HBV相关性HCC患者癌组织与癌旁组织的蛋白质组差异分析.doc

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1、HBV相关性HCC患者癌组织与癌旁组织的蛋白质组差异分析作者：林英姿，陈仁，杨文,李翠【摘要】　　目的:应用双向凝胶电泳和质谱技术分析HBV相关性HCC癌组织与非癌肝组织蛋白质组之间的差异，鉴定肝组织蛋白质组中与HBV相关性HCC癌变相关的蛋白.方法:收集HBV相关性HCC患者手术切除的癌组织和癌周组织标本，固相pH梯度2DE，凝胶银染、扫描图像、ImageMaster2DEElite4.01软件分析差异表达的蛋白质；应用质谱仪得到相应的肽质指纹图谱(PMF)，联网到ExPASY服务器查询相关数据库鉴定获得

2、的差异蛋白质点.结果:癌组织、肝硬化组织和慢性肝炎组织平均每张蛋白斑点数为(1281±51),(1188±41)和(1235±31)个，重复性分析发现在等电聚焦（IEF）方向上平均偏差为（2.47±0.25）mm，在垂直板SDSPAGE电泳方向上的平均位置偏差为（2.86±0.31）mm.47个差异蛋白质点经质谱分析获得28张PMF，初步鉴定了其中的17张PMF.结论：HBV相关性HCC的癌组织、肝硬化组织、慢性肝炎组织蛋白质组之间存在较明显的差异，鉴定出的差异蛋白质可能有助于研究HBV相关性HCC.【关键词

3、】乙型肝炎病毒；肝细胞癌；肝组织；蛋白质组；双向电泳；质谱　　DifferentialproteomicanalysisofhepatictissuesinHBVrelatedhepatocellularcarcinomapatients【Abstract】AIM:ToexploredifferentialproteomebetweencanceroustissueandpericanceroustissueinhepatitisBvirus(HBV)infectionrelatedhepatocellular

4、carcinoma(HCC)usingtwodimensionalpolyacrylamidegelelectrophoresis(2DE)andmatrixassociatedlaserdesorption/ionizationtimeofflightmassspectrometry(MALDITOFMS)andtoidentifytheproteinsrelatedtolivercarcinogenesis.METHODS:Hepatictissuespecimenswereobtainedfr

5、om18patientswithHCCundergoingpartialhepatectomy.TotalproteinswereseparatedbyimmobilizedpHgradient(IPG)based2DE.Aftersilverstaining,thegelimageswereacquiredbyimagescannerandthenanalyzedwithImageMaster2DEElite4.01software.Peptidemassfingerprint(PMF)ofdiff

6、erentialproteinspotswasobtainedwithMALDTOTMS.Then,thePMFweresearchedinSWISSPROT/TrEMBLdatabasewiththePeptIdentsoft.RESULTS:Accordingto2DEmaps,theaveragenumbersofproteinspotswere(1281±51),(1188±41)and(1235±31)incancerous,cirrhotictissuesandchronichepatiti

7、stissues.Theaveragepositiondeviationofmatchedspotswas(2.47±0.25)mminIEFdirectionand(2.86±0.31)mminSDSPAGEdirection.Fortysevendifferentialproteinspotswere5incisedfrom2DEgelsand28PMFmapswereobtainedbyMALDITOFMS.ThePMFmapsweresearchedintheSWISSPROT/TrEMBL

8、databasebyPeptIdentsoftware,and17proteinswerepreliminarilyidentified.CONCLUSION:Therearesignificantproteomedifferencesamongchronichepatitis，cirrhoticandcanceroustissues．Theproteinsidentifiedinth