人巨细胞病毒包膜糖蛋白B的B细胞抗原表位预测-论文.pdf

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1、2013年lO月湖南师范大学自然科学学报Vo1．36No．5第36卷第5期JournalofNaturalScienceofHunanNormalUniversityOct．，2013人巨细胞病毒包膜糖蛋白B的B细胞抗原表位预测彭波，谢伟岸，黄超洋，刘腊兰，吴舒婷，张风华，常海艳，刘如石，李小曼(湖南师范大学生命科学学院，中国长沙410081)摘要目的：通过生物信息学方法分析人巨细胞病毒包膜糖蛋白B(gB)的三级结构并预测其线性B细胞抗原表位．方法：根据人巨细胞病毒gB蛋白的胞外域序列，利用DNAStar软件分析其二级结构和表面特

2、性，联合在线B细胞表位预测程序BcePred，通过其理化特性来综合预测该蛋白可能的线性B细胞抗原表位；利用SWISS-MODEL服务器的同源建模方法构建gB蛋白的三级结构模型，对在生理三聚体条件下该蛋白各预测表位进行验证．结果：成功预测出人巨细胞病毒gB蛋白的多个线性B细胞抗原表位区段，其中预测出的5个表位区段不属于任何已发现的抗原区域，为后续验证其优势中和表位，研制安全、高效的表位疫苗奠定了理论基础．关键词生物信息学；人巨细胞病毒；包膜糖蛋白B；B细胞抗原表位中图分类号R373文献标识码A文章编号1000-2537(2013)0

3、5-0065-05B-cellEpitopesPredictionofHumanCytomegalovirusGlycoproteinBPENGBo，XIEWei—an，HUANGChao一，LIULa—lan，Shu-ting，ZHANGFeng-hua，CHANGHal-yan，LIURu—shi，LIXiao—m0n(CollegeofLifeSciences，HunanNormalUniversity，Changsha410081，China)AbstractObjective：Usingbioinformaticsapp

4、roaches，theBcelllinearepitopesofHumanCytomegalovirusGlycoproteinB(gB)arepredictedbystudyingitsphysicochemicaJproperties．Methods：BasedonthesequenceoftheHCMVgBextracellularportion，theprobableBcellepitopesofgBareanalyzedwithitssecondarystructureandsurfacepropertiesthroug

5、hDNAstarsoftwareaswellastheBcePredonlineprogram．Meanwhile，thetertiarystruc—tureofgBisconstructedbyhomologousmodellingwiththeassistanceofSWISSMODELserver，analyzingthesur-facepossibilityofepitopesundertheconditionofphysiologicaltrimer．Results：Thisstudysuccessfullypredic

6、tedseverallinearBcellepitopesoftheextracellularportionofHCMVgB，inwhich5epitopeswerereportedforthefirsttime．AndthisworkcouldprovideatheoreticalfoundationforfurtherverificationofthegBimmunodominantepitopesanddevelopingsafeandeffectiveepitopevaccines．KeywordsBioinformati

7、cs；humancytomegalovirus；glycoproteinB；Bcellepitope人巨细胞病毒(humancytomegalovirus，HCMV)，又称人疱疹病毒5型，属于疱疹病毒亚科，是广泛感染人类的病毒之一．在免疫抑制的病人中，巨细胞病毒的原发或复发感染往往引起严重后果；此外，孕妇也是该病毒的高危人群，胎儿的先天性感染常造成流产、畸形、听力障碍、发育迟缓等．HCMV的包膜糖蛋白B(glycoproteinB，gB)在病毒感染及诱导机体产生免疫反应中都起到了重要作用．自然感染的人群中普遍存在抗gB的抗体；其中

8、针对gB的中和抗体占HCMV全部中和抗体的绝大部分4。；实验也证明，针对gB的中和抗体可以有效阻止病毒在细胞间的传播以及病毒与细胞的融合J．在人巨细胞病毒的疫苗开发研究中，gB是首选的标靶，也一直是热点．在gB已证实的3个抗原区域(AD一1，AD-