荫蔽胁迫下大豆茎秆形态建成的转录组分析

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1、作物学报ACTAAGRONOMICASINICA2016,42(9):13191331http://zwxb.chinacrops.org/ISSN0496-3490;CODENTSHPA9E-mail:xbzw@chinajournal.net.cnDOI:10.3724/SP.J.1006.2016.01319荫蔽胁迫下大豆茎秆形态建成的转录组分析11,*11123任梦露刘卫国刘婷杜勇利邓榆川邹俊林袁晋1,*杨文钰12四川农业大学生态农业研究所/农业部西南作物生理生态与耕作重点实验室,四川成都611130;彭州市农村发展局,四川彭州3611930;成都市种子管理站,四川成

2、都,610041摘要:玉米-大豆套作种植模式是国家农业重点推广技术,研究该模式下大豆茎秆对荫蔽胁迫响应的分子机制将有助于大豆耐荫性的分子遗传改良。利用转录组测序技术分析荫蔽胁迫对南豆12和南032-4大豆茎秆转录基因表达的影响,结果表明,荫蔽条件下,南豆12和南032-4分别有287个和110个差异转录基因,皆以上调为主。基因功能注释分析显示,这些基因主要富集于次生细胞壁的生物起源、多糖的合成、钙调素结合和水解酶活性等生物过程中。荫蔽条件下,南豆12响应木质素、生长素合成的相关基因上调,南032-4响应茉莉酸、乙烯合成的相关基因上调,响应赤霉素代谢的相关基因则下调,但南豆12表

3、现出更多的差异转录基因。大豆茎秆积极响应荫蔽信号,增加茎秆细胞壁多糖,加快次生细胞壁的生成,从而阻碍茎秆横向生长,使大豆茎秆变细,同时增加水解酶活性,加快细胞的松弛,使大豆茎秆伸长。南豆12和南032-4也通过各自特有的差异转录基因响应荫蔽,但南豆12通过更多地增加细胞壁多糖、木质素含量以及对生长素的响应等来增加茎秆强度,保持茎秆一定的形态优势,最终提高自身抗倒伏能力,表现出对荫蔽更强的适应性。关键词:大豆;套作;荫蔽胁迫;茎秆;转录组TranscriptomeAnalysisofStemMorphogenesisunderShadeStressinSoybean11,*111

4、23RENMeng-Lu,LIUWei-Guo,LIUTing,DUYong-Li,DENGYu-Chuan,ZOUJun-Lin,YUANJin,and1,*YANGWen-Yu1InstituteofEcologicalAgriculture,SichuanAgriculturalUniversity/KeyLaboratoryofCropEcophysiologyandFarmingSysteminSouthwest23China,MinistryofAgriculture,Chengdu611130,China;BureauofRuralEconomicDevelopm

5、entofPengzhouCity,Pengzhou611930,China;TheSeedManagementStation,Chengdu610041,ChinaAbstract:Maize–soybeanrelay-croppingsystemisakeytechnologyinagriculture,studyingthemolecularmechanismsforshadestressresponsesofsoybeangrownintheintercroppingsystemwillbeusefulforsoybeanimprovementbygeneticmani

6、pulation.Anexperimentwasconductedusingtwodifferentshadesusceptivesoybean(GlycinemaxL.)varietiesNandou12andNan032-4toinvestigatethetranscriptomechangesinresponsetoshadestressbyRNA-seqtechnology.Theresultsindicatedthat287differ-entiallyexpressedgenesinNandou12and110genesinNan032-4weresignifica

7、ntlyaffectedbyshade,andtheexpressionofthegeneswasmainlyup-regulated.Geneontologyanalysesshowedthatdifferentiallyexpressedgeneswereenrichedinsecondarycellwallbiogenesis,polysaccharidessynthesis,calmodulinbinding,hydrolaseactivityandsoon.Intheshadetr