veracode adme core panel中文说明书

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1、VeraCodeADMECorePanel--比之前更快的研究与药物代谢相关联的药物遗传多样性强调1.标准化34个基因上的184个生物标记,覆盖超过95%的PharmaADMECoreList2.快速分型每次运行8小时,分析32个样本,只有2.5小时动手时间3.高质量数据具体分析化学过程和完整的质量控制保证≥99.5%的一致性和≥99.5%再现性简介对药物应答和分布相关联的遗传多样性的理解是个性化药物成为现实的关键一步。对每一个最近开发的潜在药物合成物来说,需对其进行研究和分析能显示吸收、分布、新陈代谢和排泄

2、(ADME)水平的生物标签。研究完成的越早,该药物越早被归类为可能的候选药物或者被放弃,产品授权的越快,开发的费用越少。为了帮助研究者在ADME研究中取得成功,Illumina介绍了VeraCodeADMECorePanel。VeraCodeADMECorePanel提供了最完整最重要的ADME内容。关注于PharmADMECorelist的标准化[1]和创新VeraCode技术[2]的影响力,该平板流线型药物新陈代谢生物标签的分析,使得这些研究进行的比以前更快。使用VeraCodeADMECorePanel

3、,研究者可以在一天这么短的时间分析ADME关键内容。此外,VeraCodeADMEPanel提供了若干内参来确保结果的准确可信。高价值信息由业界和学术界专家组成的PharmaADME工作组,已经研究出了一系列对药物遗传学药物研究相当标准的基因内容,包括被FDA规定认为有效的基因[3]。关注于该标准化的PharmaADMECore内容使的基因组复杂区域上的大部分生物学相关生物标签的覆盖率更为全面成为可能。该最优化的VeraCodeADMECorePanel覆盖了>95%精心挑选的标签,包括有效的药物应答DNA-

4、基础生物标签[3]、和模式药物相关基因以及实验生物标签(Table1)。此核心内容提供了研究和治疗物质相关的药物遗传学所必需内容。研究人员将能够为下一步安全性研究来确认和药物ADME相关的候选基因,提高他们对基因型特异的不同药物新陈代谢的理解来分析不同剂量的不同影响,并了解更多可能和药物应答有关的等位基因。精确分析复杂染色体区域ADME相关基因经常在复杂染色体区域发现,复杂染色体区域对于大多数基因分型研究技术的准确寻靶来说是有难度的。为了解决这一难题,VeraCodeADMECorePanel使用高度特异版本

5、的GoldenGateassay[9]。为了在剩下的基因组中找到特别感兴趣的区域,用单个引物构建一个单独的引物延伸步骤来避免潜在的基因组矛盾区域。这使得分析在其他方面和近亲有交叉反应性的同源基因组区域成为可能(Figure1)。为了进一步提高特异性,该步骤将在等位基因特异性引物的延伸和连接步骤之后进行。结果将提供最高质量的数据(Table2)。快速研究周期VeraCodeADMECorePanel操作过程中,复杂区域单独放到3个高度优化的反应池中。和开始的引物延伸步骤相结合,这将使基因组若干复杂区域快速和精确

6、地基因分型成为可能,包括三等位基因SNPs,极为靠近(closeproximity)、插入缺失(indels)、同源区域和拷贝数目异常SNPs。我们的技术能够轻易的在2.5小时动手时间内在一个工作台上一次分析32份样本(Figure2)。最多能同时运行2板(64份样本)。Table1:ADME核心基因(34个基因)VeraCodeADMECorePanel上的必需基因包括几个和模式药物相关的知名基因。比如,和某些抗抑郁药、抗精神病药物、美托洛尔之类的β-阻断剂、吗啡之类的鸦片类药物、他莫昔芬之类的癌症药物以及

7、与其他类药物的新陈代谢相关的CYP2D6基因[4-8],和抗血小板药品波立维新陈代谢有关的CYP2C19基因,CKORC1基因都是和华法林的敏感性有关的最有名的基因。VeraCodeADMECoreSNPList更详细的资料请联系你的账户管理员或者访问www.illumina.com/VeraCodeADMEFigure1高度特异基因分型研究CYP450家族包括四个靠近的相关基因:CYP2C18,CYP2C19,CYP2C9和CYP2C8。运用上前寻靶技术(upfronttargetingapproach),

8、能从基因组中得到感兴趣的特异基因,避免其他同源区域的干扰,并能通过出色的鉴别技术精确分析。Fugure2快速、简单工作流使用VeraCodeADMECorePanel,每次运行能够处理32个样本。在三个最佳化反应池中使用生物素引物混合液,引物延伸第一个循环就可以找到感兴趣区域。在磁性微粒上将产物分离出来准备在完成普通PCR扩增之后的等位基因特异延伸和连接。一个单独的板子用来将扩增产物转移到VeraC

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