生物科学专业毕业论文28359

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1、本科生毕业设计(论文)中文题目 应用SSAP技术分析渐渗系后代多样性研究 外文题目               学  院    生命科学学院     专  业    生物科学      SSAP分子标记是Waugh等(1997)首先在大麦上开发的一种基于逆转座子LTR序列的锚定AFLP技术,用于检测逆转座子插入位点与邻近限制性内切酶位点之间的DNA多态性,是目前应用最广泛的基于逆转座子元件的分子标记;与AFLP相比,SSAP分子标记具有数量多、全基因组分布和多态性高等优点。生物和非生物胁迫对所有

2、机体都可能形成巨大的进化动力,为了生存,植物体必须依靠自身的耐受、抗性和逃避的技能,形成复杂的代谢反应来应对和存活;而胁迫诱导基因组的反应包括反转录转座子的活性、转座和基因组结构的变异。因此,基于逆转座子的SSAP分子标记能更好地反应因环境或其它因子的改变而引起的遗传多样性差异。SSAP除了用来构建高密度的遗传连锁图谱外,SSAP分子标记还已被成功用于龙舌兰、蚕豆、大麦、紫花豌豆、首蓓、西红柿、辣椒、柑橘、苹果、等物种的遗传多样性分析,但至今尚无基于Ty1-copia类逆转座子的SSAP分子标记

3、在东乡野生稻渐渗系上的应用。东乡野生稻是全球分布最北的国家二级保护野生植物,素有“植物大熊猫”之称,蕴藏着高产、强耐冷、抗旱、抗多种病虫等大量有利基因以及与栽培稻起源、进化有关的信息。此前,众多育种工作者获得了东乡野生稻与不同基因型栽培稻的种间杂种F1,通过连续回交自交建立了一些高代重组自交系,并对一些重要农艺性状的遗传及生理学特性作了大量研究,如耐旱特性的鉴定、高产、耐冷以及茎杆木质化等性状相关基因的QTL分析。然而,目前利用东乡野生稻成功改良栽培稻数量性状的报道仍很少。这一方面是由于野生种中

4、的不良连锁基因和不利农艺性状的存在,加上所有平衡群体中野生种中不利基因高频的出现、基因互作的增加、微效多基因效应被掩盖等缺点,限制了野生种有利基因的发掘和利用。另一方面,在外源基因渐渗过程中,受体植物的各世代会出现广泛的遗传和表观遗传(Epigenetic)变化,在基因组和表型上明显表现出多种不稳定现象,亲本序列的丢失(Sequenceelimination)或新序列的出现、基因沉默(Genesilencing)或基因激活(Geneacti-vation)以及DNA甲基化模式改变和转座子或逆转座

5、子激活等。这些遗传与表观遗传变化在一定程度上导致种间杂种后代疯狂分离,很难在短时间内稳定、纯合,很大程度上阻碍了野生有利基因在实际育种中的充分利用。针对以上制约野生稻优异基因发掘与利用的瓶颈问题,笔者利用江西省水稻生理及遗传重点实验室已构建好的东乡野生稻-栽培稻渐渗系为材料进行SSAP分析,研究渐渗系后代多样性,为探索和揭示东乡野生稻渐渗诱发栽培稻遗传与表观遗传变异机制奠定基础,为有效的挖掘与利用东乡野生稻有利基因提供有用的信息。X1材料与方法1.1供试材料江西东乡野生稻(O.rufipogon

6、Griff.,以下简称“东野”),栽培稻协青早B(O.sativasp.indicaKato.,简称“协B”),18个渐渗系后代,以及27个国外水稻品种(表1-1)。表1-1水稻居群Table1-1population居群1XBpopulation1居群2DWRpopulation2居群3IL5335IL5243IL16IL58IL116IL126population3IL149IL183IL159IL18IL40IL223IL5339IL5IL12IL33IL82IL75居群4空育131哈04

7、密阳46金23Bpopulation4珍汕97B南京6号台农1号测64桂99谷梅4号日本晴TP309稻花香居群5K12trenassewellsBengalpopulation5LemontR152428cocodrieRonoloKatydellatemphetonfrancisdellrose1.2实验方法1.2.1模板DNA的制备X选择新鲜幼嫩叶片,用液氮保存,按照Murray和Thompson(1980)的方法提取总DNA,并稍作改动,详细步骤如下:1)将叶片放入预冷的研钵中,液氮研磨至

8、粉末状后,装入2mL预冷的离心管中,立刻加入预热(65℃)的CTAB裂解液(100mMTris-HCl,pH8.0;1.4MNaCl;20mMEDTA,pH8.0;2%CTAB;1%β-巯基乙醇),混匀后65℃水浴1h,每隔15min颠倒混匀一次。2)待温度降至室温以后,加入等体积的氯仿/异戊醇(24/1),上下颠倒混匀,室温静置5min,11,000rpm25℃下离心10min。3)取上清液于新的离心管中,加入等体积的酚/氯仿/异戊醇(25/24/1),上下颠倒混匀,静置5min,11,000

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