微生物分 类学

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1、微生物分类学硕士研究生课程讲授：刘国生95绪论地球上活的生物具有令人迷惑不解的多样性，所以人们期望根据它们之间的相似性将它们划分成不同的类群。分类学（Taxonomy）(taxis,希腊语，安排或顺序；monos，法则，或nomein，分类或治理)即生物分类的科学。微生物分类学(MicrobialTaxonomy)是微生物学的一个重要分支学科，是概括有关微生物学的成果而建立的，是微生物学实践性最强的分支学科之一。它涉及面广、内容丰富。近代科学的迅速发展和新技术的不断渗透，尤其是在分子生物学和生物工程深入了展的今天，人们对微生物的认识不断深化，以形态为主的传统分类法已不能满足现

2、代分类鉴定的需要。故分类学方法不断深化，鉴定指标不断革新。如从传统的分类学方法到数值分类法、从简单形态、生理生化指标到遗传学、分子生物学、细胞化学组分等指标等，大大促进了微生物分类学的发展。一般微生物分类学主要包括细菌分类学、放线菌分类学、真菌分类学（霉菌分类学）和酵母菌分类学等内容。该课程重点在于系统阐明微生物分类学的基本知识和原理，同时适当介绍数值分类、分子生物学、遗传学等分类的原理和方法。95第一讲分类鉴定的意义和细菌分类学(Bacterialtaxonomy)的发展一、细菌分类鉴定的意义1意义：细菌分类学同动物分类学、植物分类一样，其目的在于认识细菌、了解它们之间的亲

3、缘关系，并为细菌资源的开发、利用、控制和改造提供理论依据。2细菌分类学的任务：在全面了解细菌和生物学特征基础上，研究其种类，探索其起源、演化以及与其它类群的亲缘关系，进而提出能反映自然发展的分类系统，并将细菌（微生物）加以分门别类。从广泛意义上讲，分类学由3个独立但又相互关联的部分组成：分类、命名和鉴定，1）分类（Classification）在对大量细菌（微生物）进行逐一观察、分析和描述和基础上，按照它们个体发育的形态、培养特征、生理生化特性和细胞化学组分等一系列性状的异同和主次，并根据其亲缘关系与应用的方便，加以分门别类（归纳为纲、目、科、属、种），从而制定为鉴定用的检索

4、表。或者说，根据相互间相似性或进化亲缘关系将生物归属为类群或分类单元（taxa）2）鉴定（Identification）对某一具体的细菌（微生物）的性状进行细致的观察和测试，参照一定的检索表，用对比分析的方法确定该微生物的分类地位。95（知道它是什么）。也即，决定某一特定分离物归属某一已确认分类单无的过程。这是分类学的实用方面。3）命名（Nomenclature）根据国际命名法规，给分类单元以科学名称。对与已知菌相同的种，则采用已知菌的名称；不同者，可按国际命名法则，给新种定名。二、细菌分类学发展简史1675，荷兰列文虎克（Leeuwenhock）观察到“微小动物”；1753

5、，瑞典林奈（Linnaeus）的分类系统中的“纤毛虫纲”包括了列文虎克的“微小动物”，其中有些是细菌。在林奈的分类系统中，重视对鉴定有用和各种特征。1876，丹麦Müller提出蠕形动物分类系统，包括了原生动物、藻类和细菌。根据形态特征将细菌分成单胞菌属和弧菌属。1838，德国Ehrenberg把细菌归属纤毛虫纲的单胞菌科和弧菌科，并将弧菌再分成5个属。（当时所有与细菌打交道的分类学家都认为细菌应归属于动物界的纤毛虫纲）1857，德国植物学家Nageli指出，细菌有细胞壁，应归属于植物界，并独立为一纲“裂殖菌纲”（Schizomycetes）。1872，德国Cohn提出了第一

6、个细菌分类系统，依据形态分为4族6属：球菌族：微球菌属微杆菌属：（杆菌属）95丝状菌属：（芽孢杆菌属、弧菌属）螺菌族：（螺菌属、螺旋体属）Cohn第一个描述了细菌内生芽孢，并指出它们有耐热性能。自此到达20世纪初的相当长的时间里，细菌的分类鉴定仍然是以形态特征为主。此前可以说是细菌分类学的第一纪元。1909，OrianJensen采用形态、病原特征的同时，还依据细菌的代谢特征，突破了仅依形态为分类依据的局限。可以说是细菌分类第二纪元的开始。Jensen将裂殖菌纲分为：端丛毛菌目（Cephalotrichinae）：能量代谢主要是氧化作用周毛菌目（Ｐeritrichinae）：

7、能量代谢主要是糖和氨基酸的分解，而非氧化作用或反硝化作用。美国布坎南（R.E.Buchanan），对分类工作有深远的影响。依据形态、染色反应、生理生化特征、病原性等多方面特征，把细菌分成科、族和属。1917，美国细菌学家协会组成一个细菌鉴定和分类委员会，指导和撰写了当代最著名的细菌分类学其著作：《伯杰细菌鉴定手册》（Bergey’sManualofDeteminativeBacteriology,最初指定DavidH.Bergey作为编委会主席）.1923第1版，1974修订过7次，1984出第9版，成