微生物分类与鉴定分章

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1、2021/7/21第二章微生物分类与鉴定2021/7/22主要内容一、微生物的分类单位二、微生物的命名三、微生物分类的依据四、分类的方法五、微生物的鉴定六、微生物的常用分类系统2021/7/23一、微生物的分类单位1.微生物分类的目的：把各种微生物按照它们的亲缘关系分群归类，排成条理清楚的系统，以便于人们对微生物进行鉴定和交流。2.微生物分类的任务：分类:通过收集大量描述有关个体的文献资料，经过归纳，整理成一个科学的分类系统。鉴定:通过详细观察和描述一个未知名称纯种微生物的各种性状特征，然后查找现成的

2、分类系统，以达到对其知类，辨名的目的。命名:是为新发现的微生物确定新的学名。2021/7/243.通用分类单元种以上的系统分类单元界Kingdom(拉：Regnum)门Phylum(拉：Phylum)或Division(拉：Divisio)—亚门纲Class(拉：Classis)—亚纲—超目目Order(拉：Ordo)—亚目科Family(拉：Familia)—亚科—族—亚族属Genus(拉：Genus)种Species(拉：Species)2021/7/254.种的概念种是一个基本分类单位定义：种是

3、一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内其他种有明显差异的菌株的总称。或定义亲缘关系较近的微生物有机体的集合，它们在进化发育阶段上有一定的共同形态和生理特征。现代分类学上规定种内菌株的DNA同源性≧70%。模式种：在微生物中，一个种只能用该种内的一个典型菌株作为具体标本，它就是该种的模式种。新种：sp.nov.或nov.sp.，新被鉴定的种发表时应在其学名后标上sp.nov.的符号，新种发表前应将其模式菌株的培养物存放在一个永久性的保藏机构，并应允许人们从中取得。2021/7/26亚种(小种

4、race)（subspecies）：实验室中获得的微生物变异型称为小种或亚种。或定义：一般指其某一稳定的特征的种与模式种中不同的种,常在种名、属名的名词后写上subsp.然后再写具体亚种的名词。变种（variety）：从自然界分离到的微生物纯种，如果与典型种之间存在某些特征的差别，而这些特征又是稳定遗传的，则可将这一纯种称为典型种的变种。如枯草芽孢杆菌的黑色变种(在酪氨酸培养基上产黑色素)。是亚种的同义词（1975）已规定它在命名法中没有地位。5.种以下的分类单元2021/7/27菌株（品系)（str

5、ain）：表示任何由一个独立分离的单细胞繁殖而成的纯种群体极其一切后代。一种微生物的每一不同来源的纯培养物或纯分离物均可称为某菌种的一个菌株。某一菌种内的菌株数目几乎是无数的。菌株的名称可用字母加编号表示，字母多表示实验室、产地或特征等的名称，编号则表示序号等数字。例如，BacillussubtilisAS1.398表示枯草芽孢杆菌的蛋白酶生产菌株。“AS”为AcademiaSinica（中国科学院）的缩写。又如，BifidobacteriumbifidumATCC29521表示两歧双歧杆菌一个模式菌

6、株。“ATCC”为AmericanTypeClutreCollection（美国典型菌种保藏中心）的缩写。2021/7/28型(typeorform)：自然界存在的差异较小的同种微生物的不同类型，称为型。如结核分支杆菌依其寄主的不同可分为人型、牛型和禽型。(菌株的同义词)群（group）：有些微生物的特征介于两种微生物之间，我们把这两种微生物及其中间类型统称为一个群。(没有分类地位非正式地指定一组具有某些共同性状的生物)如大肠菌群。相（phase）：自然界存在的微生物交互变异的一定阶段；态（state

7、）：通常指微生物的菌落变异状态。2021/7/29二、微生物的命名1.学名（scientificname）按照《国际细菌命名法规》命名的、国际学术界公认并通用的正式名字。命名的方法：国际法规命名，即林奈氏所创立的双(三)名法。双名法的规则：学名=属名+种名加词+（首次定名人）+现名定名人和鲜明定名年份由两个拉丁字或希腊字或拉丁化了的其它文字组成，属名（genericname）为名词,单数,开头字母大写，是该微生物的主要特征。种名加词（specificepithet）(adj.),首字小写,为形容词,是

8、该微生物的次要特征。在出版物中用斜体，书写时在学名下划横线以表示斜体。2021/7/210例1．大肠埃希氏杆菌（简称大肠杆菌）：Escherichacoli（Migula）CastellanietChalmers1919例2．枯草芽孢杆菌（简称枯草杆菌）:Bacillussubtilis（Ehrenberg）Cohn1872例3．金黄色葡萄球菌：StaphylococcusaureusRosenbach1884出现在分类学文献中的学名，在此两者之后往往还