hbv相关性hcc患者癌组织与癌旁组织的蛋白质组差异分析

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1、HBV相关性HCC患者癌组织与癌旁组织的蛋白质组差异分析作者：林英姿，陈仁，杨文,李翠【摘要】　　目的:应用双向凝胶电泳和质谱技术分析HBV相关性HCC癌组织与非癌肝组织蛋白质组之间的差异，鉴定肝组织蛋白质组中与HBV相关性HCC癌变相关的蛋白.方法:收集HBV相关性HCC患者手术切除的癌组织和癌周组织标本，固相pH梯度2DE，凝胶银染、扫描图像、ImageMaster2DEElite4.01软件分析差异表达的蛋白质；应用质谱仪得到相应的肽质指纹图谱(PMF)，联网到ExPASY服务器查询相关数据库鉴定获得的差异蛋白质点.结果:

2、癌组织、肝硬化组织和慢性肝炎组织平均每张蛋白斑点数为(1281±51),(1188±41)和(1235±31)个，重复性分析发现在等电聚焦（IEF）方向上平均偏差为（2.47±0.25）mm，在垂直板SDSPAGE电泳方向上的平均位置偏差为（2.86±0.31）mm.47个差异蛋白质点经质谱分析获得28张PMF，初步鉴定了其中的17张PMF.结论：HBV相关性HCC的癌组织、肝硬化组织、慢性肝炎组织蛋白质组之间存在较明显的差异，鉴定出的差异蛋白质可能有助于研究HBV相关性HCC.【关键词】乙型肝炎病毒；肝细胞癌；肝组织；蛋白质组；

3、双向电泳；质谱12　　DifferentialproteomicanalysisofhepatictissuesinHBVrelatedhepatocellularcarcinomapatients【Abstract】AIM:ToexploredifferentialproteomebetweencanceroustissueandpericanceroustissueinhepatitisBvirus(HBV)infectionrelatedhepatocellularcarcinoma(HCC)usingtwodimensio

4、nalpolyacrylamidegelelectrophoresis(2DE)andmatrixassociatedlaserdesorption/ionizationtimeofflightmassspectrometry(MALDITOFMS)andtoidentifytheproteinsrelatedtolivercarcinogenesis.METHODS:Hepatictissuespecimenswereobtainedfrom18patientswithHCCundergoingpartialhepate

5、ctomy.TotalproteinswereseparatedbyimmobilizedpHgradient(IPG)based2DE.Aftersilverstaining,thegelimageswereacquiredbyimagescannerandthenanalyzedwithImageMaster2DEElite4.01software.Peptidemassfingerprint(PMF)ofdifferentialproteinspotswasobtainedwithMALDTOTMS.Then,t

6、hePMFweresearchedinSWISSPROT/TrEMBLdatabasewiththePeptIdentsoft.RESULTS:Accordingto2DEmaps,theaveragenumbersofproteinspotswere(1281±51),(1188±41)and(1235±31)incancerous,cirrhotictissuesandchronichepatitistissues.Theaverage12positiondeviationofmatchedspotswas(2.47±0.2

7、5)mminIEFdirectionand(2.86±0.31)mminSDSPAGEdirection.Fortysevendifferentialproteinspotswereincisedfrom2DEgelsand28PMFmapswereobtainedbyMALDITOFMS.ThePMFmapsweresearchedintheSWISSPROT/TrEMBLdatabasebyPeptIdentsoftware,and17proteinswerepreliminarilyidentified.CONCL

8、USION:Therearesignificantproteomedifferencesamongchronichepatitis，cirrhoticandcanceroustissues．Theproteinsidentifiedi