竹子叶绿体基因组SSR分子标记的开发及其应用.pdf

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1、热带亚热带植物学报2014，22(3)：263～269JournalofTropicalandSubtropicalBotany竹子叶绿体基因组SSR分子标记的开发及其应用杨丽，赵韩生，彭镇华2，董丽莉，高志民(1．国际竹藤中心，竹藤科学与技术重点开放实验室，北京100102；2．中国林业科学研究院林业研究所，北京100091)摘要：为探讨观赏竹叶片异质性的机理，根据麻竹(Dendrocalamuslatiflorus)和绿竹(Bambusaoldhamii)叶绿体基因组序列开发SSR分子标记。结果表明，在麻竹和绿竹叶绿体基因组中分别存在87

2、和86个SSR位点，其中三核苷酸重复类型最多，其次为单核苷酸重复类型。根据SSR位点设计21对引物，其中11对引物对6竹种能够扩增出稳定、清晰的条带，且具有多态性，引物有效率达到52．4％。聚类分析表明，6竹种可分为两大类群，与形态学分类结果基本一致。有4对引物在菲白竹(Pleioblastusfortunei)和白纹椎谷链(Sasaellaglabra￡albo．striata)的花叶中具有多态性，可作为区分观赏竹叶片异质性的分子标记。关键词：竹子；叶绿体SSR；异质性doi：10．3969~．issn．1005—3395．2014．03．

3、008DevelopmentandApplicationofSSRMolecularMarkersfromtheChloroplastGenomeofBambooYANGLi，ZHAOHan．sheng，PENGZhen．hua2，DONGLi．1i，GAOZhi．minf1．InternationalCen~rforBambooandRattan,KeyLaboratoryontheScienceandTechnologyofBambooandRattan，Beiiing100102，China；2ResearchInstituteofFo

4、restry,ChineseAcademyofForestry，Beijing100091，China)Abstract：Inordertorevealtheheterogeneitymechanismofornamentalbambooleaves，theSSRmolecularmarkersweredevelopedfromchloroplastgenomeofDendrocalamuslatiflorusandBambusaoldhamii．Theresultsshowedthattherewere87and86SSRlOCiinchl

5、oroplastgenomeofD．1atiflorusandB．oldhamii，respectively,inwhichthetrinucleotidetypewasthemost，followedbymononucleotidetype．BasedonthesequencesofSSRlociinchloroplastgenome，21pairsofSSRprimersweredesigned．Sixbamboospeciescouldbeamplifiedstableandclearbandswithpolymorphismby11p

6、airsofprimers，accountingfor52．4％．Theclusteranalysisindicatedthat6bamboospeciescouldbedividedintotwogroups，whichwasconsistedwithmorphologicalclassification．Meanwhile．polymorphismbandscouldbeamplifiedindiferentpartsofcolorfulleavesfromPleioblastusfortuneiandSasaellalabra￡albo

7、—striataby4pairsofprimers．So，itwassuggestedthattheseSSRmarkerscouldbeusedtodistinguishtheleafheterogeneityofornamentalbamboo．Keywords：Bamboo；ChloroplastSSR；Heterogeneity植物叶绿体富含色素，是重要的光合作用细胞成为群体遗传结构、亲缘关系评价、细胞质遗传特器，其DNA以半保留方式进行自我复制，与核基因性、叶绿体单倍型划分等的强有力工具。自Powell组相比，叶绿体基因组为单亲遗传

8、，保守程度高，因首次开发了大_~(Glycinemax)、水稻(Oryzasafiva)此叶绿体DNA的简单重复序列(SSR)分子标记已等6种植物的叶绿体SSR以来