塔乌库姆冰草肌动蛋白基因片段的克隆及序列分析

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1、6GRASSLANDANDTURF(2014)Vol.34No.5塔乌库姆冰草肌动蛋白基因片段的克隆及序列分析李莉1,贾纳提1,张金林2(1.新疆畜牧科学院草业研究所,新疆乌鲁木齐830000;2.兰州大学草地农业科技学院,甘肃兰州730020)摘要:根据其他植物Actin基因的保守序列设计一对简引并性物,以塔乌库姆冰草叶片总RNA为模板,采用RT-PCR的方法扩增出Actin基因片段并连接到载体上,阳性克隆经PCR检测后进行测序。结果表明:该片段长约600bp,编码199个氨基酸,所得序列与GenBank中注册的其他植物Actin基因序列同源性均在

2、81%以上,与其他肌动蛋白的氨基酸序列同源性达88%。关键词:塔乌库姆冰草;肌动蛋白;基因克隆;序列分析中图分类号:S54;Q344.13文献标识码:A文章编号:1009-5500(2014)05-0006-05DOI:10.13817/j.cnki.cyycp.2014.05.002肌动蛋白是真核生物中普遍存在的重要的蛋白bidopsisthaliana)、小花碱茅(Puccinelliatenuiflo-质,是构成细胞骨架和肌肉肌小节的主要成分,执行着ra)、烟草(Nicotianatabacum)和向日葵(Helianthus重要的生理功能,如

3、细胞分裂、细胞运动、细胞形状变annuns)等中克隆到了Actin基因。化、内吞作用、胞吐作用以及多种细胞运动,如顶端生塔乌库姆冰草(Agropyroncristatumcv.Tawu-[1-4]长、细胞器运动、胞质环流、花粉管生长等。高等kumu)具有极强的抗旱性、抗寒性和适度的耐盐性,且动植物中,肌动蛋白都是由多基因编码。不同生物肌具有品质优良、营养丰富、饲用价值高等优良特[12-14]动蛋白具有高度保守性,这些基因高度相似,通过多轮性。目前,由于草原的过度开发和利用而造成草复制由一个基因祖先进化而来[5]。Actin基因在各种地严重退化,利用旱

4、生牧草冰草来有效的改善草地生组织中恒定表达,是一种广泛参与真核细胞生理过程态,恢复和重建退化草原植被,增加饲草产量,减缓我的管家基因,因而常被作为研究其他基因的表达模式国饲料的不足,还可大大提高盐碱地的利用率,为发展及调控机制的分子内标[6]。迄今为止,已在许多高等畜牧业奠定物质基础。以塔乌库姆冰草为材料,克隆植物,如霸王(Zygophyllumxanthoxylum)[7]、碱蓬Actin基因片段,为研究其他重要抗逆功能基因在冰[8]草中的表达和调控机制奠定基础。(Suaedaglauca)、微孔草(Microulasikkimen-[9][10]

5、sis)、党参(Codonopsispilosula)、水稻(Oryza1材料和方法sativa)、玉米(Zeamays)、小麦(Triticumaestivum)、1.1试验材料玉兰(Magnoliadenudate)、花生(Arachishy-[11]塔乌库姆冰草种子来自新疆畜牧科学院草业研究pogaea)、大豆(GlycinemaxMerr.)、拟南芥(Ara-所。Hoagland营养液水培法培养冰草幼苗至三叶一心期采集叶片,用于总RNA的提取。收稿日期:2014-04-16;修回日期:2014-05-131.2试验试剂基金项目:农业科技成果转

6、化资金项目(2011GB2G总RNA抽提试剂盒、MMLV第1链cDNA合成400015)资助试剂盒、PCR扩增试剂盒、DNA凝胶回收试剂盒、作者简介:李莉(1977-),女,甘肃人,助理研究员,硕士,主要从事牧草遗传育种研究工作。PCR产物克隆试剂盒和DNAmarker均购自上海生E-mail:xjndlili@126.com工生物有限公司,其他生化试剂均为进口或国产分析贾纳提为通讯作者。纯产品。第34卷第5期草原与草坪2014年71.3引物设计与合成从NCBI搜索其他植物的Actin基因序列,进行同源性比较,利用DNAMAN和Primer5.0生物

7、软件设计一对简并引物(A1:5′-GTGGTCGTACAACWGGTATTGTG-3';A2:5′-GCHCCTCCAATCCAGACACTG-3′;其中W=A、T,H=A、C、T),用于扩增塔乌库姆冰草Actin基因片段。设计的引物由上海生工生物有限公司合成。1.4总RNA的提取图1RT-PCR产物凝胶电泳冰草幼苗总RNA提取方法按照试剂盒说明书进Fig.1AgarosegelelectrophoresisofPCR行。采用甲醛变性凝胶电泳方法检测提取到的总productofActingeneRNA,根据OD值鉴定所提RNA的纯度(若D260nm/

8、注:M.1400bpDNAmarker;1.Actin基因的PCR产物D280nm的比值在1.8~2.0,则

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