镍柱纯化原理及方法

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时间:2018-01-21

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1、镍柱亲和层析亲和层析的原理:利用分子间存在特异性的相互作用,它们之间都能够进行专一而又可逆的结合,这种结合力就称为亲和力。常见具有专一性亲和力的生物分子对:酶:基质类似物,抑制剂,辅酶抗体:抗原,病毒,细胞细胞:细胞表面特异蛋白,外源凝集素核酸:互补碱基序列,组蛋白,核酸聚合酶激素或药物:受体,载体蛋白外源凝集素:多糖,糖蛋白,细胞表面受体,细胞文献将被固定在色谱基质上的分子称为配体,配体和基质是共价结合的,构成亲和层析的固定相,称为亲和吸附剂。配体以共价键结合到活化的基质上,构成固相载体。一般载体采用琼脂糖凝胶、葡聚糖凝照、聚丙烯酰胺凝胶和纤维素等

2、。咪唑环:是1,3二氮杂戊环,英文名是Imidazole,如果在第一位或第三位上的氮原子上去掉那个氢原子所剩余的部份,就叫咪唑基。就是咪唑上去掉一个和氮原子直接相连的氢原子后剩下的部分5组氨酸的性质:具有弱疏水性、咪唑环为弱电性。金属离子:Cu2+、Ni2+、Zn2+、Co2+等过渡金属离子可与N、S和O等供电原子产生配位键,因此可与蛋白质表面的组氨酸(His)的咪唑基、半胱氨酸(Cys)的巯基和色氨酸(Trp)的吲哚基发生亲和结合作用,其中以His的咪唑基的结合作用最强。过渡金属离子与咪唑基的结合强弱顺序是Cu2+>Ni2+>Zn2+≥Co2+。镍

3、离子:有六个螯合价位,通常将镍柱分为了Ni-NTA和Ni-IDA。Ni-NTA螯合了四价,剩余两价;而Ni-IDA螯合三价,剩余三价。因此Ni-IDAAgarose结合作用力要比Ni-NTAAgarose强,在同样条件下Ni-IDAAgarose的载量要比Ni-NTA高,而且洗脱杂质和目标蛋白所用的缓冲液中咪唑浓度更高;但Ni-NTA更稳定,耐受更强的还原剂,镍离子更不易脱落。因此需要根据不同的纯化条件选择纯化所需的镍柱,以达到纯化的最佳效果。基质:①不溶性的多孔网状结构,渗透性好;②物理和化学稳定性高,有较高的机械强度,使用寿命长;③抗微生物和酶的

4、侵蚀;④最好为粒径均一的球形粒子;⑤具有亲水性,无非特异性吸附;⑥含有可活化的反应基团,利于亲和配体的固定化。5例:琼脂糖凝胶微球的商品名为Sepharose,含糖浓度为2%、4%、6%时分别称为2B、4B、6B。Sepharose4B的结构比6B疏松,而吸附容量比2B大,所以4B应用最广。配基:是可以可逆结合特定分子或特定基团的分子,能够通过亲和色谱的方式进行纯化。配基的选择受到两种因素的影响:(1):配基与目标物的结合必须具有特异性和可逆。(2):必须具有化学修饰基团,使它吸附在基质上,并且不损害它的活性。间隔臂:目标蛋白质的结合位点位于分子中较

5、深的部位,如果将配基直接偶联到基质上,受到空间位阻的影响,配基不能到达目标蛋白的结合位点,因此与目标蛋白的结合能力低。于是在配基与基质之间插入一个间隔臂可以使结合更加容易。间隔臂使结合最大化的同时要避免非特异性结合。间隔臂的长度是关键,太短,无效;太长,发生非特异性结合。一般规则:偶联的分子量小于1000时使用间隔臂;当大分子量,则不一定要。二硫键:蛋白质的的二硫键在半胱氨酸残基的硫醇之间形成,包内蛋白离开细胞后,二硫键常以氧化状态存在。此键在蛋白质分子的立体结构形成上起着一定的重要作用。为了确定蛋白质的一级结构,首先必须将二硫键打开,使成为线状多肽

6、链。上样方式:(1)直接上样(2)间接上样洗脱方式:(1)pH值洗脱:pH的改变可以改变带电荷的配基基团和结合蛋白的离子化程度,使它们结合位点的亲和性降低。(降低pH的方法)(2)离子强度洗脱:(3)竞争性洗脱:(咪唑)再生:(1)先用强变性剂6M盐酸胍冲洗柱子(2)用水冲洗干净(3)0.2%SDS冲洗柱子(4)用水冲洗干净(5)50%乙醇冲洗柱子(6)用水冲洗干净(7)用100mMEDTA(50mMTris100mMEDTAPH8.0)冲洗柱子(8)用水冲洗干净(9)用100mM硫酸镍孵育柱子(10)20%乙醇中4℃保存5上清缓冲液及配方上清纯化缓

7、冲液配方LysisBuffer50mMTris-HCl;150mMNaCl;20mMImidazole;pH8.0;ElutionBuffer150mMTris-HCl;150mMNaCl;50mMImidazole;pH8.0;ElutionBuffer250mMTris-HCl;150mMNaCl;100mMImidazole;pH8.0;ElutionBuffer350mMTris-HCl;150mMNaCl;300mMImidazole;pH8.0;包涵体缓冲液及配方包涵体纯化缓冲液配方IBLysisBuffer120mMTris;150mM

8、NaCl;2mMEDTA;2mMDTT;1%TritonX-100;PH8.0;IBLysisBuffer2

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