利用基因芯片分析孕妇外周血浆apc基因甲基化的初步研究

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1、利用基因芯片分析孕妇外周血浆APC基因甲基化的初步研究作者:黄钧，葛芹玉，蒋犁，蒋小青，陆祖宏【摘要】目的研究孕妇外周血浆中APC基因甲基化模式与孕妇妊娠状态的关系，探讨其应用于无创性产前诊断的可行性。方法从不同妊娠时期孕妇和健康未孕妇女外周血浆标本中提取APC基因，经过亚硫酸氢钠转化后，利用基因芯片方法检测分析APC基因启动区一组CpG位点的甲基化模式，并对不同妊娠时期以及健康未孕样品进行了分析比较。结果健康未孕妇女血浆中APC基因是未甲基化或低甲基化的，而在妊娠状态下是高甲基化状态的，但不同妊娠时期甲基化程度有所不同。结论孕

2、妇外周血浆APC甲基化模式的变化与妊娠状态和时间均有一定的关系，基因芯片方法可以高通量的检测分析血浆DNA甲基化状态。血浆DNA甲基化的分析进一步应用于无创性产前诊断具有可行性。【关键词】无创性产前诊断；DNA甲基化；基因芯片；APC基因AmicroarraytoanalyzemethylationpatternoftheAPCgeneinmaternalplasmainpregnantan【Abstract】ObjectiveDetectionoftherelationshipbetethylationpatternofthe

3、APCgeneinmaternalplasmainpregnantanandthestateofpregnancy，andestimationthepotentialitythatapplicatetononinvasiveprenataldiagnosis.MethodsPlasmaDNAperipheralbloodofpregnanten，thenafterbisulphate-treat，themethylationpatternofCpGsiteintheAPCpromotericroarray-basedmethod

4、.Themethylationpatternofdifferentialstagesinpregnantenandnonpregnantenicroarray.ResultsThemethylationpratternofCpGsiteintheAPCpromoterinhealthynonpregnantenaredenselymethylationandinpregnantenarehypomethylationorunmethylation.Thedegreeofmethylationinpregnantenaredist

5、inction.ConclusionTherearerelationshipbetethylationpatternoftheAPCgeneinmaternalplasmainpregnantenandthepatternofthedifferentialstagesandtimesofpregnancy.TheDNAmicroarraycanbeappliedasahighthroughputtooltomapmethylationpatternsinCpGislandsites.TheanalysisofDNAmethyla

6、tioninplasmaethylation;noninvasiveprenataldiagnosis;genemicroarray;APCgene1997年，Lo等［1］首次报道在母体血循环中发现了游离胎儿DNA，证实了母体血浆中的DNA是胎儿和母体DNA的混合体，这一发现为无创性产前诊断开辟了新的方法。但以往对孕妇外周血中游离胎儿DNA的应用大多局限在检测胎儿从父亲一方继承来的基因或突变，且检测的胎儿基因必须能与母亲DNA序列显著区分开来。2002年，Poon等［2］利用后生性标志，如胎儿与母体DNA甲基化的差异来区分两者，

7、冲破了上述限制，这种表遗传上的差异为无创性产前诊断提供了新的思路。但是，对在妊娠与未孕妇女外周血浆中基因甲基化模式是否存在一定的关系，在不同妊娠期之间孕妇血浆中基因的甲基化模式是否存在一定关系等问题，目前还没有报道。正常妊娠时，细胞滋养层细胞侵入子宫蜕膜及其脉管系统，其发生在妊娠8～18周之间，侵入过程与癌细胞在转移的时候有一些相似，因为细胞必须通过基底层。先兆子痫的发病机制可能与滋养层细胞在妊娠前3个月侵入子宫肌层失败有关。Muller等［3］发现妊娠妇女和转移性乳腺癌病人在APC基因甲基化的改变上存在相似性。因此，本实验选择

8、APC基因作为研究对象。本实验以妊娠不同时期APC基因启动区不同CpG位点甲基化模式为基础，通过基因芯片对其变化规律进行探索性研究，寻找出它们之间的差异，以期可以作为生理或疾病状态的标志物，并进一步应用于无创性产前诊断。1资料与方法1.1研究对象从2005年5月