【农业资源与环境专业】【毕业论文+开题报告+文献综述】两种玉筋鱼线粒体16SrRNA和COI基因遗传分化研究

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1、本科毕业论文开题报告农业资源与环境玉筋鱼形态学和分子生物学研究现状一、综述本课题国内外研究动态，说明选题的依据和意义（一）、国内外研究现状和发展趋势目前有关玉筋鱼形态学方面的研究较多，日本学者针对日本近海的玉筋鱼，从种群鉴别、群体划分等方面做了比较多的研究。Hashimoto(1984)研究了日本沿海玉筋鱼的种群结构，认为日本沿海分布的三个玉筋鱼群体在遗传上各自独立，可能是三个独立的亚种[1]。田中伸幸(2004)对日本北海道水域存在的玉筋鱼和太平洋玉筋鱼进行了比较分析，认为仅从脊椎骨数等特征很难将这2个种区分，而耳石轮纹(第一透明带幅)宽度是鉴别这2个种的有效方法[2

2、]。纪毓鹏(2006)采用形态学方法对玉筋鱼群体的分析结果表明，背鳍鳍条数、胸鳍鳍条数、臀鳍鳍条数、脊椎骨数和鳃耙数5个分节特征在不同的群体中表现出不同的差异程度，适合作为玉筋鱼的种群划分依据[3]。张辉（2011）对采自日本北海道宗谷近海的玉筋鱼和太平洋玉筋鱼进行了部分形态学和生物学特征的分析比较。2种玉筋鱼在体长体质量关系式、性腺成熟系数等生物学特征上存在显著差异,单因子方差分析表明,2种玉筋鱼的脊椎骨数存在极显著差异(P<0.01),但有较高的重叠率(70%)。采用耳石角度对2种玉筋鱼进行研究,发现玉筋鱼耳石角度的平均值[(86.8±0.4)°]显著小于北方玉筋鱼

3、[(93.0±0.5)°](P<0.05)。利用耳石角度对2种玉筋鱼的判别准确率较高,平均为84.3%,可以作为鉴别2种玉筋鱼的1个形态学参数[4]。国内学者主要开展了玉筋鱼的分布、摄食食性以及形态学和生物学等方面的研究[5-8],遗传学研究报道极少。目前尚未有关玉筋鱼和太平洋玉筋鱼之间的遗传分化研究，但有关玉筋鱼的遗传学研究较多，纪毓鹏(2006)对6个玉筋鱼群体(香川、爱知、福冈、青森、北海道和青岛)进行了同工酶分析，研究了其种群遗传结构。形态学研究结果均表明6个玉筋鱼群体分为2支，其中北海道和青森2个群体为一支，另外4个群体为一支[3]。韩志强(2008)利用线粒

4、体DNA在玉筋鱼群体内检测到两个显著分化的单倍型类群，两个单倍型类群在地域上的分布频率具有显著差异，通过比较日本海和太平洋侧两个单倍型类型分布区域的不同，发现洋流和水温对玉筋鱼的分子系统地理模式具有显著影响。分子方差分析以及群体间分化指数Fst值均显示玉筋鱼南北两个组群体内不存在明显的群体遗传结构。对玉筋鱼12个群体共211个个体进行了AFLP分析，结果表明玉筋鱼南北两个组群是互为单系的关系，并且两组群间有完全的基因隔离，玉筋鱼南北两个组群可能是不同的亚种或种。两个组群的分化可能是玉筋鱼从北太平洋向南扩散适应不同温度的结果[9]。任桂静（2009）对福冈、爱知、青岛、石

5、狩湾、礼文岛等五个地区的种群用微卫星标记及种群SSR分析，玉筋鱼5个不同群体间的遗传相似性系数为0.555一0.783，遗传距离为0.352一0.684；表明5个群体间有一定的遗传差异。其中，礼文岛(Rebunlsland)与爱知(Alchi)这2个群体间遗传变异程度最高，亲缘关系最远；石狩湾(IshikariBay)与礼文岛(RebunIsland)的遗传相似性系数最大，遗传距离最近。其聚类关系树将5个群体分为2支。福冈，爱知，青岛群体聚为一支，礼文岛与石狩湾群体(属于其研究的北部玉筋鱼群体)聚为一支。计算南北组群之间的遗传分化系数为0.0143，而组群内部之间的遗传

6、分化值为0.0139。AMOVA分析结果显示玉筋鱼南北组群之间的变异占1.43%，相应的组群内部之间的变异为1.39%;而来自个体之间的变异贡献率95.19%。组群之间的遗传分化与两两群体之间的遗传分化基本一致，玉筋鱼5个群体变异仍处于种内水平的变异[10]。（二）选题依据与意义从生态角度，玉筋鱼属浮游动物食性的小型鱼类，在生态系统中处于食物链的底层，它既是人类无法利用的一些环境生物资源的收集者，又是诸多大、中型经济鱼类重要饵料生物，因此在黄海食物网结构中扮演着重要角色。实践证明:处于食物链顶端的生物资源被歼灭后，食物链底层将会为我们提供更多一些的低质渔获量。对玉筋鱼资

7、源适度利用可以，但是处于食物链基础地位的大宗生物资源一旦动摇，则有可能带来严重经济和生态问题。因此对玉筋鱼资源采取适当措施、合理保护利用，将对于维护黄海海区的生态系统平衡和该海区渔业的可持续发展具有重要意义。玉筋鱼是我国黄、渤海的重要渔业资源。由于过度捕捞，这一资源目前已呈现衰退趋势[26]。两种玉筋鱼（Ammodytespersonatus和Ammodyteshexapterus)在形态相似，在可数性状上存在交叉，不易区分。目前尚无100%可鉴别两种的遗传标记，本研究通过分析两种玉筋鱼线粒体DNA中的16S基因和COI基因片段，确定两种