坛紫菜的分类学研究

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1、坛紫菜(Pyropiahaitanensis)核糖体基因簇序列的测定张皓何渊沈颂东苏州大学医学部基础医学与生物科学学院邮编：215123作者简介：张皓（1985-），男，江苏太仓人，硕士，主要研究方向为基层医学与养殖E-mail：richard02@163.com何渊（1990-），男，江苏太仓人，硕士，主要从事藻类细胞发育与分子机理研究。E-mail：756072102@qq.com。通信作者：沈颂东（1968-），男，博士，教授，主要从事藻类细胞发育与分子机理研究。E-mail：shensongdong@suda.edu.cn摘要：坛紫菜是我国独有的栽培紫菜物种，而目前对坛紫菜分类

2、学层面上仍缺乏有效的分子鉴定技术。本研究通过PCR方法，对采自福建省莆田海区坛紫菜样品核糖体基因簇序列进行了测定，目的是为坛紫菜分类及种质鉴定提供分子生物学证据。测定结果表明，坛紫菜样品的18SrDNA的全长序列长度为2953bp；28SrDNA部分序列3603bp，且不含内含子；5.8SrDNA长度为158bp，该区域的5’端和3’端十分保守，在紫菜属中差异较小；ITS1的长度为334bp；ITS2为678bp。已经测定IGS区的部分长度为3555bp，该区域存在复杂二级结构。通过对坛紫菜核糖体基因簇序列的分析表明，其能够成为紫菜分类鉴定与系统演化的分子标记。关键词：坛紫菜；核糖体；

3、顺反子；系统演化ThenuclearribosomalDNA(nrDNA)cistronsequenceofPyropiahaitanensis(Bangiales,Rhodophyta)HaoZhang,YuanHe,SongdongShenSchoolofBiologyandBasicMedicalSciences,SoochowUniversity,Suzhou215123,ChinaAbstract:PyropiahaitanensisisauniquecultivatedlaverinChina,whilethelackofeffectivemolecularidenfiti

4、cationtechnologyaffectsthetaxonomyofP.haitanensis.ThestudysequencedthenuclearribosomalDNA(nrDNA)cistronsequenceofP.haitanensisfromPutian,FujiangProvincebypolymerasechainreaction(PCR),inordertoprovidemolecularbiologicalevidienceforclassificationandgermplasmidentificationofP.haitanensis.Resultssho

5、wnthateachunitiscomposedofthesmall-subunit(SSU)rRNAgeneofwhichthefulllengthis2953bp;thepartialsequenceofthelarge-subunit(LSU)rRNAgeneofwhichthelengthis3603bpwithoutanyintrons;thelengthofthe5.8SrRNAgeneis158bp,the5’and3’terminalsequencesofthegenicregionsoftheribosomalcistronareextremelyconservati

6、veamonggenusofPyropia;thelengthofITS1is334bpandITS2is678bp;thepartialsequenceofIGSis3555bp,duetoacomplicatedsecondarystructureexsitsinIGSregionmakessequencinguntoward.ThoughtheanalysisofnuclearribosomalDNAsequence,itcanbeamolecularmakerforthetaxonomicidentificationofPyropia.KeywordsPyropiahaitan

7、ensis;ribosome;cistron;systemevolution引言紫菜广泛分布于世界各地，自然生长的紫菜数量十分有限，因此目前用作食用以及研究的紫菜主要是通过人工养殖，我国紫菜产量居世界首位，紫菜已成为重要的经济海藻之一[1]。坛紫菜(Pyropiahaitanensis)隶属于红藻门(Rhodophyphyta)，原红藻纲（Protoflorideophyceae），红毛菜目(Bangiales)，红毛菜科（Bangiaceae