蛋白质相互作用的生物信息学研究进展new

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1、生物技术通讯N34!"##"$%&’(&)#"*+’)!),-./0123’/14’/5167884文章编号：288N;8887R7884S84;8N34;8T综述蛋白质相互作用的生物信息学研究进展任仙文，李北平，王月兰，岳俊杰，梁龙军事医学科学院生物工程研究所微生物基因组学研究室，病原微生物生物安全国家重点实验室，北京288832［摘要］生命过程的分子基础在于生物分子之间的相互作用，其中蛋白质分子之间的相互作用占有极其重要的地位。研究蛋白质相互作用对于理解生命的真谛、探讨致病微生物的致病机理，以及研究新药提

2、高人们的健康水平具有重要的作用。用生物信息学的方法研究蛋白质的相互作用已经取得了许多重要的成果，但也有很多问题还需解决。本文从蛋白质相互作用的数据库、预测方法、可预测蛋白质相互作用的网上服务、蛋白质相互作用网络等几方面，对蛋白质相互作用的生物信息学研究成果及其存在的问题做了概述。［关键词］蛋白质相互作用；生物信息学；蛋白质相互作用数据库；预测蛋白质相互作用［中图分类号］UO221V［文献标识码］W!"#$#%#&’(")’*+’#%%*,)’*-#./0)’*-#./1/-#’&(-.*/%./2.*./,*

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6、DFC/>BE>C>FGHJEDFC/>>GF=/HB=GHGHG5CG=GF@CBEHFCD0G;［6#78*’9%］9H/FGC>;9H/FGC>C>FGHEDFC/>B]LC/C>I/HKEFCDB]C>FGHEDFC/>B]9HGC>FGHEDFC/>B蛋白质相互作用几乎参与了所有的生命活动过程。从遗传生物信息学中的蛋白质相互作用所指的范畴比通常所说的物质的复制、基因的表达调控到细胞的代谢过程、

7、细胞的信号转蛋白质相互作用更加宽泛。通常所说的7个蛋白质之间存在相导，以及细胞与细胞之间的短程、远程通讯，生物体的形态形成、互作用是指这7个蛋白质在其生命周期中相互接触，接触后或病原微生物的致病、宿主对病原微生物的免疫等，蛋白质相互作者形成专性的复合体，或者在短暂的接触后又发生了分离。而生用都在其中扮演着重要的角色。近年来人们在基因组学研究中物信息学中的蛋白质相互作用除了包括这种物理相互作用发现人类和秀丽线虫的基因数目非常接近，而人和小鼠的基因（9@ABCDE0C>FGHEDFC/>）外，还包括功能意义上的相

8、互作用（I:>DJ组更是惊人地相似，这就告诉我们，生物尤其是真核生物这样的FC/>E0C>FGHEDFC/>），即相互作用的7个蛋白质之间没有直接的物复杂系统之间的差别与其说是由它们组成元件的不同决定的，理上的接触，但它们在功能上存在密切的联系，如参与同一条代还不如说是由它们组成元件之间相互作用的不同决定的。研究谢通路、构成同一个大分子机器等。依据不同的标准可以将蛋白蛋白质相互作用不仅具有重要的理论