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时间:2018-05-19
《实验一原核生物基因组dna的制备》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、实验一、原核生物基因组DNA的制备一、实验目的1、掌握从细菌中提取基因组DNA的基本原理2、熟悉利用试剂盒提取细菌基因组DNA的技术流程3、提取卡介苗BCG基因组DNA二、实验原理①裂解细胞②除去蛋白质③析出DNACTAB(cetyltriethylammoniumbromide,十六烷基三乙基溴化铵)是一种去污剂,它能与核酸形成复合物,这些复合物在高盐溶液(0.7mol/lNaCl)中可溶并且稳定存在。此时的高盐溶液中除含有CTAB-核酸复合物外,还含有大量的多糖和蛋白。核酸提纯(1)用氯仿先对
2、此高盐溶液进行抽提,大量蛋白和多糖等被从溶液中抽提沉淀出来,而核酸仍留在溶液中;接着可用乙醇或异丙醇将核酸从溶液中沉淀出来,然后用水或TE缓冲液等将核酸溶解。(2)降低溶液中盐的浓度(0.3mol/lNaCl),CTAB与核酸的复合物就会因溶解度降低而沉淀出来,而大部分的蛋白及多糖仍溶于溶液中;通过离心将CTAB-核酸沉淀下来,然后溶解于高盐溶液中。三、实验材料卡介苗BCG细菌基因组DNA提取试剂盒(离心柱型)DP302水浴锅、离心机、移液器试剂盒采用可以特异性结合DNA的离心吸附柱和独特的缓冲液
3、系统提取细菌基因组DNA。离心吸附柱中采用的硅基质材料为特有新型材料,可高效、专一吸附DNA,最大限度去除杂质蛋白及细胞中其他有机化合物。回收的DNA可适用于各种常规操作,包括酶切、PCR、文库构建等实验。四、实验步骤(1)取细菌培养液1-5ml,10,000rpm,1min,尽量吸净上清。(2)沉淀中加入180μl溶菌酶溶液(20mg/ml),37℃,60min。(3)加入20μl蛋白酶K溶液,混匀。(4)加入220μl缓冲液GB,振荡15s,70℃,10min,溶液变澄清。瞬时离心以去除管盖内
4、壁的水珠。(5)加入220μl无水乙醇,充分振荡15s,此时可能会出现絮状沉淀,瞬时离心以去除管盖内壁的水珠。(6)将上一步所得溶液和絮状沉淀都加入一个吸附柱CB3中(吸附柱放入收集管中),12,000rpm,30s,弃废液,将吸附柱CB3放入收集管中。(7)向吸附柱CB3中加入500μl缓冲液GD,12,000rpm,30s,弃废液,将吸附柱CB3放入收集管中。(8)向吸附柱CB3中加入600μl漂洗液PW,12,000rpm,30s,弃废液,将吸附柱CB3放入收集管中。(9)重复步骤⑧。(10
5、)将吸附柱CB3放回收集管中,12,000rpm,2min,弃废液。将吸附柱CB3室温放置数分钟,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液。(11)吸附柱CB3转入一个干净的离心管中,向吸附膜的中间部位悬空滴加100μl洗脱缓冲液TE,室温放置2-5min,12,000rpm,2min,将溶液收集到离心管中。(为增加基因组DNA的得率,可将离心得到的溶液再加入吸附柱CB3中,室温放置2min,12,000rpm,2min)五、实验结果与分析本次实验提取到细菌基因组DNA,用于下次实验的PCR扩增。六、思考
6、题1.操作第(4)步骤的时候,溶液是否变得清亮?如果没有,试分析原因及可能对实验结果产生的影响。解:第四步时,溶液变得清亮。如果溶液没有变澄清,可能是离心不够。2.试分析漂洗液PW的成分,在第(10)步骤中,如果漂洗液没有充分晾干,会导致什么样的后果?解:漂洗液的主要成分是乙醇,如果没有充分晾干,乙醇会影响到酶的活性,对下一步的PCR、酶切都有影响。生工1002班吕孝敏102201212
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