat17childrencarriedthefusiongene.Thepositiveratewas4.1%.Furthermore，allthepositivecasesexpressedavarianttypeoffusiontranscript.Itresultedfromdifferentsplicingofthe13thexon(159bp)ofE2Agene.AnalyseswithBLASTnindicatedthatthevarianttypeoftranscriptretainedtheopenr

5、eadingframe.However，thelossof53aminoacidresidueswhichwerelocatedatthe2ndactivationdomainresultedinthepartialdeletionoftheputativeloop-helix(LH)structureaswellasthecompletedeletionoftheheptadleucinerepeat.ItisconcludedthatallthechildrenwithALLpositivefortheE2A-PBX1fusiongen

6、eexpresstypicalandvariantfusiontranscripts.Thelatterresultedfromdifferentsplicingofthe13thexon(159bp)ofE2Agene.Thelossof53aawouldleadtothepartialdeletionoftheputativeloop-helix(LH)structureaswellasthecompletedeletionofthe6heptadleucinerepeat.　　KeywordsALL;E2A-PBX1fusiongen

7、e;varianttypeoffusiontranscript;2ndactivationdomaint(1;19)(q23;p13.3)易位及其形成的E2A-PBX1融合基因是急性淋巴细胞白血病（ALL）中常见的染色体畸变及基因异常，大约5%的儿童［1-3］和3.3%的成人［4］ALL携带这种异常染色体。早期的研究认为，t(1;19)易位与治疗早期的复发相关，更为强烈的化疗能够抵消这种效应［1，2］。最近的研究证明，治疗方案的改进已使携带t(1;19)易位的儿童ALL预后极大改善，5年无白血病活存率已达89.5%［5］。在本研究中，我们利

8、用两套PCR引物，研究了儿童ALL的E2A-PBX1融合基因表达。发现所有携带E2A-PBX1融合基因的患儿除具有典型融合转录本外，全部携带一种变异型融合转录本。　　材料和方法