帕金森病相关基因的筛选及生物信息学分析

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时间:2019-03-16

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1、分类号密级UDC编号讀似序硕去学位论文帕金森病相关基因的筛选及生物信息学分析’ScreeninandBioinformaticsAnalsisofPark!打sonsgyD-lsiseasereatedGene陈光乐导师姓名郑文岭教授专业名称生物化学与分子生物学培养类型学术型研究生论文提交日期205-4-251南方医科大学2012级硕击学位论文帕金森病相关基因的締选及生物信息学分析’ScreeningdBioinforma村CSAnalsisofParki

2、nsonsanyD-iseaserelaf:edGenes课题来源:学位申请人炼光乐导师姓若郑文岭教授专业為称生物化学与分子生物学培养类*型疋斗或培养层次不禾4所在学院基因工程研究所答辩委员主席答辩委员会委员2015年《月日广州硕壬学位论文帕金森病相关基因的筛选及生物信息学分析硕±研究生:陈光乐导师:郑文岭教授摘要oni帕金森病(ParkinssdiseasePD)是中老年人常见的中枢神经系统退行性,,是我国第二大神经退行性疾病疾病,其发病率仅次于阿尔茨海默病,帕金森病的病理改

3、变是中脑黑质多己胺(dopamine,DA)能神经元变性、胞浆内Lewy小体的形成,使黑质纹巧体通路破坏及尾状核、壳核中DA含量减少。其主要的临床表现为静止性震颤、肌强直、行动迟缓和姿势步态异常。随着人们对该PD病的认识,,发现全世界的发病人数逐年增多,加之人口的老龄化其患病?率呈上升趋势。国内外流行病学研究表明:65岁W上人群中发病率是12%,-85岁W上高达45%,55岁W上PD患者总人数已超过170万人。随着社会人口的自然老齡化,PD的患病人数逐年増加,我国的患病人数已超过200万。近年来的研究发现嗅觉障碍、睡眠障碍、精神障碍、认知障碍,

4、及自主神经功能障碍等普遍存在于PD患者中,而且出现在运动症状的不同时期,同样影响着患’者的生存质量。PD虽然不会缩短患者寿命,但与阿尔茨海默病(AlzheimersD—iseaseAD、,)样严重影响患者的生存质量,W及因其病程长致残率高等特点,给患者和家庭带来沉重的负担及烦恼。因此,研究帕金森病的病因和发病机制具有极其重要的意义。帕金森病的病因和发病机制尚不清楚,目前认为是在年齡老化的背景上,遗传因素和环境因素共同作用的结果。许多研究提示PD患者黑质DA能神经元变性可能与线粒体功能障碍、氧化应激、兴奋性毒性、神经营养因子缺乏、免疫调

5、节异常一、细胞调亡等系列机制、环节有关,流行病学调查研究显示,约I摘要0 ̄有115%的帕金森病患者有家族史。通过对遗传因素在PD发病中的作用机理研究,目前至少克隆了13个PD致病基因,表明帕金森病的发病与遗传因素密、切相关,而遗传因素包含了多基因多因子的相互作用和影响。因而从分子水平研究帕金森病的发生发展,对于它的预防、控制和治疗具有重要意义。RNA一微小恤icroRNA,miRNAs)是类在细胞中高度保守的、内源性非编?一25RNA分子-码、长度约22核昔酸树佩单链小。由段长度为7080nt并具有发夹环结构的单链miRNA前体剪

6、切后生成。其广泛存在于真核生物中,主要’’’-un是与祀mRNA的3端非翻译调控区(3transltatedregion,3UTR)互补或者部分互补结合,使其降解或介导翻译抑制,从而在转录后水平调节基因的表达,具有组织巧时间的特异性,是调节其他功能基因表达的重要调控分子。miRNAs参与了生命过程中的许多重要事件,如胚胎的早期发育、细胞増殖、细胞分化、细胞调亡W及代谢、肿瘤转移等。基因芯片是20世纪90年代中期W来随着人类基因组计划快速发展起来的分子生物学高新技术,已广泛应用于疾病基因表达谱分析、寻找疾病相关基因、药物作用鞭标、肿瘤预后、复

7、杂疾病的致病机制分析等方面,为个体化诊断和治疗提供指导,也可W揭7K基因间的表达调控关系,同时它在制药和临床研究中也有重要的作用。基因莊片提供了包巧基因功能、基因相互作用等海量信息,这些数据为功能基因组研究提供了重要的资源GEO、SMD、ArraExress等数,yp据库在基因芯片的归类、储存、资源共享等方面提供有利帮助。数据是知识和信息的重要来源,对于这些数据己经无法通过简单的计算和分析来进行,因此,如何采用一些新的方法和技术来有效分析这些庞大的基因芯片,并从中挖掘和揭示蕴藏的、有意义

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