dna琼脂糖凝胶电泳原理

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1、琼脂糖凝胶电泳进行DNA/RNA定量原理DNA(RNA)定量分析可用紫外光谱分析,原理是DNA(RNA)分子在260nm处有特异的紫外吸收峰,且吸收强度与DNA(RNA)的浓度成正比。此外,还可通过琼脂糖凝胶电泳上显示的DNA(RNA)带的亮度来分析,因为EB作为一种荧光染料,能插入DNA(RNA)的碱基对平面之间而结合于其上,在紫外光的激发下产生荧光,DNA(RNA)分子上EB的量与DNA分子的长度和数量成正比。在电泳时加入已知浓度的DNA(RNA)Marker作为DNA(RNA)分子量及浓度的参考,样品DNA(RNA)的荧光强度

2、就可以大致表示DNA(RNA)量的多少。这种方法的优点是简便易行,可结合琼脂糖凝胶电泳分析DNA(RNA)样品的完整性来进行,缺点是不太准。琼脂糖凝胶的配制  根据所需凝胶的浓度秤取琼脂糖,加入相应电泳缓冲液中,用微波炉加热煮沸至琼脂糖完全溶解,加入适量 EB 混匀,适当冷却后倾入凝胶铸槽中,插入梳子,凝胶厚度不超过梳孔,如有气泡产生则用玻璃棒驱除,不能过早拔除梳子,应待凝胶完全凝结后才能拔除梳子。3.P1、P2、P3的配制P1 的配制:在 800ml 去离子水中溶入 Tris 碱 6.06g,Na2EDTA?2H2O 3.72g,

3、用 HCl 调整 pH 至 8.0,用去离子水调整容积至1升,每升P1内加入RNaseA100mg。P2 的配制:在 950ml 去离子水中溶入 NaOH 8.0g,20%SDS 50ml,调整容积至 1 升。P3 的配制:在 500ml 去离子水中溶入醋酸钾 294.5g,用冰醋酸调整 pH 值至 5.5,用去离子水调整容积至1升。4.常用缓冲液:TEpH 7.410mmol/LTris?Cl (pH7.4)1mmol/L EDTA(pH8.0)pH 7.610mmol/LTris?Cl (pH7.6)1mmol/L EDTA(p

4、H8.0)pH 8.010mmol/LTris?Cl (pH8.0)1mmol/L EDTA(pH8.0)STE(亦称 TEN)0.1mmol/L NaCl10mmol/LTris?Cl (pH8.0)1mmol/L EDTA(pH8.0)STET0.1mmol/L NaCl10mmol/LTris?Cl (pH8.0)1mmol/L EDTA(pH8.0)5%Triton X-100TNT10mmol/LTris?Cl (pH8.0)150mmol/L NaCl0.05% Tween 20电泳缓冲液Tris-乙酸(TAE):50×

5、浓贮存液(每升):242g Tris 碱5   7.1ml 冰乙酸100ml 0.5mmol/L EDTA(pH8.0)使用时再稀释50倍。Tris-磷酸(TPE):10×浓贮存液(每升):108g Tris 碱15.5ml 85%磷酸(1.679g /ml)40ml 0.5mmol/L EDTA(pH8.0)使用时再稀释10倍。Tris-硼酸(TBE):5×浓贮存液(每升):54g Tris 碱27.5g 硼酸20ml 0.5mmol/L EDTA(pH8.0)使用时再稀释10倍。碱性缓冲液:1×使用液(每升):5ml10mol/

6、L NaOH2ml 0.5mmol/L EDTA(pH8.0)Tris-甘氨酸:5×浓贮存液(每升):15.1g Tris 碱94g 甘氨酸(电泳级)(pH8.3)50ml 10%SDS(电泳级)2×SDS 凝胶加样缓冲液100mmol/L Tris?HCl(pH6.8)200mmol/L 二硫苏糖醇(DTT)4%SDS(电泳级)0.2%溴酚蓝20%甘油30%丙烯酰胺:将29g 丙烯酰胺和1gN,N’-亚甲双丙烯酰胺溶于总体积为60ml的水中,加热至37℃溶解之,补加水至终体积为100ml。用Nalgene滤器(0.45孔径)过滤除

7、菌查证该溶液的pH值应不大于7.0,置棕色瓶中保存于室温。10mol/L 乙酸铵:把770g 乙酸铵溶解于800ml水中,加水定容至1L后过滤除菌。1mol/LCaCl2:在200ml纯水中(Milli-Q水或相当级别的水)溶解54gCaCl2?6H2O,用0.22滤器过滤除菌,分装成10ml小份贮存于-20℃。2.5mol/LCaCl2:在20ml蒸馏水中溶解13.5gCaCl2?6H2O,用0.22滤器过滤除菌,分装成1ml小份贮存于-20℃。1mol/L 二硫苏糖醇(DTT):用20ml0.01mol/L乙酸钠溶液(pH5.2

8、)溶解3.09gDTT,过滤除菌后分装成1ml小份贮存于-20℃。0.5mol/LEDTA(pH8.0):在 800ml 水中加入 186.1g 二水乙二胺四乙酸二钠(EDTA-Na?H2O),在磁力搅拌器上剧烈搅拌,用NaOH调节溶

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