微生物第5章分类与鉴定

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1、微生物鉴定与分类一、生物的系统发育和进化1、对生物分类的两种原则：传统：根据表形特征的相似程度分类。重在应用，不以反应生物之间的进化关系为目的现代：通过比较不同物种间基因序列的相关性来类，目的是探寻各物种间的进化关系，建立反映生物发育相关性的分类系统。2、传统的分类体系1753年：瑞典人林奈（CarrolusLinneaus）两界分类系统：生物动物植物1969年：惠特克（R.H.Whittaker）：原核生物界：细菌、蓝细菌原生生物界：原生动物、单细胞藻类五界系统真菌界：真菌、酵母菌植物界动物界3、反映生物系统发育相关性

2、的进化计时器生物AA、B间的生物B进化关系理想的生物进化计时器应具备的条件：见书原核生物核糖体（70S）：大亚基（50S）：蛋白质+23SrRNA+5SrRNA小亚基（30S）：蛋白质+16SrRNA真核生物核糖体（80S）：大亚基（60S）：蛋白质+28SrRNA+5~5.8SrRNA小亚基（40S）：蛋白质+18SrRNA比较两者核苷酸or氨基酸序列差异（进化计时器）20世纪70年代，沃斯（CarlWoese）根据生物核糖体中18SrRNA和16SrRNA的碱基序列将生物划分为3个“域（domain)“或称“原界”：

3、古细菌原界（Archaea）：甲烷菌，嗜盐菌，嗜热菌等真细菌原界（Bacteria）：除古细菌外的其它原核生物真核生物原界(Eukarya)：原生生物、真菌、动物、植物4、三域分类学说生物的三原界系统发育树二、微生物的分类单元和命名：1、种以上的微生物分类单元：界（Kingdom）、门（Phylum）、纲（Class）、目（Order）、科（Family）、属（Genus）、种（Species）2、对于微生物来说，种的概念：表型特征和包括16SrRNA在内的基因序列特征高度相似的菌株群，而且这个菌株群和其它类群有明显差异

4、。3、种以下的分类概念：菌株（strain）、模式菌株（typestrain）亚种（subspecies）型（form）：生物型、血清型、噬菌体型……4．菌种学名（1）按《国际细菌命名法规》命名的，国际公认，通用的正式菌种名字。采用林奈的双名法：学名：属名+种名加词（字母均为斜体）属名：拉丁文或希腊文，名词，单数，第一个字母大写，描述微生物的一般的、主要的特性。种名加词：拉丁文或希腊文，形容词，字母小写，描述该菌种具体、次要特征。例：金黄色葡萄球菌：Staphylococcusaurous结核分枝杆菌：Mycobacte

5、riumtuberculosis如果泛指某一属的微生物，或某菌种，知其属但种名未定，可用“sp”“spp”作加词：Bacillussp:一个尚未定名的芽孢杆菌Bacillusspp:泛指芽孢杆菌属的菌种（2）种以下分类：亚种（subspecies,subsp）指某一明显而稳定的特征与模式种不同的种，例：蜡状芽孢杆菌的蕈状亚种：Bacilluscereussubsp.Mycoides变种（Variety,Var）:现不正式使用，枯草芽孢杆菌黑色变种：Bacillussubtilisvar.niger菌株（strain）:由

6、一个独立的单细胞繁殖形成的微生物纯种群体，使用较广泛。某菌种的菌株名称加在菌种学名之后，可任意取名，例：华癸中生根瘤菌7653R菌株：Mesorhizobiumhuakuii7653R费氏中华根瘤菌USDA205株：SinorhizobiumfrediiUSDA205同一菌种学名在一篇文章中首次出现时应写全称，第二次出现，属名可只写第一个字母,字母右下加圆点，以示缩写：EscherichiacoliE.coli三、原核生物的鉴定和分类方法传统分类依据：表型特征现代分类依据：以遗传型特征为依据的分子分类（一）传统分类方法高

7、等动物：外部形态、内部解剖结构种子植物：生殖器官特征：花、果实微生物：微生物形体小，类型多，变异大，微生物分类、鉴定的依据远较其他生物复杂：个体形态：细胞形状、大小、特殊结构（如芽孢、鞭毛、荚膜）、革兰氏染色反应等…群体形态：在固体琼脂上的菌落形态、斜面菌苔特征、液体培养特征生理生化反应：产能方式、与氧气关系、碳源氮源利用、糖发酵、乙酰甲基甲醇试验（V.P）、吲哚试验、明胶液化、淀粉水解、产氨试验等……血清学试验噬菌体分型DifferentShapes1、细菌的个体与群体形态（1）细菌的个体形态（2） 细菌的排列方式：

8、母细胞子细胞立即分开分散个体不立即分开形成各种排列方式不同排列方式多见于球菌，是球菌的分类依据之一：单球菌、双球菌、链球菌、四联球菌、八叠球菌、葡萄球菌杆菌多为单生（E.coli）或排成链状(B.t)，对分类意义不大（3） 细菌的群体形态细菌在自然环境或培养基上大量繁殖后，形成肉眼可见的群体。在固体培养基上由单个细胞