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时间:2018-11-18
《dgat1基因k378n多态性与2型糖尿病及糖尿病肾病的关系论文》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在工程资料-天天文库。
1、DGAT1基因K378N多态性与2型糖尿病及糖尿病肾病的关系论文刘海龙,江华,张菊,焦凯【关键词】糖尿病肾病Studyondiacylglycerolacyltransferase1geneK378Npolymorphismintype2diabetesmellitusanddiabeticnephropathy【Abstract】AIM:ToinvestigateorphismrelatestoChinesetype2diabetesmellitus(T2DM)anddiabeticnephropat
2、hy(DN).METHODS:GeneK378NpolymorphismintheDGAT1geneplatedirecteddyeterminatorincorporationalcontrols.RESULTS:IntheT2DMgroup,therealcontrols(P0.05).Thereaynotbeassociatedellitus,type2;diabeticnephropathies;polymorphism,singlenucleotide;diacylglycerolacyltr
3、ansferase1;templatedirecteddyeterminatorincorporationega公司.核酸外切酶I、虾碱性磷酸酶、AcycloDNA聚合酶和荧光偏振检测仪Victor2购自PerkinElmer公司.荧光标记终止子AcycloTerminatorsTM(AcycloGTPR110/AcycloCTPTAMRA)为PerkinElmer公司专利产品.DNA引物5′CACACCCCACCTACCTGATGC3′及5′CCTGGGGGCTGGGATGG3′;探针5′CTTCTG
4、GCAGAACTGGAA3′由上海博亚生物技术有限公司合成.1.2方法1.2.1DNA引物及探针设计根据引物设计的基本原则,应用DNAStar软件,结合TDIFP反应的特殊要求设计引物及探针.引物与探针序列不能重叠,探针的3′末端必须紧邻待测变异基因位点.特异性寡核苷酸探针及与变异碱基对应互补末端掺入的特异碱基GTP/CTP是基于DGAT1基因扩增片段内的序列及变异碱基设计的,扩增靶片段长度为140bp(Fig1).1.2.2DNA的提取及PCR扩增用标准酚/氯仿法由周围血白细胞内提取基因组DNA.取D
5、NA模板5μL,dNTP150μmol/L,引物各0.25μmol/L,MgCl22.0mmol/L,TaqDNA聚合酶16.67nkat,反应体系共25μl.PCR条件:95℃4min;94℃30s,52℃40s,72℃30s,40个循环;72℃5min,扩增靶片段DNA.标本DNA经扩增后所得产物用20g/L琼脂糖凝胶电泳检测.将经回收、连接、转化、筛选、测序正确的发生和未发生变异的质粒DNA作为阳性和阴性标准品.1.2.3DGAT1K378N基因多态性的检测鉴定采用TDIFP方法对扩增产物中K37
6、8N变异碱基进行检测.首先消化处理:虾碱性磷酸酶和核酸外切酶Ⅰ混合物与PCR产物37℃孵育2h,可分别降解PCR产物中残余的dNTPs和引物,避免对后续反应的干扰;而后80℃热处理15min灭活酶.以此产物为模板与探针结合,再以AcycloGTPR110和AcycloCTPTAMRA这两种荧光标记终止子为底物,在AcycloDNA聚合酶及其缓冲液中于95℃2min,然后95℃15s,50℃30s,25个循环杂交延伸,最后15℃延伸10min,4℃保存.PCR产物模板与探针互补杂交,与模板互补的游离荧光标
7、记终止子AcycloG/CTP掺入到探针末端,荧光素分子量增加,在荧光偏振检测仪上分别检测AcycloGTPR110(波长535nm)和AcycloCTPTAMRA(波长595nm)的荧光偏振(FP)值,据两种荧光的FP值,推断变异碱基类型.统计学处理:正态分布资料用x±s表示,各组间基因型及等位基因频率比较采用χ2检验,组间均数比较采用t检验(方差不齐时用t′检验)或方差分析,疾病危险因素分析采用二分类Logistic回归,整个统计分析用SSPS11.0软件处理.2结果2.1临床特征DN+组和DN-与
8、正常对照组的性别(Sex)、年龄(Age)、体质指数BMI,均无显著差异(P0.05),DN+组和DN-的收缩压(SBP)及舒张压(DBP)水平高于正常对照组(P0.05),并且DN+组收缩压高于DN-组(P0.05,Tab1).表1各组临床特征比较(略)2.2生化特征DN+组和DN-与正常对照组的血胆固醇(CHOL)、高密度脂蛋白(HDL)等均无显著差异(P0.05),DN+组和DN-组的TG水平高于正常对照组(P0.05,Tab2).表
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