河胡杨内生细菌多样分析及一株潜在新种的多相分类学鉴定

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1、硕士研究生学位论文新疆大学论文题目（中文）：Kiyik河胡杨内生细菌多样性分析及一株潜在新种的多相分类学鉴定论文题目（外文）：DiversityofEndophyticBacteriafromthePopuluseuphraticainkiyikancientriverandtaxonomicidentificationofanovelbacterium研究生姓名：布阿依夏姆·阿木提学科专业：生物学研究方向：微生物学导师姓名职称：艾尔肯·热合曼教授论文答辩日期2013年5月24日学位授予日期年月日MagisterialThesisDiversityof

2、EndophyticBacteriafromthePopuluseuphraticainkiyikancientriverandtaxonomicidentificationofanovelbacteriumMasterDegreeCandidate:BuayshemHamoodMentor:Prof.ErkinRahmanCollegeofLifeScienceandTechnology,XinjiangUniversity摘要本研究对位于塔里木河中游废弃343年的古河道胡杨林胡杨茎秆液进行可培养内生细菌的多样性分析。三颗胡杨茎秆液混合之后采用常规培

3、养法分离得到80株纯培养物。其中25株从LB培养基，21株从NB培养基，16株从KB培养基而18株从MA培养基所分离到的。有32株杆状，45株短杆状和3株球状，17株革兰氏阳性，63株革兰氏阴性细菌。表型特征和16SrRNA基因序列系统发育分析结果显示，80株菌归类为厚壁菌门（Firmicutes）、放线菌门（Actinobacteria）、α-变形菌纲（Alphaproteobacteria）、γ-变形菌纲（Gammaproteobacteria）和拟杆菌门（Bacteroidetes）等5个类群，16个属，24个种。其中属于γ-变形菌的细菌为49株

4、，占分离菌株的61.25%（49/80）；属于厚壁菌门的细菌为15株，占分离菌株的18.75%（15/80）；属于α-变形菌纲的细菌为10株，占分离菌株的12.5%（10/80）；属于放线菌门的细菌为7株，占分离菌株的8.75%（7/80）；属于拟杆菌门的细菌为1株，占分离菌株的1.25%（1/80）。假单胞菌属(Pseudomonas)是占优势属，占分离菌株的43.75%(35/80)。在80株细菌当中发现与Pseudomonasxinjiangensis、Pseudomonassabulinigri、Pseudomonasazotifigens、P

5、seudomonaspelagia、Rhizobiumrosettiformans、Microbacteriumhydrocarbonoxydans、Microbacteriumsedminis、Halomonassulfidaeris、Halomonasmeridiana、Halomonasdesiderata、Nesterenkoniaaethiopica、Nesterenkoniasuensis、Nocardioidesalkalitolerans、Planococcusmaritimus、Pontibactersalisaro、Planomic

6、robiumkoreense和Pantoeabrenneri等模式菌株有着低于98.7%的16SRNA基因序列相似性的59株细菌。初步认为是14种潜在新分类单元，需对其进行进一步研究。对潜在新种的详细多相分类学研究结果表明，菌株KBL-4-9是短杆状，无鞭毛，严格好氧，细胞内积累类脂粒（PHB，即poly-β-hydroxybutyricacid聚-β-羟基丁酸）的革兰氏阴性菌株。生长温度是4-45℃（最适37℃），pH范围是6.0-9.0（最适pH7.0），NaCl浓度范围是0-3%（w/v）（最适是0-1%）。与Pseudomonasxinjian

7、gensisS3-3T有97.24%的16SrRNA基因序列相似性和41.2%的DNA-DNA杂交率。基因组DNA的G+Cmol%含量是60.4%。主要脂肪酸组分有C16:0、SummedFeature8、C17:0cyclo、C19:0cyclow8c、C12:0、SummedFeature3、C12:03OH和C10:03OH。基于表型特征，化学分类特征和遗传学特征分析结果，提议将菌株KBL-4-9归类为假单胞菌属的一个新物种，并命名为PseudomonasTograkense。关键词：Kiyik古河道；胡杨；内生细菌；多样性；16SrRNA；多相

8、分类学AbstractTheaimofthisstudywastoidentifythecul