家蚕黑缟基因_p_s_的精细定位及色素合成相关基因分析

家蚕黑缟基因_p_s_的精细定位及色素合成相关基因分析

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1、ScienceofSericulture蚕业科学2014,40(5):0811-0817ISSN0257-4799;CN32-1115/SE-mail:CYKE@chinajournal.net.cnS家蚕黑缟基因(p)的精细定位及色素合成相关基因分析1111,21,21,2刘丽丽刘晓晓余俊杰张业顺夏定国张国政12(江苏科技大学,江苏镇江212003;中国农业科学院蚕业研究所,农业部蚕桑遗传改良重点实验室,江苏镇江212018)pS摘要p-复等位基因位于家蚕第2连锁群,普通斑纹(+)与黑缟斑纹(p)基因均属其中。采用

2、分子标记和HRM结合的基因型分析技术对家蚕黑缟基因进行精细定位,通过RNA-Seq差异表达基因分析筛查与色素合成相关的基因。以幼虫斑纹为SSpp黑缟(p/p)的品系为母本,普通斑(+/+)的品系p50为父本和回交亲本,经杂交及连续多次回交构建BC7M分离群体,以S其中的585头黑缟斑纹个体作为定位群体,PCR扩增筛选具有HRM多态性的SSR分子标记,并进行基因型定位分析,将p基S因精细定位于家蚕第2连锁群nscaf2623:97113~222422之间,p基因与相邻的2个标记S2623-97和S2623-222之间的

3、遗传距离分别为0cM、0.3cM。用p50继续回交得到BC8,对黑缟斑与普通斑表型个体的幼虫在3眠期每隔2h分别解剖获取体壁组织,利用RNA-Seq高通量测序技术,在不同斑纹表型个体的样本间筛选出60个显著差异表达基因,对其中与色素合成相关基因的分析表明,黑缟斑纹形成主要是通过加快酪氨酸向多巴的转化速度来实现黑色素的合成。关键词家蚕斑纹;黑缟基因;精细定位;RNA-Seq测序;差异表达基因中图分类号S881.2文献标识码A文章编号0257-4799(2014)05-0811-07DOI:10.13441/j.cnki

4、.cykx.2014.05.008SFineMappingofBombyxmoriStripeGene(p)andExpressionAnalysisofPig-mentSynthesisRelatedGenes1111,21,21,2*LIULi-LiLIUXiao-XiaoYUJun-JieZHANGYe-ShunXIADing-GuoZHANGGuo-Zheng12(JiangsuUniversityofScienceandTechnology,ZhenjiangJiangsu212003,China;TheK

5、eyLaboratoryofGeneticIm-provementofSilkwormandMulberry,MinistryofAgriculture,TheSericulturalResearchInstitute,ChineseAcademyofAgriculturalSciences,ZhenjiangJiangsu212018,China)Abstractp-multipleallelesarelocatedonthe2ndlinkagegroupofsilkworm(Bombyxmori).Bothnor

6、malmarkingpSS(+)andstripedmarking(p)genesareinsideit.Inthisstudy,molecularmappingofsilkwormpgenewasconduc-tedbyemployinggenotypeanalysistechnologyinvolvingboththemolecularmarkersandtheHRMtechnique,andgenesrelatedtopigmentsynthesiswereanalyzedbyRNA-Seqsequencing

7、technology.ByusingthesilkwormvarietyofwhichSSlarvaehavestripedmarking(p/p)asfemaleparentandthesilkwormvarietyp50ofwhichlarvaehavenormalmarkingpp(+/+)asmaleparent,crossingandconsecutiveback-crossingswereconductedtoestablishtheBC7Msegregationpopulation.585larvaew

8、ithstripedmarkingwereusedasmappingpopulation.PCRamplificationwasconductedtoSscreenSSRmolecularmarkerswithHRMpolymorphism.Aftergenotypeanalysis,thepgenewaslocatedonSnscaf2623

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