臭氧胁迫诱导的水稻转录组变化的研究

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1、分类号:单位代码:10140密级:公开学号:4031531841疫婁六夸LIAONINGUNIVERSITY硕士学位论文THESISFORMASTERDEGREE中文题目:臭氧胁迫诱导的水稻转录组变化的研究TranscriptomeAnalyseoftheResponseto英文题目:OzoneStressinRice论文作者:赵宸指导教师:王红艳副教授专业:植物学完成时间一:二〇八年五月申请辽宁大学硕士学位论文臭氧胁迫诱导的水稻转录组变化的研究TranscriptomeAnalyseoftheRes

2、ponsetoOzoneStressinRice作者:赵宸指导教师:王红艳副教授专业:植物学答辩日期:2018年5月21日二○一八年五月·中国辽宁辽宁大学学位论文原创性声明本人郑重声明:所呈交的学位论文是本人在导师的指导下独立完成的。论文中取得的研究成果除加以标注的内容外,不包含其他个人或集体已经发表或撰写过的研究成果,不包含本人为获得其他学位而使用过的成果。对本文的研究做出重要贡献的个人和集体均已在文中进行了标注,并表示谢意。本人完全意识到本声明的法律结果由本人承承担。学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定,同意学校保留并向国家有关部门

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4、性的死亡,对植物造成伤害,并且会导致水稻等粮食作物产量降低。臭氧诱导的植物体内分子应答机制尚不明确,近年来由于生物信息学的快速发展,越来越多的人采用反向遗传学对胁迫响应机制进行研究。水稻生长期与大气中臭氧浓度的峰值期重叠,因此在水稻中探寻植物响应臭氧的分子机制比较具有代表性。之前我们的研究表明不同浓度臭氧对水稻造成的伤害不同,为了进一步了解水稻响应不同浓度臭氧的分子机制,本研究以水稻品种日本晴(OryzaSativa)为材料,运用开顶箱(OTC)的方法模拟臭氧胁迫条件,对80nmol·mol-1,160nmol·mol-1和200nmol·mol-1浓度下水稻转录组进行研究。

5、研究发现:1.在80nmol·mol-1,160nmol·mol-1和200nmol·mol-1臭氧处理后的水稻叶片中分别得到1435,3777和4463个差异表达基因。2.在处理过程中160nmol·mol-1-和200nmol·mol-1基因表达模式聚为一类,80nmol·mol-1聚为另一类,表明在处理过程中80nmol·mol-1浓度下的水稻受到胁迫的程度与基因表达的变化都与160nmol·mol-1和200nmol·mol-1不同。3.在10d时,80nmol·mol-1,160nmol·mol-1和200nmol·mol-1分别有147,1450和1799个差异表

6、达基因,在15d时,80nmol·mol-1,160nmol·mol-1和20nmol·mol-1分别有50,1587和2100个差异表达基因,在20d时,80nmol·mol-1,160nmol·mol-1和200nmol·mol-1分别有1261,1592和1633个差异表达基因,表明在相同天数下臭氧浓度越高响应的DEGs数量越多。4.在处理过程中,80nmol·mol-1,160nmol·mol-1和200nmol·mol-1浓度下的差异基因分别显著富集在22,41和53个功能分类上,响应刺激,催化活性,氧结合,细胞壁等功能分类中的基因显著上调,光合作用,类囊体等功能分

7、类中的基因显著下调,80nmol·mol-1浓度臭氧在20d时显著富集在光合作用,响应刺激,细胞壁等分类上,60nmol·mol-1和200nmol·mol-1浓度臭氧在10d,15d和20d时都显著富集在光合作用,响应刺激,细胞壁等功能分类上。5.80nmol·mol-1浓度的臭氧在10d,15d和20d时分别调控了6,4和8个MYB转录因子和2,1和9个WRKY转录因子;160nmol·mol-1浓度的臭氧在10d,15d和20d时分别调控了17,14和9个MYB转录因子和8,13和9个WRKY转录

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