【农业资源与环境专业】【毕业论文】石首鱼科线粒体控制区序列结构研究

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1、本科毕业论文(20届)石首鱼科线粒体控制区序列结构研究目录中文摘要………………………………………………………………….1英文摘要………………………………………………………………….21.前言……………………………………………………………………11.1石首鱼科鱼类的形态特征及分布............…………………11.2石首鱼科线粒体控制区研究现状及意义…………………………22.材料与方法………………..……………….…………………………42.1材料………..…………………………………………………………42.2方法………………………………………………….

2、.………………43.结果和分析……………………………………………………………63.1五种石首鱼科鱼类线粒体DNA控制区分析…………………………63.2种间的遗传与进化分析…..……………………………….………164.小结………………………………………………………………………18参考文献………………………………….………………………………19[摘要]本文通过对石首鱼科中白姑鱼(Argyrosomusargentatus)、黄姑鱼(Nibeaalbiflora)、小黄鱼(Pseudosciaenapolyactis)、大黄鱼(Pseudosciaenacroc

3、ea)、黑腮梅童鱼(CollichthysniveatusJordanetStarks)这五种鱼类的线粒体控制区序列结构和遗传变异进行了分析,来探讨石首鱼科的控制区结构特征和种间系统发育关系。采用聚合酶链式反应(PCR)技术对实验的五种鱼类的mtDNA控制区全序列进行了扩增,PCR产物经纯化后进行序列测定,五种鱼类的控制区序列长度变化较大,范围从780bp到837bp之间,控制区序列富含A和T碱基,A+T平均含量达到62.47%,而G碱基相对缺乏,平均仅为14.88%。这说明控制区在碱基的组成上具有明显的偏向性。通过对mtDNA控制序列区的结构研究分析,以

4、及同其他鱼类的控制序列区进行比较,发现五种鱼类mtDNA控制区包括三个主要识别区域:终止相关序列、中央保守序列区、保守序列区,在大致相同的保守区段:ETAS结构,CSB-E、CSB-2、GTGGG-box结构很保守,而CSB-E、CSB-F、CSB-1、CSB-3种间存在多个或个别碱基的变异,而种内也发现个别碱基的变异。本文还利用MEGA计算出不同个体间的遗传距离;利用DNASP软件计算出石首鱼科五种鱼的种间多态位点数(S)为399,研究结果表明,石首鱼科的D-loop基因序列种间变异程度较大;并构建NJ系统树,将构建的系统树与之前的石首鱼科形态学分析结果

5、比较发现,系统树构建结果与传统的形态学分类结果完全吻合,这说明了利用控制区序列研究石首鱼类的系统分类是可行的。[关键词]大黄鱼小黄鱼白姑鱼黄姑鱼黑鳃梅童鱼mtDNA控制区结构[Abstract]InordertoexaminethestructureofmtDNAcontrolregion,weamplifiedandsequencedcompletecontrolregionfrom3individualsofArgyrosomusargentatusand2individualsofP.polyactisandaindividualofNibeaalb

6、iflora,2individualsofPseudosciaenacrocea,2individualsofCollichthysniveatusJordanetStarks,whichwereallbelongstotheSciaenidae.TherewasabiasofthecontentofAandTinthecontrolregion,comingupto61.92%.ThecontentofnucleotideGwasthelowest,ataveragewasonly15.47%.Comparedwiththecontrolregionof

7、otherfishes,weidentifiedthethreemainregionsincontrolregionfromthefivespecies,including:theterminationofrelatedsequences,thecentralconservedsequenceareas,aconservativesequenceareas,similartotheconservativesection:thesequenceofETAS,CSB-E,CSB-2,GTGGG-boxwereveryconservative,butCSB-1a

8、ndCSB-3havesomevariations,andalso

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