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1、学年论文(设计)(本科)学院生命科学专业生物科学年级姓名论文(设计)题目SARS冠状病毒PLpro蛋白酶的结构指导教师职称成绩2014年10月19日目录摘要……………………………………………………………………………1关键词………………………………………………………………………………………1Abstract……………………………………………………………………………………1KeyWords…………………………………………………………………………………1前言………………………………………………………………
2、………………………………1一SARS冠状病毒nsp3蛋白的拓扑学……………………………………2二SARS冠状病毒PLpro蛋白酶结构……………………………………21、PLpro单体结构……………………………………………………………32、PLpro催化位点的结构……………………………………………………33、PLpro催化位点的结构………………………………………………………3四结语………………………………………………………………………………4参考文献………………………………………………………………………
3、……4SARS冠状病毒PLpro蛋白酶的结构姓名:学号:院系:专业:指导老师:职称:摘要:SARS冠状病毒基因组编码,2种病毒蛋白酶,即木瓜样蛋白酶(PLpro)和3C样蛋白酶.其中,PLpro蛋白酶结构与功能研究是近年来冠状病毒分子生物学研究的热点之一.PLpro蛋白酶参与SARS冠状病毒1a(1ab)复制酶多聚蛋白N端部分的切割加工,是SARS冠状病毒复制酶复合体(RC)形成的重要调节蛋白分子.关键词:SARS冠状病毒;PLpro蛋白酶Abstract:Severeacuterespirator
4、ysyndrome(SARS)coronavirusgenomeencodestwoviralproteases:apapain-likeprotease(PLpro)anda3C-likeprotease(3CLpro).PLprohasproteolyticactivityinthecleavageandprocessingofN-terminalsofreplicaseproteinpp1a(pp1ab)toreleasetheprocessedproductsofnonstructuralp
5、roteins1tonsp3,whichplaysanimportantregulatoryroleinassemblingofSARScoronavirusfunctionalreplicasecomplex(RC)onintracellularmembrane.Keywords:SARScoronavirus;papain-likeprotease前言:SARS(severeacuterespiratorysyndrome)冠状病毒是2003年新出现的引起人类急性呼吸道综合症的一种高致病性呼吸道
6、病原,由WHO命名,感染死亡率约10%.虽然通过病例隔离等强有力公共卫生措施扑灭SARS冠状病毒感染后直至目前无感染病例出现,但由于SARS冠状病毒传播的中间宿主(果子狸和蝙蝠等)的存在,还无法预测SARS病毒是否还会在人类中再出现.SARS冠状病毒基因组是2917kb的正义单链RNA,基因组的前2/3部分翻译2个大的复制酶多聚蛋白pp1a和pp1ab.在木瓜样蛋白酶和3C样蛋白酶作用下,将其切割成16个非结构蛋白nsp1~16,经组装产生1个多功能、膜结合的复制酶复合体,由复制酶复合体介导完成病毒
7、基因组的复制和结构基因的转录翻译.不同于其他大多数冠状病毒,SARS冠状病毒只编码1个PLpro.SARSPLpro特异性识别多聚蛋白pp1aN端nsp1~2、nsp2~3和nsp3~4之间的LXGG序列,参与1a复制酶蛋白N端的切割加工并释放成熟产物nsp1,nsp2和nsp3.SARS冠状病毒PLpro蛋白酶由其基因组的非结构基因nsp3编码,其基本生物学活性为蛋白酶活性.1SARS冠状病毒nsp3蛋白的拓扑学SARS冠状病毒表达2个大的复制酶多聚蛋白,病毒编码的蛋白酶可将复制酶多聚蛋白切割成1
8、6个成熟的非结构蛋白(nsp).其中nsp3编码的PLpro蛋白酶负责切割释放nsp1、nsp2和nsp3.其它非结构蛋白都是由nsp5编码的3C样蛋白切割而来.水解产生16个切割产物聚集在一起形成膜结合的复制酶复合体.虽然复合体如何组装还是个未知的问题,但可确定非结构蛋白(nsp)中的跨膜成员负责复制酶复合体在膜上的定位.在冠状病毒16个非结构蛋白中已预测nsp3、nsp4和nsp6为跨膜蛋白.nsp3的3个疏水结构域中只有2个跨膜,nsp6的7个疏水结构域中6个跨