EILs基因家族全基因组鉴定与进化分析-论文.pdf

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1、基因组学与应用生物学，2014年，第33卷，第1期，第105—112页GenomicsandAppliedBiology，2014，Wo1．33，No．1，105—112研究报告ResearchReport甜瓜EIN3俩s基因家族全基因组鉴定与进化分析马勇-，2莘少红t巴德仁贵哈斯阿古拉1内蒙古大学生命科学学院／内蒙古I{治区牧草与特色作物生物技术重点实验室，呼和浩特，010021；2包头师范学院生物科学与技术学院包头，014030通讯作者，hasind@sina．eom摘要以拟南芥的EIN3／EILs蛋白保守结构域

2、为探针序列，对甜瓜全基因组的蛋白质数据库进行搜索，搜索后获得4个E1N3／EILs蛋白序列。对甜瓜EIN3／EILs基因家族的系统进化、序列相似性、基因结构进行了分析。通过对所有甜瓜的EIN3／EILs基因的表达谱分析得知该基因家族在各组织中均有表达，其中在果实以及愈伤组织中高丰度特异表达，不同基因之间的表达模式差异明显。关键词甜瓜，EIN3／EILs蛋白，基因家族，进化分析Genome—wideIdentificationandPhylogeneticAnalysisoftheEIN3／EILsGeneFamily

3、inMelonsMaYong1,2ShenShaohongBadeRenguiHasiAgula1InnerMongoliaKeyLaboratoryofHerbage&EndemicCropBiotechnology，CollegeofLifeSciences，InnerMongoliaUniversity，Hohhot，0100212DepartmentofBiologicalScienceandTechnology，BaotouTeacher'sCollege，Baotou，014030Correspondin

4、gauthor，hasind@sina．c'omDOI：10．13417／j．gab．033．000105AbstractFourEIN3／EILsgeneswereidentifiedfromthemelongenomeproteindatabasewhichwasbasedonconserveddomainsofEIN3／EILsproteinsasprobesequencesinArabido1)sis．Phylogeneticanalysis，numbersofintronanalysis，alignment

5、ofsequencesimilaritywereperformedinEIN3／EILsgenefamilyinmelon．Bymeansofanalyzingunigeneswhichmatchedwi出EIN3／EILsproteins．theresultshowthatEIN3／EILsgeneswereexpressedindiferenttissues，partofgenesspecificexpressedwithhighabundanceinfruitandcallus，anddiferentmembe

6、rsofEIN3／EILsgenefamilyexhibitsdifferenceinpatternsofexpression．KeywordsMelon，EIN3／EILsprotein，Genefamily，Phylogeneticanalysis乙烯是在植物生长发育过程中的一种重要激序列不仅存在于下游ERF的启动子区，还存在于一素，它可以广泛地调控植物的发育过程，包括种子萌些果实成熟、衰老相关基因的启动子区，如ACO发、幼苗生长、侧根发育、叶片和花的脱落、果实成(Blumeeta1．，1997；Lasserre

7、eta1．，1997)。熟、组织衰老、生物和非生物胁迫应答反应等(Brown，在高等植物中EIN3／EILs是一个相对较小的基1997；Lelievreeta1．，1997；MorganandDrew，1997；因家族，在已有的研究发现，拟南芥、烟草、番茄和水SmalleandvanDerStraeten，1997)。E1N3／EILs作为乙稻中分别具有6个(Chaoeta1．，1997；GuoandEcker．烯信号转导途径中关键的核转录因子，，^s基2004)、5个(KosugiandOhashi，2000；Ri

8、eueta1．，因的表达能够活化已知的乙烯转导过程(Guoand2003)、4个(Tiemaneta1．，2001；Yokotanieta1．，2003)Ecker，2004；Cheneta1．，2005；Lineta1．，2009)。它作用和6个(Maoeta1．，2006；Hiragaeta1．，2009)EIN3／EILs于乙烯反应基因如