猪巨细胞病毒感染猪多器官microRNA表达谱的研究

猪巨细胞病毒感染猪多器官microRNA表达谱的研究

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时间:2018-10-30

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1、分类号S852.65+9.1学号B201219O3?,*■l-;V:/..V--..、...^1?JC.V-'?''*?■■-.,fAiSICHUANAGRICULTURALUNIVERSITY'1**.?>r?-V::_.博士学位论文猪巨细胞病毒感染猪多器官microRNA表达谱的研究‘i刘骁指导教师徐志文教授^.专业名称预防養医、'1T:."'■?*'-?\?.

2、.-,f,--.i..,,.-?\..,"?W'--■?....,_研究方向动物传染病病原分子生物学r_:多论文独匍性声明本人郑重声明:所呈交的学位论文是我个人在导师指导下进行研究工作所取得的成果。尽我所知,除了文中特别加以标注和致谢的地方外,学位论文中不包含其他个人或集体已经发表或撰写过的研究成果,也不包含为获得四川农业大学或其它一教育机构的学位或证书所使用过的材料。与我同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表

3、示了谢意。’又?M年?研究生签名?减月丫曰关于论文使用授权的声明本人完全了解四川农业大学有关保留、使用学位论文的规定:,即学校有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版,允许论文被査阅和借阅,可以采用、缩印或扫描等复制手段保存。影印、汇编学位论文同意四川农业大学可以用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容。以本论文不保密。□本论文保密,在_年解密后适用本授权。“”(请在以上□内划V)研究生签名:%一年M月q日导师签名:年月日猪巨细胞病窶感染猪多器官

4、microRNA表达谱的研究中文摘要猪巨细胞病毒(Porcinecytomegalovirus,PCMV)属于巨细胞病毒属,疱疹病毒科,p疱y疹病毒亚科。猪巨细胞病毒具有二十面体结构并具有双链线状DNA基因组。PCMV已经在世界各地广泛流行,包括中国、英国、德国、美国、日本在内的国家都己证实了PCMV一。的流行,并对养殖业造成严重威胁PCMV是种免疫抑制病毒,主要抑制T淋巴细胞及巨噬细胞系统免疫功能,但其对免疫系统抑制的机制并不明确。为了研究PCMV对宿主免疫器官功能的潜在影响,我们使用转录组芯

5、片技术对PCMV感染的重要猪中枢免疫器官胸腺的转录物组进行了检测,并使用健康猪胸腺作为对照。本研究结果表明,相对正常猪胸腺PCMV感染的胸腺中5582种基因发生显著差异性表达,其中2161种基因表达显著上调,而3421种基因表达显著下调。本研究使用PCR对13种显实时荧光定量著差异性表达的免疫相关基因进行了检测,并使用一Western-btlo技术进步对这些基因表达的蛋白进行了验证。对PCMV感染胸腺中差异性表达基因的基因功能注释分析(Geneontoloanalysis、基因调控网络分析Genegy

6、)(interactionnetworkanalysis、及KEGG通路分析结果均表明,PCMV感染广泛影响包括)-免疫系统、TGFTNF-a信号通路在内、细胞代谢过程P信号通路、淋巴受体信号通路、的大量免疫相关信号通路。一MicroRNAmRNA1-24tRNA。i是种在真核生物中广泛存在的长度为8n的非编码()而成熟miRNAs对发育、造血作用、细胞分化、细胞凋亡、增殖、脂肪代谢、癌症、信号转导等诸多生命过程都发挥着重要调控作用。为了研究miRNA在PCMV感染免疫抑制过程中发挥的调控功能,本

7、研究利用Illumina/Solexa技术对感染PCMV的猪肺脏、肝脏、胸腺、肾脏、脾脏及健康猪对应器官进行高通量测序,并对miRNA。、、RNA表达谱进行了综合分析测序结果显示,胸腺、肺脏肾脏脾脏及肝脏mi表达谱中共发现601种成熟mRNAs295i表达,其中有种为未录入miRNA数据库的新miRNAs。本PCMV感mNA研究从染的多种器官和多种正常器官iR高通量测序表达谱--中挑选12种miRNAs使用StemlooRTPCR检测手段对其表达进行验证,结果显示¥pq一12种指定miRNA高通量测序与

8、荧光定量PCR检测结果基本致。基因功能注释分析(GeneOntology,GO)结果表明PCMV感染器官中显著差异性表达的miRNAs靶基因功能均集中于免疫系统过程(immunesystemprocess、细胞过程(cellularr

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