单条线虫dna提取方法

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1、2011年第2期植物检疫PLANTQUARANTINE单条线虫DNA提取方法Vol.25No.2王江岭1张建成2顾建锋1*(1.宁波出入境检验检疫局技术中心浙江宁波315012;2.嘉兴出入境检验检疫局)MethodofextractDNAfromasinglenematode.WangJiangling1,ZhangJiancheng2,GuJianfeng1*(1.Ning-boEntry-exitInspectionandQuarantineBureau,Ningbo315012,China;2.Jia

2、xingEntry-exitInspectionandQuarantineBureau)AbstractTherearemanyproblemsinextractingDNAfromlargenumberofnematodes.Thenematodescouldbeamixedspecie.TheextractedDNAweredecreasinginexperimentprocess.Amplificationmightbecumberedbyaddingmoresolutes,andeventoeffectonthen

3、extexperiments.Inthismethodasinglenematodewasfreezedbyliquidnitrogenandheatedat85℃todisruptethestructureofnematodecellsbychangingthetemperaturesudden-ly.ThentheproteinsweredissolvedeasilybyproteinaseKandmoreDNAwereextracted.Thismethodwasprovedeffective,rapid,andsta

4、bilebykindsofnematodes.Theadvantagesofthismethodare:(1)PCRBufferattachedtoTaqenzymetaketheplaceofWLBandSDSlysisliquids,whichreducestheinstabilityofreactionsys-temandtheeffectofaddedsolutes.(2)AlltheprocessisfinishedinonePCRtube,noliquidtransportedandlesssolutesadde

5、d.SothepollutionandbadeffecttothelaterPCRprocessaregreatlyreduced.(3)Manualdis-ruptionofnematodeisreplacedbypoikilothermictreatment;pollutionisavoidedandnoexperimenttechniqueisrequired.ComparedwithtwootherproteinaseKmethodsofnematodeDNAextraction,thismethodwasprove

6、def-fectiveandstabile,andcouldbeusedinrapidtest;nematodeproteinsweredissolvedcompletelyandmoreDNAreleased,thePCRresultisgoodevenwhentheextractedDNAweredilutedfor32time,whichprocidesmoremo-lecularexperimentschances.Keywords摘要nematode;optimizedmethod;DNAextraction;p

7、roteinaseK;temperature大量线虫DNA的提取可能因线虫不纯而受到污染,溶液多次转移造成DNA损失,并且在提取过程中加入过多的溶质离子也可能对PCR扩增有干扰,从而影响下一步的研究。本研究用液氮快速冷冻单条线虫,继以85℃快速变温,用温度的剧烈变化使线虫裂解,再以蛋白酶K降解蛋白质,提高了获得的DNA的纯度和数量。通过多种线虫的验证试验表明,该方法高效、快速、稳定。该试验方法有如下优点:(1)使用Taq酶附带的PCRBuffer代替WLB裂解液和SDS裂解液,减少了配置的不确定性和外来离子的影响。(2)整个

8、提取过程在一个PCR管中完成,并可直接用于PCR扩增,没有溶液的转移和过多的溶质添加,减少污染和对后续PCR的影响。(3)使用变温处理代替其他手工破碎方法,减少了外界污染物的掺入,不需要手工操作技巧。与另外2种提取线虫DNA的蛋白酶K方法相比,本研究提取单条线虫DNA的时间短,效率高,PC

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