甜菜nii基因编码氨基酸偏好及与菠菜nii编码蛋白序列的比较

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时间:2018-04-16

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1、中国糖料20-1537(4)13试验研究,,:i_doi0.3570/.cnk.scc.205.04.00:11i11j?甜菜n/i基因编码氨基酸偏好及与菠菜nii编码蛋白序列的比较石晓艳u1.珠海市斗门生态农业园管理委员会农业科技推广中心珠海5191002.东北农业大学农学院哈尔滨150030(,;,)摘要-方法从二倍体甜菜T获得与亚硝酸还原反应相关的cDNA基因片段运用:采用RTPCR7中y,RACE技术获得了基因全长序列并命名为nii基因。该基因全长2014b〇RF长度1800b编码599个

2、,p,p,氨基酸。该基因编码氨基酸残基具有亮氨酸和缬氨酸偏好,编码蛋白结构域与菠菜的高度同源。该基因的获得可为下一步基因的表达与调控研究奠定基础。关键词:甜菜^基因氨基酸偏好序列比较;;;566---.378文献标识码中图分类号:S:A文章编号:10072624201504000103;Q()铵态氮和硝态氮是植物生长所必需的氮源甜菜的主要氮源为铵盐和硝酸盐。无机氮素以铵的形态参与,代谢态的氮源被植物吸收后大都是先由植物将其转化成NH/可被甜菜直接利用合成氨基酸。甜菜,非铵,才必须在体内经过还原才能合成有

3、机含氮化合物+一根系吸收的硝酸盐。硝酸盐还原为NH,4,般分两步,先由硝酸还原酶(NR)还原成亚硝酸盐,再由亚硝酸还原酶(NiR)还原为NH/。-】2[甜菜亚确酸还原酶至少巳在拟南芥](NiR)由raii基因编码至目前AroJiWosis认a/iarea,截,(p)、烟草4__p5S78]玉米L[|[】稻p】NicotianatabacumL.)Z?amas.菜(Sinaciaoleracea1^(072?salivaL.碗■&(、(y)、菠p)、水7)、10"[1B[】PisumsativumL.

4、)白菜rassicacamesirisL.等高等植物中克隆获得了raii基因全长序列。本研究以二(、)(p倍体甜菜Ty7为试材,克隆获得甜菜nii基因,为后续的基因表达与调控研究奠定了基础。1材料和方法供试品种:甜菜品种为二倍体纯系品种甜研7号(Ty7),种子由哈尔滨工业大学甜菜糖业研究所提供。将甜菜种子在室温下浸种过夜,置于培养皿中251恒温催芽至少24h,然后移至营养钵中室内培养,光照约 ̄对真叶时就可用于试验18001x温度约为25T。待幼苗长到24用前4h向营养钵中浇灌30mmOl/L,。,的KN

5、03溶液,进行氮光共同诱导培养,然后用于分子生物学操作。根据GenBank上已知的甜菜nii的DNA部分序列(AF173663)与已知同属藜科的菠菜niimRNA(X07568)序列进行比对后,使用PrimerPremier5.0软件设计引物,在保守区设计上游及下游引物,进行两端未知区域的扩增。引物由上海生工公司和Invitrogen公司完成。设计的引物如表1。表1试验中采用的引物及序列长度/bpTrnTCGC/%3-RACEadaptor含有由TaKaRa独特设计的dT区域及Adaptor

6、Primer部分-''3-RACE--23outerrimerSTACCGTCGTrCCACTAGTGATTTSp'',,3-RACE-^TCACTATAGG-innerrimer5CGCGG^TCCTCCACTAGTGA332p_’--2358SPouter5TCTATGGGACTGGAAATCGGAAT3.3943.48''--SP2358.innerSAGATGGGAGATTTATGATGAGGCS3943.48''_5-RACE--outerrimer5CATGGCT

7、ACATGCTGACAGCCTA323p'''5-RACE--innerrimerSCGCGGATCCACAGCCTACTGATGATCAGTCGATGa34p'-GATCCAGTCCCATAGA-AP..outer5TTCCTTy2258214545''-AP-innerSCTTACAATGATGTTTGCGACGGB2258.2145.45'SP1L-SSAGTGAACTTGCTTCTTTATCTATGG2557.0636.00''APIS-TGCGAAATAAGGTT

8、GGTAAAAGGGC-a2560.3444.00RNA的提取参照TrizolInvitroen的说明书进行。取lxLRNA样品与5xL6xLoadinBuffer混合后于),(g||g1%的琼脂糖

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