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时间:2020-04-12
《大豆GST基因家族全基因组筛选、分类和表达-论文.pdf》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、分子植物育种,2013年,第11卷,第5期,第465—475页MolecularPlantBreeding,2013,Vo1.11,No.5,465—475研究论文ResearchArticle大豆GST基因家族全基因组筛选、分类和表达江董丽1才华端木慧子朱延明:1塔里木大学生命科学学院,阿拉尔,843300;2东北农业大学生物工程基因重点实验室,哈尔滨,150030通讯作者,ymzhu2001@neau.edu.ca摘要利用生物信息学手段,结合公共大豆基因组数据库和大豆发育表达芯片数据获得大豆GST家族基因序列、蛋白序列和染色体位置等信息并
2、进一步对基因的组织表达等进行分析。结果显示大豆中含94个GST家族基因,根据系统发育分析将这些GST基因分成5个亚家族;定位分析表明,94个GST基因分布于大豆的16条染色体上。表达分析结果表明,14个不同发育阶段,大多成员至少在一个组织中表达,11差异表达的基因中有7在根中表达,另外4在其它部位优势表达,基因表达具有一定特异性。本研究为进一步研究GST家族的功能及其抗逆利用提供基础。关键词GST家族,全基因组筛选,分类分析,差异表达基因Genome—WideFilter,ClassificationandExpressionAnalysis
3、ofGSTGeneFamilyinSoybeanJiangDongliCaiHuaDuanmuHuiziZhuYanming’1CollegeofLifeSciences,TarimUniversity,Alar,843300;2KeyLaboratoryofArgriculturalBiologicalFunctionalGene,NortheastAgriculturalUni·versity,Harbin,150030Correspondingauthor,ymzhu2OOl@neau.edu.caDOI:10.3969/mpb.011
4、.000465AbstractBasedonbioinformaticmethods,soybeangenomedatabaseandexpressionmicroarraydata,soybeanGSTgenesfamilywereidentifiedinthisstudy.Andtheirgenesequences,proteinsequencesandchromosomelocationwereobtained.Allofninty-fourGSTgenesfromsoybeanwereclassifiedinto5subfamilie
5、saccordingtophylogeneticrelationship.Andtheyweredistributedon16chromosomes.Basedonthesoybeandevelopmentalexpressiondatabase,theexpressionpattemoftheGSTgenefamilyatdiferentdevelopmentorgansandstageswasanalyzed.Elevendiferentiallyexpressedgeneswerefotmd,andsevenofthemwerehigh
6、lyexpressedinrootateachdevelopmentalstagebymicroarray.Theywerediferentiallyexpressedindiferenttissuesanddevelopmentalstages.Theseresultsarehelpfulfortheirfunctionalanalysisandusingforcropanti-stressimprovement.KeywordsGSTfamily,Genome-widescreening,Classifyanalysis,Diferent
7、iallyexpressedgene谷胱甘肽S一转移酶(GSTs)是一类普遍存在的的辅酶(R.x)上建立一个极性的s一谷胱甘肽反应产酶,这类酶用于催化谷胱甘肽与毒性生物异源物质物(R-SG)。谷胱甘肽S一转移酶是一个庞大而多样的或氧化产物结合,从而促进此类物质的代谢、区域化基因家族,根据氨基酸序列相似性将其分为tau、phi、隔离或清除(WilceandParker,1994;王臻昱等,2012)。zeta、theta、lambda和DHARf谷胱甘肽依赖的抗坏血经典的反应模式为,GSTs催化谷胱甘肽(一谷氨酰一酸还原酶)6个亚类,其中tau
8、和phi两类GST在植物半胱氨酰一甘氨酸:GSH)转移到含有活性亲电中心中含量最为丰富(Dixoneta1.,2002;Jaineta1.,2010)。收稿日期:2
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