大豆全基因组分枝相关基因发掘及与QTL共定位-论文.pdf

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1、逢HEREDITAS(Beijing)2013年6,EJ，35(6)：793—804ISSN0253-9772WWW．chinagene．CR研究报告DoI：1O．3724／SP．J．1005．2013．00793大豆全基因组分枝相关基因发掘及与QTL共定位谭冰，一，郭勇，邱丽娟1．东北农业大学大豆研究所，哈尔滨150030；2．中国农业科学院作物科学研究所，国家农作物基因资源与遗传改良重大科学工程，北京100081摘要：大~-(Glycinemax)分枝在个体和群体水平上均与大豆产量关系密切，因此大豆分

2、枝相关基因的发掘及利用对大豆高产分子育种具有重要意义。文章通过GO(Geneontology)分类和文献检索共获得植物分枝发育相关基因183个。基于序列相似和结构域相同的原则，从大豆基因组中发掘出大豆分枝相关的候选基因406个。通过收集已发表的大豆分枝相关QTL，利用BioMercator2．1软件，将符合映射条件的35个QTL映射到公共图谱的12个染色体。通过共定位分析发现，在20个分枝相关的QTL区间内存在大豆分枝相关候选基因57个。本文发掘的分枝发育相关基因信息为大豆分枝相关QTL的精细定位和克隆以

3、及大豆分枝发育的分子生物学基础研究提供了参考。关键词：大豆；分枝；基因；QTL；共定位WholegenomediscoveryofgenesrelatedtobranchingandCO—localizationwithQTLsinsoybeanTANBing，GUOYong，QIULi—Juan1．SoybeanResearchInstitute，NortheastAgriculturalUniversity，Harbin150030，China；2．TheNationalKeyFacilityforC

4、ropGeneResourcesandGeneticImprovement(NFCR1)，InstituteofCropScience，ChineseAcademyofAgriculturalSciences，Beijing100081，ChinaAbstract：Branchnumberofsoybeanisoneofagronomictraitsthatcloselyrelatedwithyieldinbothindividualandpopulationlevels；therefore，discov

5、eringgenesrelatedtobranchingisimportantformolecularbreedinginsoybean．Inthisstudy,183genesrelatedtoplantbranchdevelopmenthadbeencollectedthroughGOclassificationandliteratures．Basedontheprincipleofsimilarsequencesandconserveddomains，406genespossiblyrelatedt

6、obranchinghadbeenidentifiedatthewholegenomelevelinsoybean．Ontheotherhand，integrationofpublishedQTLsrelatedtobranchingwascarriedoutUS—ingBioMercator2．1，andatotalof35QTLswaslocatedon12chromosomes．Co-localizationanalysisofQTLsandgenesrelatedtobranchingsugges

7、tedthat57geneswerelocatedin20intergratedQTLregions．Theseresultsprovidedusefulin一收稿日期：2012-11-14；修回日期：2012-12—17基金项目：国家高技术研究发展计~(863计划)项目(编号：2012AA101106)和国家自然科学基金项目(编号：30490251)资助作者简介：谭冰，硕士研究生，专业方向：大豆基因资源发掘与利用。Tel：010．82105836；E．mail：tanbing321@126．com：郭勇

8、，博士，研究方向：大豆基因发掘与利用。E．mail：guoyongbj@gmail．com谭冰和郭勇同为第一作者。通讯作者：邱丽娟，博士，研究员，研究方向：大豆基因资源发掘与利用。E-mail：qiulijuan@caas．cn；qiul~uan@263net网络出版时间：2013-4．1017：12：24URL：http：／／www．cnki．net／kcms／detail／11．1913．R．20130410．1712．0