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《全基因组分析peg胁迫下水稻根系转录因子表达变化》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在教育资源-天天文库。
1、作物学报ACTAAGRONOMICASINICA2009,35(6):1030−1037http://www.chinacrops.org/zwxb/ISSN0496-3490;CODENTSHPA9E-mail:xbzw@chinajournal.net.cnDOI:10.3724/SP.J.1006.2009.01030全基因组分析PEG胁迫下水稻根系转录因子表达变化1,22211,马廷臣陈荣军余蓉蓉曾汉来张端品12华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室,湖北武汉430070;中国科学院亚热带农业生态研究所,湖南长沙410125摘要:转录因子在植
2、物抗逆境中起重要的调节作用。本文使用Affymetrix水稻60K芯片全基因组研究PEG胁迫时2个耐旱性不同的水稻品种的转录因子及转录因子家族的变化,结果表明,在PEG胁迫下,耐旱品种湘丰早119根系共有95个转录因子转录本与对照处理比较表达发生变化(24个为转录水平下调表达,71个为转录水平上调表达);干旱敏感品种爱华5号根系有129个转录因子转录本表达发生变化(转录水平上调的转录因子转录本60个,转录水平下调的转录因子转录本69个);2个品种PEG胁迫响应转录因子隶属的转录因子家族都为30个,但各转录因子所属的30个家族并不完全相同;PEG胁迫逆
3、境中,PEG胁迫响应转录因子转录本表现出品种特异性,湘丰早119有72个为特异响应转录本,爱华5号有106个特异响应的转录因子转录本;2个品种在干旱胁迫下响应的转录因子有23个为重叠转录本,其中有16个在转录水平上调表达,7个在转录水平下调表达;2个品种的PEG胁迫响应转录因子基因在染色体上的分布不同,重叠转录因子基因主要位于第2染色体0.432~26.139Mb和第5染色体0.076~20.597Mb之间。关键词:水稻;根系;基因芯片;转录因子;耐旱性差异GlobalGenomeExpressionAnalysisofTranscriptionFa
4、ctorsunderPEGOs-moticStressinRiceRootSystem1,22211,MATing-Chen,CHENRong-Jun,YURong-Rong,ZENGHan-Lai,andZHANGDuan-Pin12NationalKeyLaboratoryofCropGeneticImprovement,HuazhongAgriculturalUniversity,Wuhan430070,China;InstituteofSubtropicalAgri-culture,ChineseAcademyofSciences,Chang
5、sha410125,ChinaAbstract:Transcriptionfactorsplayanimportantroleinplantstresstolerance.TheAffymetrixricegenomearrayswereusedtostudytheexpressionchangeoftranscriptionfactorsandtheirfamiliesintworicecultivarswithdifferentlevelsofdroughttoler-anceunderPEGosmoticstress.Atotalof95tra
6、nscriptsencodingtranscriptionfactors(24transcriptsweredown-regulatedand71transcriptswereup-regulatedatthetranscriptionlevel)inXiangfengzao119and129transcripts(69transcriptsweredown-regulatedand60transcriptswereup-regulatedatthetranscriptionlevel)inAihua5wereaffectedbyPEGosmotic
7、stress.TranscriptionfactorstranscriptsinresponsetoPEGosmoticstressesbelongedto30transcriptionfactorsfamiliesforeachoftwocultivars,buttherewasadifferencebetweenthetwo30families.Thetranscriptionfactorstranscriptsforexpressedcultivarspe-cific-responsetoPEGosmoticstress,with72trans
8、criptsforXiangfengzao119and106forAihua5.Therewasanover
