简化基因组测序RAD技术.pdf

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1、基于酶切的简化基因组测序(RAD)1.对于群体进化研究，个体的混样策略是怎样的？答：如果更关注群体间的遗传多样性差异，希望消除群体内个体遗传差异带来的干扰，可以采用群体内个体混样的策略，我们会进一步在生物信息分析流程中采用优化的群体内SNP纠错与过滤程序达到分析目的。2.我们的RAD-Seq建库测序策略是怎样的？答：建库策略选择基于综合考虑序列碱基质量、测序成本和物种基因组情况，主要有Single‐end50bp和Pair‐end90bp。对于有参考基因组的物种，我们建议采用PE90文库测序。对于无参考基因组的物种，则建议采用

2、SE50文库测序。3.RAD-Seq测序结果受哪些因素影响？测序成功的标准是什么？答：设备、耗材、操作问题等方面都会对测序的结果造成影响。测序成功标准包括：reads数达标，错误率低，Q20高等。