小麦aflp片段序列多态性分析和aflp-scar标记的研究

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1、万方数据麦类作物学报2007，27(6)：943—95111竺坠竺坠!!：!!!!!竺小麦An伊片段序列多态性分析和An『P-sCAR标记的研究王立新1，常利芳1，黄岚2’1，王晓维“1，赵昌平11．北京市农林科学院／北京杂交小麦工程挂木研究中心，北京100097}2．华中农业大学生命科学技术学院，湖北武汉430070，3．内蒙占农业大学生物_亡程学院．内蒙古呼和浩特010018)摘要：为了解相同长度的AFLP片段中DNA序列的多态-雎，对70务小麦AFLP片段进行回收、克隆以厦测序分析，比较了不同品种阃相同长度的AFLP片

2、段．一夺AFLP片段的不同单克隆以厦品种问非多态性AFLP片段的DNA序列。对70十片段构成的98时同长片段进行DNA序列比对，结果表明：(1)只有3对片段的序列100％相同，其他95时片段之问DNA序列差异为1％～70“；(2)不同小麦品种问同长的AnJ片段中普遍存在DNA序列完奎不同、部分不同和具有sNP的现象；(3)一务回收的AFLP带纹的不同单克隆之闻也存在DNA序列完奎不同、部分不同和具有sNP的现象}(4)品种问有些非多态性AFLP片段的ⅡNA序列也存在多态性。揭示了小麦三套基因组阐AFLP等位基因的多态性，牲厦

3、不同AFLP位点同长片段的DNA序列多态性．对AFLP标记的使用提出了一些不同看法，井提出了利用AFLP片段的序列多志性设计scAR引物的方法。关键词：小麦；AFLP标记；多态性；AFLP—ScAR标记中圈分类号：S512．1：s330文献标识码：A文章编号：1009一104112007)06一0943一09SequencePoIymorphismofWheatAFLPFragmentsandConversionofAFLPMarkertoSCARMarkerWANCLi。xiⅡ1，CHANGLi。fhn91，HUANGLa

4、Ⅱ2～。WANGXiaorwer”，ZHAoChan}pin91(1．BeUlngEnginee^”gandTechnlqueResearchCenter。fH巾r耐wheat，BelJlng100097tchin8I2．colIegeofLlfeScI㈣andTechnoIogy，HuazhongAgrlcuIturaIUnlve咧1y．Wuhan，Hubei430070，Chin8；3．B10logyEngiDe曲ng1丁】st工tuteo¨⋯rMongolIaAgr删ltureUnI⋯5ity，Hohhot，1眦rMo

5、ng。lla010018，China)Abstmct：Amplifiedfragmentlengthpolymorphism(AFLP)isaneffIcienttechniquetojdentifyDNAfr89mentlengthp01ymo。phism，whichwaswidelyusedforgeneticdiversityanaIysis，constructionofgeneticmapsandgenesmappi“ginfu“gi，animals，plantsandinsect．Butsomeworkscould

6、notgetexpectantresultwhileamplifiedfragmentle“gthpolymorphismincludedsequencespolym。rphism，singlenucleotIdep01ymorphisms(SNPs)andinsertionsanddeletions(indel)．TounderstandDNAsequencep01ymorphismofwheatAFLPfragments，wecompared30pairfragmentsinwhicheverypairfr89ments

7、werethesamesizebutfromdifferentcultivars，andother15pairfragmentsinwhicheverypairfragmentsfr。mthesameband．Thesequencesofeverypairfragmentswerenotallidenti—cal．Thedifferenceofeachpairfragmentswere1％～70％．Evennon—p01ymorphicbandsbetweencu卜tivarscontainedmultiplefragmen

8、tsw“hsequencedifference．Inthisstudywepresentsequencediffer-encesof95pairfragmentswiththesameslzefrom64wheatAFLPbandsandtheyshould10catedif—ferent