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时间:2018-03-15
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1、疾病基因组学医学相关问题结构基因组学功能基因组学蛋白质组学基因组计划的应用疾病基因组学疾病的分子机制疾病的分子诊断疾病的分子治疗疾病的分子机制病原、病理和预后疾病的易感性遗传与环境的影响分子诊断:疾病的预测,药物耐受性,疾病的分型。分子治疗:药物靶,基因治疗分子诊断病原体检测疾病相关基因的鉴定、克隆药物的敏感性、耐受性分子治疗—药物基因组学基因靶标与药物开发个性化治疗分子诊断技术--病原体检测病原体:引起疾病的微生物和寄生虫的统称寄生性生物病毒、衣原体、立克次氏体、支原体、细菌、螺旋体、真菌、寄生虫正常微生物群、条件致病微生物IgnazSemmelweisIgnazSemmelweis18
2、18—1865匈牙利医学家母亲的救星发现了产褥热的病因,并采用防腐剂进行预防,取得显著效果产褥热主要病原菌:葡萄球菌,链球菌,大肠杆菌,肺炎双球菌感染人的微生物超过400种,人一生可能受到150种以上的病原体感染口、鼻、咽、消化道、泌尿生殖道、皮肤自身免疫力病原体致病性的强弱侵入数量大肠杆菌.禽流感病毒(H5N1)avianinfluenzaAvirus单链RNA病毒8节段-ssRNA血凝素(HA)神经氨酸酶(N)人类免疫缺陷病毒(HIV)(humanImmunodeficiencyvirus)逆转录病毒(单链RNA病毒)RNA乙型肝炎病毒(HBV)聚合酶HBsAgHBcAg开环部分双链DN
3、A病毒乙型肝炎流行病学HBsAgEpidemicity8%andabove=High2%-8%=IntermediateBelow2%=Low乙肝病毒分型及YMDD突变临床检测乙型病毒肝炎--由乙型肝炎病毒所引起的肝脏炎型损害,全球约有3.5亿乙肝病毒携带者,我国有60%的人群感染过乙肝病毒(HBV),其中乙肝病毒携带者占总人口的10%HBV10个亚型国际公认的慢性乙肝抗病毒治疗药物:干扰素和核苷类药物,拉米夫定YMDD突变Met-----ATGYMDDVal------GTGYVDDIle-------ATTATCYIDDATA突变影响了与拉米夫定的结合,造成HBV对拉米夫定敏感性下降。拉
4、米夫定治疗HBV感染治疗过程与YMDD变异关系治疗过程研究例数(例)无变异(YMDD)变异治疗前139106(76%)33(24%)9个月3733(89%)4(11%)12个月3725(67.5%)12(32.4%)18个月167(43.7%)9(56.3%)24个月124(33.3%)8(66.7%)引自JVirol.Metods1999;83:181-187基因多位点检测系统检测出野生毒株中共存的低滴定度拉米夫定耐药病毒株及时改变用药--阿地福韦,减少有耐药性的病毒株引起症状恶化back人类疾病大致分为三类:(一)单基因病(二)多基因病(三)获得性基因病基因病:以基因组学为基础,从疾病
5、和健康的角度考虑,人类疾病大多直接或间接地与基因相关。分子诊断技术--疾病相关基因的鉴定疾病相关基因的鉴定与克隆(一)检测人类基因变异或突变(二)疾病时基因组差异表达分析(三)染色体制图定位及疾病相关基因克隆取受检者血液、口腔黏膜或其它细胞样品提取DNA、PCR扩增待测基因片段确定待测基因的基因型基因测序SNP分型凝胶电泳预测相应疾病的患病风险,分析不同药物体内代谢强弱(一)检测人类基因变异或突变单链构象多态性(SSCP)限制性片段长度多态性(RFLP)变性梯度电泳(DGGE)单核苷酸多态性(SNPs)等位型1等位型2单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphi
6、sm,SNP)在人类两个个体之间大约每500—1000bp就有一个碱基差异,如果一个碱基位置发生的变异在0.1%以上的人群存在,这个位点就被定义为SNP位点。寡核苷酸杂交分析SNP和等位基因特异寡核苷酸杂交(二)疾病时基因组差异表达分析某一疾病或综合征基因组与正常基因组表达差异的比较。DNA芯片检测的差异表达谱(三)染色体制图定位及疾病相关基因克隆疾病基因定位:染色体原位杂交、染色体畸形分析、连锁分析疾病相关基因的克隆:已掌握疾病相关基因或及其产物的确切信息已掌握与疾病可能相关的基因预测资料对疾病相关基因毫无所知疾病相关基因克隆策略:功能基因克隆候选基因克隆定位基因克隆定位-候选基因克隆b
7、ack通过基因易感性的分析,确认特定疾病的好发性人群,对该人群进行生活或饮食方式的干预,促进其健康。通过对药物代谢相关基因的SNP检测,阐明不同患者间药物代谢及药效差别的遗传基础,根据不同患者的遗传背景施以优化治疗方案美国:药物副作用而入院的患者达200万人,因药物副作用而死亡的人数达10万人,占死亡原因的第4位心脑血管疾病相关易感基因位点检测高发病率、高死亡率、高致残率、高复发率,发病率和死亡率高居首位,3
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