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时间:2018-01-28
《实时荧光定量rt-pcr实验流程》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在应用文档-天天文库。
1、实时荧光定量反转录PCRReal-TimeReverseTranscriptionPCR(RT-PCR)1材料1.1仪器756型紫外分光光度计国产上海ABI7300Real-TimePCRSystem美国ABI公司RS-28高速低温离心机德国贺利氏公司超低温冰箱德国贺利氏公司UVP凝胶扫描系统美国UVP公司微量移液器德国Gilson公司DYZ-22A型双恒定时电泳仪北京市六一仪器厂DYY-Ⅲ桥式电泳仪北京市六一仪器厂1.2试剂RNA提取试剂TrizolReagent为Invitrogen公司产品;逆转录酶(M-MLV),核糖核酸酶抑制剂(RNasin),dNTP,TaqDNA聚合酶(T
2、aqDNApolymerase),随机引物(Randomprimers),琼脂糖(agarose)均为美国Promega公司产品;荧光定量试剂盒:HotStartFluorescentPCRCoreReagentKits(SYBRGreenI),BBI公司RNA提取:取约100mg组织于冰浴匀浆器中,加入1mlTrizol(Invitrogen,USA),迅速研磨成匀浆液,加入200ml氯仿,震荡30S,冰上放置5min。4℃,12000rpm,离心10min,取上层水相转移至另一1.5ml离心管中,加入等体积的异丙醇,颠倒混匀,-20℃静置2h。然后4℃,12000rpm,离心20m
3、in,弃上清,加入1ml75%乙醇,轻轻混匀,4℃,12000rpm,离心10min,吸净上清液,于室温下晾干,加入20mlDEPC处理的去离子水溶解沉淀,-80℃保存备用。反转录(RT):(试剂盒:Promega,USA)反转录反应液组成如下表:Table1MixedcomponentsforsynthesisofcDNAfirstchainComponentVolume(ml)Concentration5×R.T.buffer*51×dNTP2.510mM/mlRNasin220U/mlRNA5.38mgRandomPrimer10.1ug/mlM-MLV65U/mlNucleas
4、r-FreeWater3.2Total2542℃反转录50min,95℃5min灭活反转录酶。SyberGreen荧光定量PCR检测:(HotStartFluorescentPCRCoreReagentKits(SYBRGreenI),BBI)仪器型号:ABI7300Real-TimePCRSystem,美国ABI公司PCR反应液组成如下表:Table2MixedcomponentsforpolymerasechainreactionComponentVolume(ul)R.T.product12×MasterMix10Primer1+1H2O7Total20PCR热循环参数:96℃4
5、min,然后三步反应:94℃30S,58℃30s,72℃30s,进行40个循环,于每个循环的第三步即:72℃30s收集荧光信号。实时荧光定量PCR结果分析:扩增完毕后,进入结果分析界面,以GAPDH为内参照基因,与对照组相比,得到目的基因表达的相对定量值(RQ值),将RQ值用于统计分析。引物序列:GAPDH上游引物:5’-TGAACGGGAAGCTCACTGG-3’下游引物:3’-GCTTCACCACCTTCTTGATGTC-3’
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