刺参微卫星亲子鉴定应用及高温胁迫下表观遗传调控探讨

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1、上海海洋大学硕士学位论文学校代码：10264研究生学号：M110107267上海海洋大学硕士学位论文刺参微卫星亲子鉴定应用及高温胁题目：迫下表观遗传调控探讨ParentaceIdentificationUsingMicrosatelliteDNAandTheResearchon英文题目：EpigeneticRegulationUnderHighTemperatureStressinApostichopusJaponicas专业：动物遗传育种与繁殖研究方向：水产动物遗传育种姓名：李雪燕杨建敏研究员指导教师：孙国华副研究员二O一三年五月万方数据上海海洋大学硕士学位论

2、文上海海洋大学学位论文原创性声明本人郑重声明：我恪守学术道德，崇尚严谨学风。所呈交的学位论文，是本人在导师的指导下，独立进行研究工作所取得的成果。除文中已经明确注明和引用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的作品及成果的内容。论文为本人亲自撰写，我对所写的内容负责，并完全意识到本声明的法律结果由本人承担。学位论文作者签名：日期：年月日上海海洋大学学位论文版权使用授权书学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定，同意学校保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查阅或借阅。本人授权上海海洋大学可以将本学位论文的全部

3、或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文。保密□，在年解密后适用本版权书。本学位论文属于不保密□学位论文作者签名：指导教师签名：日期：年月日日期：年月日万方数据上海海洋大学硕士学位论文上海海洋大学李雪燕硕士学位论文答辩委员会成员名单姓名工作单位职称备注孙卫明烟台大学教授主席赵建民中科院烟台海岸带研究所研究员委员杜荣斌烟台大学教授委员陈建强山东省海洋资源与环境研究院秘书答辩地点山东省海洋资源与环境研究院答辩日期2014-05-22万方数据上海海洋大学硕士学位论文刺参微卫星亲子鉴定应用及高温胁迫中表观遗传调控探讨摘要一

4、、微卫星标记在刺参人工繁育中亲本识别的应用亲子鉴定最早应用于司法鉴定领域，随着其技术发展成熟，现在已经广泛地应用到动物学、植物学及生态学等相关领域。在水产动物遗传育种中，随着现代生物科技的不断发展，亲子鉴定也广泛的为良种选育、系谱追踪提供技术支持，应用亲子鉴定技术鉴别个体身份，清晰系谱信息有着极为重要的现实意义。本研究选取8个高多态性的微卫星位点，对240头刺参幼体和14头疑似亲本进行亲缘关系的鉴定。通过检测，8个微卫星位点共得到53个等位基因，平均等位基因数为6.63；观察杂合度在0.730-0.902之间；各位点的多态信息含量为0.696-0.836。通过亲

5、缘关系分析软件CERVUS3.0分析，微卫星位点累积排除概率分别为0.9934，0.9997，0.99999。基于排除法个体基因型判定，有37个子代有1个候选亲本，194个子代有2个及以上候选亲本；基于似然法判定，置信度为80%时，有198个子代个体找到最似亲本。综合排除法和似然法的亲权鉴定，成功为229个子代个体找到它们的亲本，鉴定成功率达95%以上，研究结果可为刺参良种选育中混养群体优势性状溯源、系谱明晰提供便捷可靠的工具，从而提高选育效率，有效缩短人工繁育周期，加快良种选育进程，促进刺参养殖产业的健康持续发展。I万方数据上海海洋大学硕士学位论文二、高温胁迫

6、下刺参表观遗传调控相关基因的表达分析生物体在受到逆境胁迫时，可以诱导体内的各种表观遗传修饰发生变化，它们通过调控胁迫响应基因的表达来达到改变生物体的生理状态，最终达到适应环境的目的。表观遗传变异在生物体应对逆境胁迫中发挥了重要的作用，人们希望通过对这些表型变异进行选择以达到改良生物的目标。总之，对表观遗传的进一步深入研究将有助于进一步揭示其在生物抗逆中的作用，为利用表观遗传学进行育种奠定坚实的理论基础。以刺参看家基因β-actin为内参进行校正，比较了3个表观遗传调控相关基因在刺参的呼吸树、肠、体液、肌肉组织中的表达情况。以15℃条件下的刺参为对照组，其目的基因

7、表达量为基准1，不同的基因在不同温度胁迫下的相对表达量如图所示：在体液中，DNMT1基因在18℃时表达量上升不显著，18℃到21℃时表达量上升极显著，21℃到24℃时上升不明显，30℃得到最大表达量为3.26，总体为上调表达；HDAC3基因和MLL5基因在24℃时的表达量显著，之后随着温度升高其表达量稍有升高，分别在30℃得到最大表达量为2.90和3.19。总体来看，各基因随着温度的升高其表达量都增高，上调表达趋势明显，在30℃达到最高表达量。数据显示，各基因在各组织中的表达量也有差异，在体液中的表达量最高，其次是肠、呼吸树，最低的是肌肉。在30℃的温度胁迫条件

8、下，检测在0、3、6、9