猪繁殖与呼吸综合征病毒nsp10基因的克隆及序列分析

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1、猪繁殖与呼吸综合征病毒Nsp10基因的克隆及序列分析10HeilongjiangAnimalScienceandVeterinaryMedicine№102009猪繁殖与呼吸综合征病毒Nspl0基因的克隆及序列分析周思旋,周碧君一,隆华.,朱时杰,文明,王开功'(1.贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025;2.贵州大学动物疫病研究所,贵州贵阳550025;3.贵州省畜牧兽医局,贵州贵阳550001)中图分类号:$852.659.6文献标识码:A文章编号:1004—7034(2009)10—0010—04关键词:猪繁殖与呼吸综合征病毒;Nspl0基因;克隆;序列分析摘要:根据猪繁殖

2、与呼吸综合征病毒BJ一4序列,选择NsplO基因保守区域设计并合成特异性引物,用RT—PCR方法扩增出猪繁殖与呼吸综合征病毒贵州地方株(命名为JL株)Nspl0基因片段,克隆到pMD18一T载体并测序,应用DNASTAR,Clustal_1.81和Mega序列分析软件进行同源性比较.结果表明:贵州儿株Nspl0基因的cDNA长699bp,可编码233个氨基酸;贵州JL株Nspl0基因与早期分离毒株MLV株,BJ一4株,VR一2332株,CH一1a株,CH2002株和GS2004株相应序列的核苷酸同源性为91.7%~94.0%,氨基酸同源性为97.4%~98.7%;而与最近分离毒株HN

3、2007株,SX2007株,GD2007株,YN2008株,GS2008株,XL2008株,TJ株和JXA1株的核苷酸同源性为98.3%~98.6%,氨基酸同源性为99.6%~100%.CloningandsequenceanalysisofNspl0geneofPRRSVstrainZHOUSi—xuan,ZHOUBi—iun.L0NGHua,etal(1.CollegeofAnimalScience,GuizhouUniversity,Guiyang550025,China;2.InstituteofAnimalDisease,GuizhouUniversity,Guiyang5

4、50025,China;3.HusbandryandVeterinaryMedicineBureau,Guiyang550001,China)Keywords:Porcinereproductiveandrespiratorysyndromevirus;NsplOgene;clone;sequenceanalysisAbstract:ApairofspecificprimersofNspl0genewasdesignedaccordingtothegenesequenceofPRRSVBJ一4ofAmericanstandardstrain.Thespecificfragmentof

5、GuizhouisolatewasbeensuccessfullyamplifiedbyRT—PCRandsequencedafterbeingcloneddirectlyintothepMDl8一T.ThehomologyofNspl0nucleotideanddeducedaminoacidwerecomparedwithdifferentstrainswhichshownonGenBankbythesoft—waresofDNASTAR,Clustal一1.81andMega.ItWasshowedthatthecDNAofNsplOwas699bpanditshared91.

6、7%~94.0%ofnucleotidehomologyand97.4~98.7%ofaminoacidhomo-logywiththatofpristinestains(MLV,BJ一4,VR一2332,CH一1a,CH2002andGS2004),respectively.Anditshowed98.3%~98.6%ofnueleotideidentityand99.6%~100%ofaminoacididentitywiththatofrecentstrainsc(HN2007,SX2007,YN2~8,GD2007,TJandJXA1),respectively.猪繁殖与呼吸

7、综合征(Porcinereproductiveandrespiratorysyndrome,PRRS)是由猪繁殖与呼吸综合征病毒(PorcinereproductiveandrespiratorysyndromeVirus,PRRSV)引起猪的一种严重传染病,其临床特征为母猪流产,早产,产弱(死)胎等繁殖障碍,仔猪呈现呼吸困难,高死亡率和育肥猪呼吸道症状.该病收稿日期:2009一Ol一04;修回日期:2009—09—16基金项目:贵州省"十一五"农业科技攻

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