p21,p27基因多态性对食管癌的发生及淋巴结转移的影响

p21,p27基因多态性对食管癌的发生及淋巴结转移的影响

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1、p21,p27基因多态性对食管癌的发生及淋巴结转移的影响【摘要】目的:探讨p21基因外显子3′非翻译区(UTR)第20碱基对的核苷酸多态性(SNPs)以及p27基因第109密码子的SNP对食管鳞状细胞癌(ESCC)发生及淋巴结转移的影响.方法:采用聚合酶链反应(PCR)片段长度分析和PCR限制性片段长度多态性(RFLP)方法检测p21基因外显子的3′UTR第20碱基对SNP以及p27基因第109密码子SNP位点的基因型.结果:p21和p27的基因型分布在ESCC组及对照组中均符合HardygCl21.5mmol/L,dNTPs0.2mmo

2、l/L,上、下游引物各0.2μmol/L.p21PCR反应条件为:94℃预变性5min,94℃30s,64.8℃30s,72℃60s,共35个循环后,72℃延伸5min.p27PCR反应条件为:94℃预变性5min,94℃30s,58℃30s,72℃60s,共35个循环后,72℃延伸5min.取8μLPCR产物进行限制性内切酶消化,经30g/L琼脂糖凝胶电泳分析基因型.对p21,p27基因的PCR产物,分别经限制性内切酶PstI和BlgI37℃过夜消化.每一批PCR反应均以蒸馏水替代DNA作为阴性对照.100g/LDNA标本进行二次分型以证实分

3、型方法的可靠性.统计学处理:采用SPSS12.0软件包进行统计分析,基因型频率观察值和预期值采用HardyWeinberg平衡检验,病例组与对照组的基因型和等位基因型分布比较均采用χ2检验.以非条件Logistic回归法计算经性别和年龄校正的比值比(oddsratio,OR)及其95%的可信区间(confidenceinterval,CI).P<0.05为差异具有统计学意义.2结果2.1患者一般特征ESCC组与对照组间的性别、年龄构成比差异均无统计学意义.吸烟者比例ESCC组与对照组相比差异无统计学意义(χ2=0.01,P=0.98).

4、ESCC患者中UGIG家族史阳性者比例(26.2%)显著高于对照组(4.1%)(χ2=20.49,P=0.000).经性别和年龄校正的OR值及其95%的CI为8.475(95%,CI=2.85~25).有临床资料185例ESCC患者中,有淋巴结转移87例,无淋巴结转移98例,没有远处转移的病例.PCRRFLP检测结果显示,ESCC组与对照组p21,p27基因的多态性基因型与原始结果100%吻合.2.2p21,p27基因SNPs分布p21基因T/T基因型产物为133和735bp2个片段;C/C基因型产物为133,256和479bp3个片段;C/

5、T基因型产物为133,256,479和735bp4个片段(图1).p27基因T/T基因型产物为76和378bp2个片段;G/G基因型产物为76,113和265bp3个片段;T/C基因型产物为76,113,265和378bp4个片段(图2).p21的T,C等位基因频率和T/T,C/T,C/C基因型频率在ESCC组和对照组之间差异均无统计学意义(P>0.05,表1).吸烟状况分层分析结果发现,p21的T/T基因型频率ESCC吸烟组(26.0%)显著高于健康吸烟组(12.0%)(χ2=8.60,P=0.014).经性别和年龄校正的OR值及其95

6、%的CI为3.36(95%,CI=1.45~7.75),而在非吸烟的患者和健康个体中,p21基因型及等位基因型频率差异均无统计学意义.p27等位基因型及基因型SNPs分布在ESCC组和对照组之间均无统计学差异.吸烟状况分层分析p27等位基因型及基因型SNPs分布在ESCC组和对照组之间均无统计学差异(表2).2.3p21,p27基因SNPs分布与ESCC淋巴结转移的关系有淋巴结转移组p21的T/T基因型频率(26.4%)显著高于无淋巴结转移组(15.3%)(χ2=6.128,P=0.013).经性别、年龄校正的OR值及其95%的CI为3.11(

7、95%,CI=1.28~7.52).淋巴结转移状况分层分析结果显示,p27等位基因型及基因型SNPs分布在ESCC组与对照组之间差异均无统计学意义(表3).表1p21,p27基因SNPs分布表2p21,p27基因SNPs分布与吸烟的分层分析表3p21,p27基因SNPs与淋巴结转移的关系周围浸润和淋巴结转移是影响UGIC患者预后和生存率的重要因素.因此,找到分子生物学指标来预测肿瘤浸润和转移,从而制定个体化的治疗方案具有重要价值.通过对ESCC患者淋巴结转移情况分层后发现与CC基因型相比,携带TT基因型可使ESCC患者淋巴结转移的危险性增高3倍

8、,携带TT+T/C基因型可使ESCC患者淋巴结转移的危险性增高近2倍,这表明携带TT或TT+T/C基因型的ESCC患者更容易发生淋巴结转移,提示携带该

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