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1、牡丹论文：牡丹EST-SSR引物开发及其亲缘关系分析【中文摘要】牡丹(PaeoniasuffruticosaAndrews.)花大形美,色艳香浓,不仅具有很高的观赏价值,而且还有极高的药用价值。其种质资源极为丰富,种质资源的保存和评价是其利用的重要前提,其分子水平上的遗传多样性研究已取得了较大进展。但是,在揭示种间、种内及品种群间遗传关系和栽培牡丹起源问题上并未取得一致性结论。因此,开发适用于牡丹的EST-SSR标记应用于牡丹遗传图谱的构建、物种间亲缘关系鉴定、辅助育种等方面具有重要意义。利用公共数据库中数量增加的表达序列标签(expressedsequencetag,EST)资源来开发微卫星
2、分子标记(SimpleSequenceRepeat,SSR)已广泛地应用在许多动植物的基因组分析。EST-SSR是通过对EST序列进行分析,找到含有重复单元的位置,在两侧设计引物而开发得到的,因此,EST-SSR反映基因的编码部分,可直接获得基因的表达信息,并可对一些重要性状进行直接鉴定。本研究利用NCBI数据库中牡丹EST序列信息,在了解牡丹EST的SSR信息的基础上,首次建立了牡丹EST-SSR标记,同时利用筛选出的29对引物对55份牡丹品种亲缘关系...【英文摘要】Treepeoniesarefamousornamentalflowersallovertheworldbecauseits
3、flowerislarge,bright-coloredandstrongfragrance.Theyarenotonlyhavehighornamentalvalue,butalsoahighmedicinevalue.Therearesomanycultivarsandthegermplasmresourcesareveryabundant.Theconservationanduseofevaluationisanimportantprerequisiteforuse.Thegeneticrelationshipatthemolecularlevelresearchhasmadegreat
4、progress.However,inrevealingthegeneticrelationshipsofinterspecificspecies...【关键词】牡丹EST-SSR引物聚类分析亲缘关系【英文关键词】TreePeonyEST-SSRprimerClusteranalysisGeneticrelationship【索购全文】联系Q1：138113721Q2：139938848【目录】牡丹EST-SSR引物开发及其亲缘关系分析摘要2-4ABSTRACT4-5符号表6-9第1章文献综述9-231.1牡丹概述91.2分子标记概述9-131.2.1RFLP标记10-111.2.2RAPD标
5、记111.2.3AFLP标记111.2.4SNP标记11-121.2.5ISSR标记121.2.6SSR标记12-131.3SSR分子标记研究发展131.4EST-SSR分子标记的研究发展13-201.4.1EST分子标记的类型14-151.4.2EST分子标记的特点151.4.3EST分子标记的开发策略15-171.4.4EST-SSR的频率及特点171.4.5EST-SSR标记在植物比较基因组学上的应用17-191.4.6EST-SSR标记在基因功能上的应用191.4.7EST-SSR标记的发展趋势及前景19-201.5本文的研究内容与意义20-231.5.1选题的依据20-211.5.2
6、研究的目的及意义21-221.5.3研究的技术路线22-23第2章牡丹EST资源的SSR信息分析及引物开发23-312.1材料与方法23-242.1.1牡丹EST序列的来源23-242.1.2牡丹EST序列的前期处理242.1.3SSR位点的筛选242.1.4牡丹EST-SSR引物开发242.2结果与分析24-282.2.1牡丹EST-SSR的发掘242.2.2牡丹EST-SSR的频率和分布密度24-252.2.3牡丹EST中SSR的基元类型及比例25-262.2.4牡丹EST-SSR的重复次数26-272.2.5牡丹EST-SSR的重复长度272.2.6牡丹EST-SSR引物的开发27-28
7、2.3讨论28-31第3章部分牡丹品种的亲缘关系分析31-443.1材料与方法31-363.1.1试验材料31-323.1.2试验仪器及试剂32-333.1.3试验方法33-363.2结果与分析36-413.2.1基因组DNA的质量检测363.2.2多态性EST-SSR引物的筛选36-373.2.3EST-SSR扩增产物多态性分析37-383.2.4聚类分析38-41第4章结论与讨论414.1结论
