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时间:2018-08-01
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1、CYP1A1基因多态性作者:刘芳孙黎杨翠军李华刘开扬【摘要】目的探讨张家口地区健康人群CYP1A1基因MspI和Ile/Val的多态性。方法采用等位基因特异性扩增和PCR限制性片段长度多态性(RFLP)技术,分析360例张家口地区健康成人的CYP1A1基因3′端限制性内切酶MspI位点和Exon7位点的3种基因型的分布规律。结果张家口健康人群MspI基因型m1m1占35.8%,基因型m1m2占50.2%,基因型m2m2占14.0%,等位基因m1m2分别为60.9%,39.1%。Ile/Val多态性,其Ile及Val等位基因的频率分别为68
2、.5%,31.5%。Ile/Ile,Ile/Val,Val/Val基因型分布频率分别为44.4%,48.1%,7.5%。结论张家口地区健康人群CYP1A1基因存在MspI和Ile/Val的多态性。【关键词】CYP1A1;MspI;Ile/Val;基因多态性 CYP1A1是细胞色素P(CYP)450家族的一名成员,是体内重要的Ⅰ11相解毒酶之一,参与多种内外源性化学物质体内代谢过程〔1〕。CYP1A1由CYP1A1基因编码,CYP1A1表达受基因控制和环境因素诱导,并存在种族和个体差异。主要分布于肺、肾、胃肠道、皮肤、胎盘等组织中,参与内源
3、性和外源性化合物在体内代谢过程,主要通过氧化、还原、水解等作用,改变化合物所具有的功能基团。或使其分解。CYP1A1主要参与多环芳烃类化合物(PAH)的代谢,把其代谢为酚类物质活性很强的环氧化物,这些环氧化物在致癌、致突变中都有重要作用〔2,3〕。目前为止,已发现CYP1A1基因MSPI和Ile/Val多态在不同的种族、民族和地区的分布有很大差异。本试验采用聚合酶链反应限制性片段长度多态性(PCRRFLP)的技术,探讨张家口地区健康人群CYP1A1基因的MspI和Ile/Val多态性分布。 1材料与方法 1.1研究对象 随机选择3
4、60例无血缘关系的健康张家口地区人员,均在原籍稳定居住2代以上,年龄18~55岁。经张家口河北北方学院第一附属医院门诊查体健康,无遗传疾病的健康人群。其中男性186例,女性174例。 1.2标本收集 从上述人群中每人抽取外周静脉全血3ml,EDTA抗凝,-80℃保存待测。 1.3基因组DNA的制备11 DNA提取试剂盒提取DNA。 1.4PCR反应 1.4.1MspI基因型测定 采用等位基因特异性扩增方法PCRRFLP技术,MspI基因型测定所需引物,其序列为上游5′CAGTGAAGAGGTGTAGCCGCT3′,下游5
5、′TAGGAGTCTTGTCTCATGCCT3′。PCR的反应条件:反应总体积50μl,含有200μmol/LdNTP,上、下游引物各0.4μmol/L,基因组DNA0.4μg,1UTaqDNA聚合酶。在PCR仪上扩增,扩增参数:97℃预变性7min,然后95℃,50s,66℃复性50s,72℃延伸1min,30个循环后72℃延伸10min。其PCR产物为340bp的DNA片段。取10μlPCR产物,加10UMspI限制性内切酶,37℃水浴4h,酶切产物经1.8%琼脂糖凝胶(含0.5μg/ml溴化乙锭)电泳40min,电压150V,在紫
6、外透射仪上观察结果。 1.4.2Ile/Val多态性测定 采用等位基因特异性扩增方法PCRRFLP技术,分析Ile/Val多态性,引物序列:上游5CTGTCTCCCTCTGGTTACAGGAAGC311′,下游5′TTCCACCCGTTGCAGCAGGATAGCC3′。反应体系同上,扩增参数:95℃预变性5min,然后95℃,30s,63.5℃复性30s,72℃延伸30s,30个循环后72℃延伸7min。其PCR产物为204bp的DNA片段。取10μlPCR产物,加10UBsrDI限制性内切酶,25℃水浴24h,酶切产物观察同
7、上。 1.5CYP1A1多态性 1.5.1MspI基因型 扩增产物经酶切后分为3种基因型:没有MspI切割位点的等位基因m1的纯合子基因型m1m1(野生型),可见340bp一个片段;有MspI切割位点的等位基因m2的纯合子基因型m2m2(突变型),可见200及140bp两个片段;m1和m2的杂合子基因型m1m2(杂合型),可见340,200,140bp三个片段。 1.5.2Ile/Val多态性 扩增产物经酶切后分为3种基因型:没有切割位点为纯合子基因型Ile/Ile(野生型),可见204bp一个片段;有BsrDI切割位点的等位基因
8、Val/Val的纯合子基因型(突变型),可见65及139bp两个片段;Ile/Val(杂合型),可见204,139,65bp三个片段。11 1.6统计学方法 采用SPSS软
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