大豆GST基因家族全基因组筛选、分类和表达-论文.pdf

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1、分子植物育种，2013年，第11卷，第5期，第465—475页MolecularPlantBreeding，2013，Vo1．11，No．5，465—475研究论文ResearchArticle大豆GST基因家族全基因组筛选、分类和表达江董丽1才华端木慧子朱延明：1塔里木大学生命科学学院，阿拉尔，843300；2东北农业大学生物工程基因重点实验室，哈尔滨，150030通讯作者，ymzhu2001@neau．edu．ca摘要利用生物信息学手段，结合公共大豆基因组数据库和大豆发育表达芯片数据获得大豆GST家族基因序列、蛋白序列和染色体位置等信息并

2、进一步对基因的组织表达等进行分析。结果显示大豆中含94个GST家族基因，根据系统发育分析将这些GST基因分成5个亚家族；定位分析表明，94个GST基因分布于大豆的16条染色体上。表达分析结果表明，14个不同发育阶段，大多成员至少在一个组织中表达，11差异表达的基因中有7在根中表达，另外4在其它部位优势表达，基因表达具有一定特异性。本研究为进一步研究GST家族的功能及其抗逆利用提供基础。关键词GST家族，全基因组筛选，分类分析，差异表达基因Genome—WideFilter，ClassificationandExpressionAnalysis

3、ofGSTGeneFamilyinSoybeanJiangDongliCaiHuaDuanmuHuiziZhuYanming’1CollegeofLifeSciences，TarimUniversity，Alar，843300；2KeyLaboratoryofArgriculturalBiologicalFunctionalGene，NortheastAgriculturalUni·versity，Harbin，150030Correspondingauthor，ymzhu2OOl@neau．edu．caDOI：10．3969／mpb．011

4、．000465AbstractBasedonbioinformaticmethods，soybeangenomedatabaseandexpressionmicroarraydata，soybeanGSTgenesfamilywereidentifiedinthisstudy．Andtheirgenesequences，proteinsequencesandchromosomelocationwereobtained．Allofninty-fourGSTgenesfromsoybeanwereclassifiedinto5subfamilie

5、saccordingtophylogeneticrelationship．Andtheyweredistributedon16chromosomes．Basedonthesoybeandevelopmentalexpressiondatabase，theexpressionpattemoftheGSTgenefamilyatdiferentdevelopmentorgansandstageswasanalyzed．Elevendiferentiallyexpressedgeneswerefotmd，andsevenofthemwerehigh

6、lyexpressedinrootateachdevelopmentalstagebymicroarray．Theywerediferentiallyexpressedindiferenttissuesanddevelopmentalstages．Theseresultsarehelpfulfortheirfunctionalanalysisandusingforcropanti-stressimprovement．KeywordsGSTfamily，Genome-widescreening，Classifyanalysis，Diferent

7、iallyexpressedgene谷胱甘肽S一转移酶(GSTs)是一类普遍存在的的辅酶(R．x)上建立一个极性的s一谷胱甘肽反应产酶，这类酶用于催化谷胱甘肽与毒性生物异源物质物(R-SG)。谷胱甘肽S一转移酶是一个庞大而多样的或氧化产物结合，从而促进此类物质的代谢、区域化基因家族，根据氨基酸序列相似性将其分为tau、phi、隔离或清除(WilceandParker，1994；王臻昱等，2012)。zeta、theta、lambda和DHARf谷胱甘肽依赖的抗坏血经典的反应模式为，GSTs催化谷胱甘肽(一谷氨酰一酸还原酶)6个亚类，其中tau

8、和phi两类GST在植物半胱氨酰一甘氨酸：GSH)转移到含有活性亲电中心中含量最为丰富(Dixoneta1．，2002；Jaineta1．，2010)。收稿日期：2