分子诊断学整理【江大京江版】

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1、原核生物基因组原核生物主要包括、细菌、支原体、立克次体、衣原体、螺旋体、放线菌、蓝绿藻等 有关质粒按质粒的功能分类:致育质粒      F质粒)编码性菌毛,介导细菌之间的接合传递;耐药性质粒    R质粒)  编码细菌对抗菌药物或重金属盐类的耐药性;毒力质粒      Vi质粒)编码与该菌致病性有关的毒力因子;细菌素质粒            编码细菌产生细菌素;代谢质粒              编码产生相关的代谢酶。按复制机制分类:1、严紧控制型拷贝数少,一般<10个,分子量大; 调节因子是蛋白质,复制受限,受染色体DNA

2、复制系统的控制; 严谨控制机理(低拷贝原因),认为是该质粒可以产生阻遏蛋白,反馈抑制自身DNA合成。2、松弛控制型拷贝数多,10-200个,分子量小;调节因子是RNA,复制不受染色体DNA复制系统限制基因工程使用松弛型(高拷贝数)质粒,以获得较多的基因产物。性质:1、转移性:可以通过转化、转导或接合作用而由一个细菌细胞转移到另一个细菌细胞中,使两个细胞都成为带有质粒的细胞;质粒转移时,它可以单独转移,也可以携带着染色体(片段)一起进行转移,所以它可成为基因工程的载体。2、质粒具有选择性标记:质粒有抗药性基因、营养缺陷型基因、抗

3、重金属盐基因等多种选择性标记;3、质粒的不相容性:同一类群的不同质粒一般不能在同一菌株内稳定共存;4、自主复制性:能独立于宿主染色体DNA外独立复制(但也必须在宿主细胞内才能复制);质粒已成为分子克隆的有用工具,是目的DNA的载体。载体质粒大多是在天然质粒基础上经人工构建而成,质粒的一些特点:1、有限制性核酸内切酶单一切口,可用以重组外源DNA;2、有筛选标记,如抗药基因等;3、插入外源DNA后,仍能转化宿主细胞,并能复制。质粒基因转移的方式:  1、接合作用  当细胞与细胞、或细菌通过菌毛相互接触时,质粒DNA从一个细胞(细

4、菌)转移至另一细胞(细菌)的DNA转移称为接合作用2、转化作用  通过自动获取或人为地供给外源DNA,使细胞或培养的受体细胞获得新的遗传表型,称为转化作用3、转导作用 当病毒从被感染的(供体)细胞释放出来、再次感染另一(受体)细胞时,发生在供体细胞与受体细胞之间的DNA转移及基因重组即为转导作用4、转染作用  通过感染方式将外来DNA引入宿主细胞,并导致宿主细胞遗传性状改变的过程称为转染(transfection)。转染是转化的一种特殊形式。   病毒基因组完整的病毒颗粒包括:衣壳、基因组(DNA或RNA)、被膜、病毒颗粒中的

5、其他内容物 病毒分段基因组:流感病毒属分段RNA病毒意义:a)降低包装压力b)降低了造成断裂的可能性,提高编码能力 c)有分段基因组的病毒一般感染效率较低,只有全部基因组核酸片段存在时,病毒才具有感染能力。植物病毒d)由于分段基因组易发生重组,故病毒容易变异。 病毒基因组特点:1、5‘的帽子和3’的poly(A)尾结构2、末端重复序列结果:粘性末段、正/反向互补序列、长末端重复序列;3、高效基因组:排列紧密很少间隔区,不仅非编码序列少,而且有重叠基因的存在;4、分段基因组:易重组,是病毒易变异的原因。   真核生物基因组染色体

6、的包装:(1)染色体的一级结构—核小体(2)染色体的二级结构—螺线管(3)染色体的三级结构—超螺线管(4)染色体的四级结构—染色单体 真核生物染色体基因组一般特征1、真核生物的基因组比较庞大;2、线性双链DNA和二倍体;3、真核细胞基因转录产物为单顺反子。4、存在重复序列,重复次数可达百万次以上5、基因是不连续的(断裂基因) 重复序列:指多拷贝的相同或近似序列的DNA片段一、高度重复序列,按其结构特点分为三种:1、反向重复序列2、卫星DNA由于这类序列的碱基组成不同于其他部份,可用等密度梯度离心法将其与主体DNA分开,因而称为

7、卫星DNA(或随体DNA)3、较复杂的重复单位组成的重复顺序二、中度重复顺序:依据重复顺序的长度,中度重复顺序可分为:短散布元件和长散布元件  Alu家族:是哺乳动物基因组中含量最丰富的一种中度重复顺序家族(短分散元件),Alu家族每个成员的长度约300bp,每个单位长度中有一个限制性内切酶AluⅠ的切点(AG↓CT),Alu可将其切成长130和170bp的两段,因而定名为Alu序列(或Alu家族) 线粒体DNA的遗传特性:母系遗传、突变率高、异质性、阈值效应、半自助复制与协同效应阈值效应:mtDNA突变导致氧化磷酸化水平降低

8、,当突变的mtDNA达到一定比例时,使得线粒体总的能量供应降低到维持组织正常功能所需能量的最低值时,才可能引起某组织或器官的功能异常而出现临床症状。 DNA分子多态性的主要方式 :微卫星DNA多态性(同一位点不同个体之间有不同长度的微卫星DNA,STR)、单个核苷酸的变异—单

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