【农业资源与环境专业】【毕业论文】玉筋鱼群体遗传变异研究

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1、本科毕业论文(20届)玉筋鱼群体遗传变异研究目录中文摘要1英文摘要21.前言11.1玉筋鱼渔业生物学研究进展11.2玉筋鱼种群遗传学研究进展21.3线粒体DNA及其作用21.4研究目的及意义32.材料与方法32.1实验来源42.2样本组DNA提取42.3PCR扩增与序列测定42.4数据分析43结果53.1单倍型及核苷酸多样度53.2遗传分化指数FST及NJ系统树184小结20致谢22参考文献23[摘要]玉筋鱼(AmmodytespersonatusGiraid)属玉筋鱼亚目、玉筋鱼科、玉筋鱼属,俗称面条鱼、沙钻,为冷温性小型鱼类,分布于我国的渤海、黄海北部及朝、

2、韩、日俄远东海区。目前玉筋鱼是我国北方沿海重要的经济鱼类,为阐明玉筋鱼不同地理群体的遗传结构和遗传变异,对玉筋鱼中国青岛群体(38尾)、日本青森群体(19尾)和日本福冈(12尾)群体,共69个个体的线粒体DNA(mitochondrial,mtDNA)控制区片段序列进行测定和分析,共获得长度为530bp的控制区片断的一致序列。在所获得的69个个体中总共检测到69个单倍型,各单倍型间的变异有一定的插入和缺失。三个群体的单倍型多样性指数均为1.00。核苷酸多样度以青森群体最高,0.0266±0.0041,其它两个群体较低,福冈群体则只有0.0105±0.0031,最

3、低的为黄海群体,指数为0.0123±0.0007。在平均碱基差异数方面,青森群体的数值最大,为13.819±0.512;其次是黄海群体,数值为6.492±0.520;最小的是福冈群体,数值为5.561±0.337。根据控制区序列构建的NJ系统树显示所有玉筋鱼个体分为A、B两支,A支在3个群体中都检测到,B支只在青森群体中检测到。玉筋鱼3个群体间成对的FST值表明玉筋鱼的群体有显著的遗传结构分化,青森群体有了一定的独立性,同其他两个群体有显著的遗传差距。本研究结果有力地表明玉筋鱼种群在中日海域距离较近的地方存在基因交流,但距离黄海较远的太平洋海域的青森群体同青岛群

4、体间的基因交流存在非常有限。[关键词]玉筋鱼遗传多样性控制区序列[Abstract]Thesandeel(AmmodytespersonatusGiraid)belongstotheAmmodytoidei,Ammodytidae.Itisakindofsmallfishincoldwater,whichwidelydistributesamongtheBohaiSea,YellowSea,theNorthandSouthKorea,JapanandRussiaFarEast.Atpresentitistheimportanteconomicalfishofco

5、astalinnorthpartofourcountry.Fortheexpositionofgeographycommunity'shereditystructureandthehereditarychange,wedetectedandanalysedtheammodytescommunity(38)inQingdaoofChina,theJapaneseaomoricommunity(19)andtheJapaneseFukuoka(12)community,altogether69individual'slineplastochondriaDNA(mit

6、ochondrial,mtDNA)controlregion.Thenweobtainedthelengthisthe530bpcontrolareapiececonsistentsequence.Among69individualsaltogether,69Haplotypewasexamined,andvariationbetweenvariousHaplotypehadcertaininsertionandthemissing.Thedibersityindexofthreecommunity'sHaplotypeis1.00.Nucleotidedive

7、rseishighestbytheaomoricommunity,at0.0266±0.0041,twoothers’communitiesarelower.Fukuokacommunityisonly0.0105±0.0031,whilethelowestindexis0.0123±0.0007oftheYellowSeacommunity.Attheaveragebasicgroupdifferentnumberaspect,theaomoricommunity'svalueisbiggest,anditis13.819±0.512.NextistheYel

8、lowSeacommun

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